Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A03
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  105315579

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
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          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   

This is table  51  of  325  ( 38900 repeats found )

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Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
15393218--15393286
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2
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3
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3
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26
15
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1.95
15415949--15416147
80
2.5
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220
24
26
15
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15421071--15421116
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2.3
20
88
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41
17
26
15
1.88
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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1.98
15431521--15431688
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1.8
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1.98
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2.0
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2.0
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18
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31
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26
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15450958--15451002
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2
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2.0
51
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2.0
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22
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2.2
28
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8
70
20
15
3
61
1.48
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
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Entropy
(0-2)
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22
0
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1.54
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
15578717--15578762
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20
32
25
1.98
15620720--15620750
15
2.0
16
93
6
55
0
51
16
32
1.44
15624747--15624775
14
2.1
14
100
0
58
37
0
13
48
1.43
15626317--15626389
29
2.5
29
77
4
76
32
39
2
24
1.70
15626336--15626378
22
2.0
22
90
9
70
25
46
2
25
1.65
15626415--15626594
7
24.6
7
68
10
65
46
27
1
24
1.62
15626485--15626524
15
2.7
14
84
7
53
47
35
0
17
1.48
15626482--15626539
22
2.6
22
77
0
62
46
31
0
22
1.52
15626554--15626605
14
3.7
14
78
0
59
48
25
1
25
1.62
15626707--15626774
29
2.3
30
75
14
70
29
4
4
61
1.35
15626873--15627155
41
6.9
41
88
1
383
29
19
22
29
1.98
15627243--15627334
39
2.3
40
80
12
100
26
20
20
32
1.97
15629438--15629466
14
2.1
14
100
0
58
27
6
31
34
1.83
15630890--15630915
2
13.0
2
100
0
52
50
0
0
50
1.00
15631762--15631856
10
10.4
9
71
17
56
65
1
1
32
1.07
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
15631780--15631836
8
6.6
8
75
15
51
66
0
1
31
1.02
15631814--15631859
20
2.2
21
84
3
67
73
2
0
23
0.94
15632214--15632278
31
2.1
31
88
0
94
38
9
21
30
1.85
15633486--15633529
14
3.2
14
83
3
54
40
0
2
56
1.11
15633980--15634022
15
2.6
16
82
14
52
60
0
2
37
1.10
15634151--15634216
29
2.4
27
80
7
69
43
0
7
48
1.31
15649843--15649886
4
11.0
4
85
0
61
25
4
0
70
1.06
15650038--15650104
8
8.5
8
76
12
50
28
4
1
65
1.21
15659129--15659171
3
14.3
3
100
0
86
67
0
32
0
0.91
15662603--15662921
69
4.5
69
74
13
274
52
15
9
23
1.72
15662745--15662928
70
2.6
70
81
7
214
53
15
9
21
1.70
15662598--15663073
213
2.2
212
85
3
670
50
14
10
24
1.74
15663029--15663105
39
2.0
39
84
0
100
54
7
11
25
1.63
15662745--15663073
69
4.7
69
71
11
229
51
13
10
24
1.74
15667539--15667626
33
2.7
33
90
0
140
20
11
38
29
1.87
15671389--15671441
23
2.4
22
76
20
56
9
18
1
69
1.25
15679038--15679077
20
2.0
21
85
5
55
40
32
0
27
1.57
15690684--15690779
43
2.3
42
85
3
129
22
15
26
35
1.94
15694393--15694446
28
2.0
28
85
3
74
42
5
1
50
1.36
15701947--15702134
93
2.0
93
98
0
367
31
12
22
33
1.92
15706583--15706646
15
4.3
15
80
7
76
57
17
12
12
1.64
15710590--15710678
45
2.0
45
84
0
115
32
25
15
25
1.96
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
15715451--15715606
78
2.0
78
97
0
294
41
12
20
25
1.87
15722398--15722515
59
2.0
59
89
0
182
28
28
9
33
1.88
15723657--15723686
5
6.0
5
100
0
60
80
0
0
20
0.72
15739056--15739210
43
3.6
42
81
2
184
28
25
16
29
1.97
15751522--15751669
63
2.3
63
81
12
174
23
28
16
31
1.96
15751578--15751706
68
1.9
68
82
6
163
24
28
15
31
1.96
15759084--15759315
40
5.8
41
84
4
294
24
21
28
25
1.99
15759084--15759335
120
2.1
120
91
2
409
24
21
27
26
1.99
15759084--15759315
80
2.9
80
88
1
331
24
21
28
25
1.99
15760723--15760827
48
2.2
48
85
1
138
29
26
14
29
1.95

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
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          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
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          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
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          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325