Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A03
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  105315579

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          321   322   323   324   325   

This is table  316  of  325  ( 38900 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
101704165--101704275
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54
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0
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1.93
101711042--101711285
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16
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21
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28
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2.0
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81
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0
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0.97
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2
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3
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101780385--101780551
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2.1
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14
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2.0
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1.17
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
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T
Entropy
(0-2)
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10
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32
0.90
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
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Score
A
C
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Entropy
(0-2)
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31
2.6
34
78
14
101
38
0
0
61
0.96
101927360--101927406
15
3.1
15
77
17
51
36
0
0
63
0.94
101942841--101942865
13
1.9
13
100
0
50
44
0
0
56
0.99
101944598--101944655
29
2.0
29
83
6
73
43
0
12
44
1.41
101945998--101946061
19
3.2
20
87
10
80
39
0
3
57
1.14
101946009--101946081
19
3.9
19
80
7
62
39
0
4
56
1.19
101960990--101961022
6
5.5
6
100
0
66
15
0
0
84
0.61
101962940--101962974
16
2.2
16
100
0
70
25
28
0
45
1.54
101962940--101962980
16
2.6
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0
55
24
31
0
43
1.54
101967992--101968055
33
1.9
33
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0
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1.78
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25
2.5
25
100
0
124
29
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29
1.97
101971947--101972208
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2.0
130
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497
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135
2.0
135
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0
517
37
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1.89
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166
2.0
168
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587
39
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16
27
1.90
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22
2.3
22
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6
59
41
23
1
33
1.66
101987810--101987842
16
2.1
16
100
0
66
33
12
0
54
1.37
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
101999905--101999944
21
1.9
21
89
0
62
12
35
7
45
1.70
101999915--101999943
15
1.9
15
100
0
58
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44
1.71
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4.2
6
100
0
50
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0
0
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22
1.9
22
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0
57
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4
0
33
1.17
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18
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10
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5
1
38
1.33
102012897--102012927
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1.9
16
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0
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0
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0
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100
0
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0
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2.0
20
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0
5
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1.17
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7
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0
90
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29
2.5
28
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12
78
35
1
6
56
1.35
102028965--102029026
29
2.1
30
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11
85
35
0
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2.1
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29
0
4
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0
0
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23
2.6
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69
0
0
30
0.89
102030679--102030712
15
2.3
15
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70
0
0
29
0.87
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16
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21
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70
0
0
29
0.88
102036330--102036376
24
2.0
24
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4
69
63
6
2
27
1.30
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5.0
5
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0
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0
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0
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132
5.7
132
96
0
1357
27
16
26
30
1.97
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
102048574--102048607
12
2.7
13
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55
29
0
14
1.40
102049788--102049858
3
23.3
3
71
8
54
30
2
5
60
1.34
102049801--102049861
23
2.8
22
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5
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32
3
8
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1.45
102049824--102049869
23
2.0
23
83
8
58
30
2
10
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1.46
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19
1.9
19
88
0
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2.9
14
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0
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32
7
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42
1.77
102059395--102059461
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1.9
35
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100
31
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2.0
20
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0
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12
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2.1
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89
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45
0
17
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1.48
102065580--102065612
11
2.9
12
86
13
52
69
0
0
30
0.88

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          321   322   323   324   325