Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A03
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  105315579

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          321   322   323   324   325   

This is table  22  of  325  ( 38900 repeats found )

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Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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0
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27
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2.0
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116
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1104
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3
8
47
1.51
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2.0
15
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2.0
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6911961--6912039
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2.4
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1
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3.2
37
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10
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34
1
3
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0
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26
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1
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1.32
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2.6
22
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3
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7
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3
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1.27
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2.1
22
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2
30
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2.9
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5
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12
100
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6
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2.4
16
86
0
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43
28
5
23
1.75
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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17
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1.92
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2.4
14
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73
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148
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147
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644
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19
16
29
1.94
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3.4
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68
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11
15
1.34
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101
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37
19
18
24
1.94
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1.9
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1.96
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2.2
87
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11
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18
18
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1.92
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11
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61
6
2
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10
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5
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0
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2
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57
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0
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1.26
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14
117
58
3
0
37
1.19
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
6935183--6935248
29
2.3
30
78
14
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74
3
3
19
1.09
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100
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5
1
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2.6
23
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18
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3
1
34
1.24
6935676--6935721
20
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19
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58
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0
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0
0
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2
1
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10
10
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2
10
10
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27
2.9
27
90
0
122
17
3
27
50
1.63
6958346--6958399
24
2.4
22
80
17
58
35
0
7
57
1.27
6959544--6959583
18
2.4
16
84
15
55
40
0
20
40
1.52
6959726--6959777
27
1.9
27
92
0
86
11
3
32
51
1.56
6959750--6959795
23
2.0
23
100
0
92
8
4
34
52
1.52
6966056--6966143
45
2.0
44
93
2
149
39
7
3
48
1.49
6967236--6967278
14
2.9
15
75
6
52
30
20
0
48
1.50
6967603--6967710
26
4.2
26
90
0
171
33
6
23
37
1.80
6967603--6967710
52
2.1
52
96
0
198
33
6
23
37
1.80
6974327--6974434
26
4.2
26
91
0
180
33
7
23
36
1.83
6982737--6982796
26
2.3
27
79
2
68
61
8
6
23
1.48
6982955--6983003
17
2.9
16
80
17
55
61
4
0
34
1.15
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
6983020--6983097
27
2.9
25
79
9
84
51
7
7
33
1.59
6983086--6983116
15
2.1
15
93
0
53
58
0
9
32
1.31
6983617--6983677
11
5.2
11
75
16
52
55
6
3
34
1.42
6985043--6985098
26
2.1
26
83
3
67
14
1
33
50
1.53
6985043--6985102
27
2.3
27
82
5
70
13
1
36
48
1.52
6985513--6985654
71
2.0
71
98
0
275
23
23
13
39
1.90
6985675--6985708
13
2.5
14
85
9
52
61
8
5
23
1.47
6985929--6985963
14
2.5
14
90
0
52
60
5
11
22
1.52
6985691--6986017
164
2.0
164
86
2
451
34
21
15
28
1.94
6985852--6986125
90
3.1
88
84
5
345
36
20
15
27
1.93
6986046--6986192
73
2.0
72
92
1
240
31
21
17
29
1.96
6998379--6998437
26
2.2
27
81
3
75
61
8
5
25
1.46
6998670--6998747
27
2.9
25
79
9
84
51
7
7
33
1.59
6998736--6998766
15
2.1
15
93
0
53
58
0
9
32
1.31
6999415--6999475
11
5.3
11
77
15
52
55
6
3
34
1.42
7000240--7000273
9
3.6
9
85
14
50
11
2
0
85
0.71
7000300--7000375
27
2.8
27
82
13
86
75
2
15
6
1.13
7000843--7000902
25
2.3
25
85
5
75
10
0
40
50
1.36
7000843--7000902
26
2.3
27
85
5
79
10
0
40
50
1.36
7002575--7002628
24
2.2
24
83
0
63
46
3
1
48
1.30
7008046--7008192
73
2.0
73
97
0
276
29
21
8
39
1.84
7009288--7009314
13
2.1
13
100
0
54
51
0
33
14
1.43
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
7012518--7013102
293
2.0
288
80
7
642
41
16
12
29
1.86
7014005--7014037
17
2.1
16
88
11
50
33
0
6
60
1.21
7014484--7014514
7
4.6
7
96
4
55
0
9
0
90
0.46
7020149--7020200
16
3.2
16
94
0
86
28
0
36
34
1.58
7020181--7020275
45
2.1
44
86
5
129
34
4
27
33
1.76
7020413--7020467
25
2.2
25
84
9
69
52
1
0
45
1.11
7020598--7020758
47
3.6
46
69
18
140
48
3
3
45
1.34
7029892--7029929
10
3.8
10
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13
51
73
0
2
23
0.95
7029892--7029929
14
2.5
16
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8
53
73
0
2
23
0.95
7037857--7037892
12
2.9
12
91
4
54
55
0
19
25
1.43

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
          81   82   83   84   85   86   87   88   89   90   91   92   93   94   95   96   
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          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
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          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
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          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325