Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A03
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  105315579

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
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          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   

This is table  203  of  325  ( 38900 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
65850987--65851118
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10
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71
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0
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0
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0
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0
0
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2.0
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0
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20
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2.0
121
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27
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15
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88
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2.4
22
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2.1
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2.1
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2.0
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12
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23
23
26
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26
1
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37
1.65
65900154--65900228
21
3.6
21
66
10
55
26
1
34
37
1.65
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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29
0
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35
1.58
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26
1
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35
1.64
65900202--65900252
21
2.4
21
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25
0
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33
1.56
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1.23
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1.50
65900378--65900455
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1.50
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13
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2.2
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16
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0
0
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1.9
19
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0
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27
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18
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65936924--65937164
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36
21
23
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1.95
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2.0
100
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2.2
26
100
0
112
35
26
7
30
1.83
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2.0
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2
31
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1.71
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2.2
32
78
0
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1.71
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52
2
0
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52
0
0
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1.00
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1
0
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0
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2.1
30
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1.53
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1.80
65986205--65986273
32
2.2
32
84
2
86
31
24
4
39
1.75
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
65989199--65989385
40
4.6
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7
231
26
16
25
31
1.96
65996663--65996767
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2.6
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113
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0
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0
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16
22
42
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3.2
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1
67
23
19
20
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1.95
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19
36
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22
2.7
22
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9
72
29
16
20
33
1.94
66032278--66032350
23
3.2
22
74
1
65
24
20
20
34
1.97
66032343--66032413
24
2.9
24
79
6
81
26
23
18
30
1.97
66037129--66037163
12
2.9
12
95
0
61
51
8
0
40
1.33
66037128--66037163
14
2.6
14
95
0
63
50
8
0
41
1.33
66046557--66046681
27
4.6
27
96
1
205
32
28
12
26
1.92
66046557--66046681
55
2.3
55
92
2
207
32
28
12
26
1.92
66054774--66054897
27
4.5
28
92
5
200
33
28
12
26
1.92
66062951--66063077
57
2.3
55
91
5
202
34
28
12
24
1.92
66062951--66063077
28
4.5
28
91
7
204
34
28
12
24
1.92
66062951--66063103
57
2.7
56
82
13
179
35
28
12
24
1.91
66068450--66068577
58
2.2
57
87
9
188
26
10
28
33
1.90
66068450--66068590
28
4.9
28
88
9
187
28
9
27
34
1.89
66132542--66132687
65
2.2
65
87
2
213
19
9
27
43
1.82
66134125--66134188
25
2.5
26
80
7
69
28
12
29
29
1.93
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
66135539--66135809
48
5.6
48
73
0
254
28
16
27
27
1.97
66135536--66135814
96
2.9
96
87
1
407
27
17
26
27
1.97
66136907--66136984
27
2.9
27
92
1
129
14
21
42
21
1.88
66139515--66139738
40
5.6
40
85
3
279
25
22
25
26
2.00
66139522--66139738
83
2.7
80
85
5
269
25
22
25
26
2.00
66141521--66141546
4
6.5
4
100
0
52
76
0
0
23
0.78
66143874--66143906
14
2.4
14
95
5
59
21
18
18
42
1.89
66152762--66152787
13
2.0
13
100
0
52
61
0
15
23
1.33
66156136--66156180
22
2.0
22
86
0
63
33
13
8
44
1.75
66156313--66156349
18
2.1
18
94
0
65
43
13
21
21
1.87
66157719--66157904
40
4.7
40
88
5
234
26
27
22
23
1.99
66159752--66159812
28
2.2
27
80
8
70
34
24
1
39
1.65
66160705--66160752
22
2.1
23
81
11
55
60
4
0
35
1.16
66160997--66161051
13
4.4
13
71
17
53
67
3
0
29
1.08
66166286--66166332
21
2.2
20
85
10
67
42
0
2
55
1.12
66175771--66175819
19
2.5
20
77
12
57
53
22
6
18
1.66
66178118--66178192
37
2.0
37
94
0
132
44
20
8
28
1.79
66184777--66184804
14
2.0
14
100
0
56
35
14
21
28
1.92
66198739--66198803
20
3.0
22
76
19
73
67
4
1
26
1.18
66198815--66198883
20
3.5
20
76
6
77
66
1
0
31
1.00
66198822--66198883
29
2.1
29
82
5
72
67
1
0
30
1.00
66206546--66206572
13
2.1
13
100
0
54
62
0
0
37
0.95
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
66208515--66208591
39
2.0
39
92
0
127
41
12
9
36
1.75
66214353--66214666
101
3.1
101
85
2
416
30
14
24
30
1.95
66214486--66214560
33
2.3
33
84
6
98
32
16
24
28
1.96
66225188--66225249
25
2.4
25
77
17
65
19
4
3
72
1.17
66225314--66225371
21
2.8
20
87
10
82
37
0
1
60
1.07
66225316--66225390
22
3.6
20
76
13
71
41
0
1
57
1.07
66225418--66225468
21
2.5
20
87
9
75
29
0
3
66
1.09
66225355--66225559
95
2.1
96
83
9
267
37
2
3
56
1.33
66225429--66225474
21
2.2
21
92
3
76
26
0
4
69
1.07
66225469--66225502
17
2.1
16
88
5
50
41
0
2
55
1.15

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
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          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
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          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
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          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
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          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325