Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A03
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  105315579

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   

This is table  286  of  325  ( 38900 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
93478698--93478749
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1.99
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2.4
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2
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20
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2
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1.23
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
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T
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22
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2.00
93555334--93555518
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27
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2.00
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210
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20
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19
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2.0
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7.6
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0
30
1.09
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
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Entropy
(0-2)
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1.55
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4
32
1.38
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
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Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
93598771--93598988
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1.97
93610079--93610250
93
1.8
93
91
2
283
29
30
19
20
1.97
93612053--93612119
31
2.2
30
78
7
73
53
2
1
41
1.25
93616766--93616803
14
2.7
14
91
0
58
84
0
13
2
0.73
93622356--93622398
12
3.8
12
93
6
72
76
0
23
0
0.78
93628921--93629142
110
2.0
110
98
0
426
27
15
21
35
1.94
93638982--93639077
43
2.2
43
88
0
138
20
14
33
31
1.93
93643946--93643985
8
5.0
8
84
0
53
47
20
27
5
1.70
93650501--93650574
30
2.5
30
82
4
87
52
21
4
21
1.63
93652069--93652110
17
2.5
17
81
11
52
54
0
9
35
1.33
93663611--93663649
18
2.2
19
86
9
55
58
0
5
35
1.20
93669535--93669582
24
2.0
23
84
4
60
56
4
0
39
1.19
93678295--93678625
40
8.3
40
86
5
404
23
20
27
27
1.99
93678295--93678625
119
2.8
120
91
1
515
23
20
27
27
1.99
93686623--93686954
40
8.3
40
86
4
404
24
20
27
27
1.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
93686623--93686954
120
2.8
120
91
1
515
24
20
27
27
1.99
93695716--93695778
25
2.5
26
73
17
62
41
0
6
52
1.27
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6
100
0
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0
0
34
0.93
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19
2.5
20
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10
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57
2
0
40
1.11
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4
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0
2
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0.93
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2.2
23
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24
0
2
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0.93
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3.6
7
100
0
50
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0
0
64
0.94
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1.9
21
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5
7
45
1.54
93739812--93739902
40
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35
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13
1.89
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1.9
40
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0
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35
15
12
1.86
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2.0
40
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0
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13
1.87
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56
2.0
56
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0
177
29
22
15
32
1.95
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23
6.6
22
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10
113
41
35
4
18
1.69
93749031--93749138
48
2.4
43
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9
128
41
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3
17
1.67
93753266--93753350
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2.7
32
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163
35
3
0
61
1.13
93753267--93753351
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5.4
16
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3
0
62
1.12
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70
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52
35
2
0
62
1.09
93753305--93753352
24
2.1
23
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11
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35
2
0
62
1.07
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19
2.1
19
100
0
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30
10
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13
2.4
14
85
10
50
72
3
0
24
0.98
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19
2.1
20
90
4
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51
0
4
43
1.23
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19
2.7
19
84
3
66
64
0
4
32
1.12
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
93762457--93762554
9
10.6
9
71
6
61
64
1
3
31
1.16
93763742--93763872
63
2.1
62
81
4
156
25
31
19
23
1.98
93764371--93764416
16
2.9
16
87
3
67
78
0
19
2
0.86
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22
2.2
21
85
10
62
79
0
18
2
0.84
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28
3.1
28
82
12
101
26
5
1
67
1.20
93768140--93768178
17
2.4
16
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51
33
2
0
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2.0
22
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25
9
0
65
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20
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18
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10
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19
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39
1.82
93774272--93774311
21
1.9
21
85
10
55
30
30
20
20
1.97

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
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          321   322   323   324   325