Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A03
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  105315579

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   

This is table  17  of  325  ( 38900 repeats found )

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Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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50
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1.71
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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3
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16
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0
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Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
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Percent
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Percent
Indels
Score
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2
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25
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17
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5
75
1.00
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
5564486--5564526
17
2.4
17
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0
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0
2
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0
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34
0
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52
34
4
0
60
1.17
5599564--5599629
25
2.6
24
75
17
62
42
3
0
54
1.15
5599963--5600025
32
2.0
32
87
0
90
55
17
1
25
1.51
5599963--5600024
16
3.9
16
71
0
61
56
17
1
24
1.50
5607931--5607955
2
12.5
2
100
0
50
52
48
0
0
1.00
5610885--5610964
41
1.9
42
85
7
110
18
31
26
23
1.98
5611685--5611719
6
5.8
6
93
0
61
51
17
14
17
1.77
5613409--5613456
16
3.1
15
90
6
69
64
2
2
31
1.16
5613405--5613456
8
6.5
8
82
8
61
65
1
1
30
1.14
5613404--5613460
24
2.4
24
79
5
71
64
1
3
29
1.20
5613569--5613622
23
2.5
22
75
13
60
57
5
5
31
1.45
5613585--5613670
25
3.7
24
79
10
81
55
5
6
31
1.50
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
5613692--5613821
23
5.6
24
74
10
92
57
2
3
36
1.29
5613685--5613741
14
3.9
15
73
26
52
61
0
3
35
1.13
5614301--5614445
30
4.8
30
91
0
227
22
4
47
26
1.69
5620697--5620744
16
3.1
15
90
6
69
64
2
2
31
1.16
5620693--5620744
8
6.5
8
82
8
61
65
1
1
30
1.14
5620692--5620748
24
2.4
24
79
5
71
64
1
3
29
1.20
5620855--5620908
23
2.5
22
75
13
60
57
5
5
31
1.45
5620871--5620956
25
3.7
24
79
10
81
55
5
6
31
1.50
5620886--5621104
25
9.0
25
72
14
120
56
3
5
34
1.40
5620945--5621023
29
2.7
29
82
5
79
59
2
5
32
1.33
5621582--5621786
30
6.8
30
93
0
329
22
3
47
25
1.68
5640069--5640126
30
1.9
30
89
0
89
50
1
34
13
1.52
5658518--5658612
40
2.3
40
89
3
136
0
27
8
64
1.22
5658514--5658616
45
2.3
44
80
12
104
0
27
7
65
1.20
5658622--5658696
2
41.0
2
70
26
51
52
4
0
44
1.20
5659663--5659721
30
2.0
30
83
6
75
30
16
1
50
1.55
5660235--5660266
14
2.3
14
94
0
55
62
0
0
37
0.95
5664732--5664802
35
2.0
35
86
0
97
29
23
9
36
1.87
5669257--5669381
48
2.6
48
82
7
146
19
18
26
36
1.94
5679445--5679587
57
2.5
55
80
10
146
23
9
10
57
1.60
5682361--5682407
19
2.5
19
82
6
51
34
0
2
63
1.06
5683260--5683308
19
2.6
19
81
12
57
63
4
0
32
1.13
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
5683432--5683484
24
2.3
22
78
18
54
58
3
9
28
1.47
5683691--5683725
2
17.5
2
93
0
61
0
48
0
51
1.00
5683777--5683801
2
12.5
2
100
0
50
0
48
0
52
1.00
5688347--5688425
32
2.5
31
73
17
74
51
2
0
45
1.14
5691387--5691443
26
2.3
23
76
21
62
47
5
0
47
1.24
5691521--5691555
15
2.2
16
90
5
54
60
0
0
40
0.97
5691501--5691578
38
2.1
38
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4
95
50
2
0
47
1.15
5691566--5691591
9
2.9
9
100
0
52
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0
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1.37
5693314--5693358
22
2.1
21
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11
15
28
44
1.81
5693376--5693617
42
5.7
43
80
5
244
29
31
16
22
1.96

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
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          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
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          321   322   323   324   325