Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A03
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  105315579

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   

This is table  24  of  325  ( 38900 repeats found )

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Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
7256198--7256255
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17
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1.11
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0
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5
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22
20
29
1.98
7260639--7261331
268
2.6
267
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1
1102
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20
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0
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2.6
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10
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5
5
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1.9
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1.44
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2.3
19
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0
0
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17
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202
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22
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20.0
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2.5
28
84
11
90
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1
24
2
1.08
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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3
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1
5
30
1.25
7309189--7309308
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2.5
48
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29
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1.98
7315175--7315251
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1
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13
2.1
14
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17
6
0
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1.01
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2.5
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0
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20
11
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1.20
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2.2
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42
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1
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2.0
38
100
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20
2.0
21
85
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55
45
2
15
37
1.59
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46
6.9
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1.91
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17
2.0
17
94
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59
48
0
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36
1.45
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9
5.1
9
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15
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43
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0
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254
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11
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1.80
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23
2.2
24
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3
72
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3
5
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16
2.1
16
94
0
59
35
5
11
47
1.65
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2.2
23
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1.84
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0
0
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37
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39
2.0
39
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106
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10
1
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1.40
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0
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0
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1.00
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2
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0
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559
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2027
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2
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51
17
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2.0
21
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0
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21
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1.79
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17.0
3
83
0
66
31
7
0
60
1.25
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
7430344--7430393
21
2.3
21
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3
73
24
6
22
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7430530--7430626
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2.3
42
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15
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2.0
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0
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11
9
34
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1.72
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2.0
15
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31
0
0
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0
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0
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18
0
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0
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0
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10
4.8
10
82
12
62
65
2
8
23
1.31
7460081--7460156
3
25.7
3
71
12
59
60
3
3
31
1.33
7460112--7460171
12
5.0
12
80
9
61
63
3
1
31
1.20
7461748--7461994
86
2.8
85
76
14
245
35
20
17
26
1.95
7461938--7462347
75
5.5
75
91
1
581
35
19
15
29
1.93
7474500--7474678
26
7.4
25
69
14
101
51
3
7
37
1.46
7474599--7474658
25
2.4
27
83
10
74
55
1
3
40
1.27
7474624--7474713
13
7.2
12
70
17
67
57
1
4
36
1.26
7474627--7474709
36
2.2
36
83
8
96
56
1
4
37
1.28
7474662--7474739
27
3.0
27
75
20
76
57
1
6
34
1.32
7474623--7474879
23
10.8
23
67
22
90
55
5
3
35
1.39
7475024--7475103
3
27.0
3
73
12
67
60
3
3
32
1.32
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
7486608--7486632
12
2.1
12
100
0
50
52
0
8
40
1.31
7487054--7487087
13
2.6
13
90
9
52
17
8
8
64
1.47
7491631--7491677
25
2.0
23
83
8
58
8
14
4
72
1.24
7497882--7497907
6
4.3
6
100
0
52
84
0
0
15
0.62
7501083--7501150
34
2.0
34
100
0
136
41
17
2
38
1.65
7501808--7501855
21
2.3
21
82
13
55
62
0
6
31
1.20
7505187--7505262
30
2.5
30
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14
93
28
10
0
60
1.30
7505201--7505247
18
2.5
20
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19
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27
10
0
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1.29
7507482--7507527
19
2.4
19
85
7
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19
23
13
43
1.86
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44
9.2
44
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15
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32
21
24
21
1.98
7512106--7512627
88
5.9
88
85
4
636
32
21
23
22
1.98
7512102--7512627
178
3.0
178
88
1
745
33
21
23
21
1.98
7512106--7512593
44
11.0
44
66
14
187
33
20
23
21
1.97
7514798--7514995
105
1.9
101
82
6
245
28
24
14
32
1.95
7515942--7516014
36
2.0
36
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0
137
41
13
15
30
1.85
7520126--7520167
20
2.0
22
86
9
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33
4
0
61
1.17
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27
2.3
27
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0
81
25
38
20
15
1.92
7536702--7536759
21
2.7
22
78
19
61
32
3
0
63
1.11
7537789--7537881
48
1.9
48
91
0
150
20
20
27
31
1.97
7545462--7545492
2
15.5
2
100
0
62
51
0
0
48
1.00
7546234--7546306
22
3.3
22
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3
76
60
13
9
16
1.59
7553256--7553611
179
2.0
176
92
1
595
44
19
14
22
1.86
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
7557131--7557189
30
1.9
31
86
3
84
47
1
22
28
1.61
7557388--7557434
25
1.9
26
87
12
73
38
0
0
61
0.96
7557399--7557452
20
2.7
19
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8
63
33
0
0
66
0.92
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2.5
15
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4
56
66
0
0
33
0.92
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23
3.3
23
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5
69
35
1
0
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1.04
7567325--7567382
20
2.9
19
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3
0
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1.12
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2.0
40
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1
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19
2.7
18
87
12
73
73
2
0
24
0.94

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          321   322   323   324   325