Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A03
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  105315579

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   

This is table  33  of  325  ( 38900 repeats found )

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Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
9760146--9760200
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0
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2.0
21
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19
33
1.97
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2.2
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36
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23
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55
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11
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51
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0
0
17
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Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
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Entropy
(0-2)
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0
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19
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76
10
590
26
21
14
38
1.91
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
9975974--9976719
111
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110
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10
568
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1.91
9979102--9979141
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1.60
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40
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20
23
31
1.98
9982815--9982942
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3.1
42
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2
215
24
20
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2
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23
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26
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1.95
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19
0.87
10000121--10000164
20
2.1
21
91
4
72
70
2
0
27
0.99
10000132--10000170
20
2.0
20
89
0
60
76
2
0
20
0.90
10000189--10000257
36
1.9
36
96
0
129
26
7
21
44
1.78
10000190--10000257
9
7.6
9
89
0
100
25
7
22
45
1.77
10006453--10006546
40
2.4
40
80
3
111
38
36
10
14
1.81
10010359--10010472
25
4.6
26
78
10
98
22
28
16
31
1.96
10010382--10010494
25
4.5
25
76
9
88
23
29
19
28
1.98
10011503--10011576
30
2.5
30
93
0
121
21
22
33
21
1.97
10011526--10011571
13
3.1
15
71
22
51
17
21
36
23
1.94
10011528--10011576
17
3.1
17
69
22
52
22
24
32
20
1.98
10012841--10013047
53
3.8
54
77
1
209
19
23
18
38
1.93
10012854--10013047
54
3.6
53
75
4
165
19
23
19
38
1.93
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
10015856--10015913
28
2.1
28
87
12
86
37
8
0
53
1.32
10016006--10016072
26
2.6
27
81
11
77
32
7
1
58
1.35
10018785--10018861
40
1.9
40
84
5
102
36
22
22
19
1.95
10019634--10019696
10
6.8
9
82
12
74
30
1
1
66
1.10
10019628--10019734
28
3.7
27
75
17
90
34
0
0
63
1.07
10019634--10019726
20
4.8
19
75
18
77
33
1
1
64
1.08
10019634--10019726
10
9.5
10
73
21
56
33
1
1
64
1.08
10019686--10019721
13
2.8
13
87
4
56
44
0
0
55
0.99
10019628--10019734
9
11.0
9
73
18
58
34
0
0
63
1.07
10020189--10020249
13
4.7
13
80
6
70
44
0
11
44
1.40
10020184--10020251
13
5.2
13
76
0
55
45
1
10
42
1.47
10020844--10020882
3
13.0
3
88
0
51
28
35
5
30
1.79
10022275--10022512
72
3.3
71
91
2
363
54
15
6
23
1.64
10023886--10023947
22
2.7
23
76
14
65
51
4
6
37
1.49
10030595--10030709
30
3.8
30
95
0
185
44
6
22
26
1.76
10030605--10030709
15
7.0
15
67
12
72
43
6
22
26
1.78
10031370--10031523
77
2.0
77
94
0
272
29
22
12
35
1.92
10033098--10033180
34
2.4
34
81
4
94
69
7
3
19
1.27
10033166--10033190
10
2.5
10
100
0
50
84
0
0
16
0.63
10034059--10034089
3
10.3
3
100
0
62
32
0
0
67
0.91
10035687--10035724
13
3.0
13
88
3
51
34
0
0
65
0.93
10042234--10042269
19
1.9
19
88
5
56
41
16
2
38
1.63
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
10042296--10042374
23
3.4
23
70
6
79
56
0
5
37
1.21
10042300--10042375
22
3.4
22
70
13
73
59
0
3
36
1.16
10049593--10049623
10
3.1
10
90
0
53
32
0
0
67
0.91
10050864--10050892
2
14.5
2
100
0
58
48
0
51
0
1.00
10062906--10063047
26
5.3
26
75
10
99
29
6
5
58
1.46
10063042--10063082
22
1.9
21
85
5
55
24
4
2
68
1.22
10063068--10063120
22
2.4
21
78
12
54
24
0
1
73
0.93
10066784--10066826
19
2.2
20
83
4
52
30
20
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44
1.72
10074831--10075306
133
3.6
133
84
4
568
29
18
24
27
1.98
10074835--10075263
89
4.8
88
70
11
243
28
18
24
27
1.98

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325