Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A03
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  105315579

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          321   322   323   324   325   

This is table  54  of  325  ( 38900 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
16380755--16380793
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0
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1292
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16382110--16383058
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6.6
145
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1261
33
20
16
30
1.94
16382110--16383124
220
4.7
216
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1340
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20
16
29
1.94
16382965--16383410
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1.9
19
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2.1
13
100
0
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25
14
7
51
1.68
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
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(0-2)
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31
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22
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0
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2.1
30
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2.0
29
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22
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1.97
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3.2
144
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793
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30
17
27
1.97
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144
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28
1.97
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6.2
48
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3
344
24
28
17
29
1.97
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
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T
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(0-2)
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152
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19
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1.9
21
85
10
55
65
5
2
27
1.27
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
16554244--16554268
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0
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69
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0
2
26
0.98
16557796--16557871
20
3.7
21
77
10
68
59
6
1
32
1.32
16557918--16557959
18
2.4
18
84
4
59
21
19
0
59
1.38
16558689--16558726
19
2.0
19
89
0
58
42
15
5
36
1.70
16560031--16560086
21
2.6
22
75
8
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28
23
0
48
1.51
16560103--16560138
16
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15
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25
8
0
66
1.19
16562465--16562507
12
3.6
12
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0
50
51
2
4
41
1.35
16565057--16565101
18
2.5
17
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10
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60
0
2
37
1.09
16565057--16565099
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16
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58
0
2
39
1.11
16570615--16570974
47
7.7
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14
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16570615--16570972
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22
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20
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1.98
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1.9
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0
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1.94
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5
7.0
5
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0
0
61
0.96
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4
300
43
0
18
38
1.51
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5
7.0
5
93
6
63
38
0
0
61
0.96
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
16587891--16588058
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3.5
48
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0
318
43
0
18
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17
2.1
17
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0
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11
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25
1.86
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2
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2
100
0
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51
0
0
48
1.00
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2.0
26
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7
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23
3
3
69
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4
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0
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0
2
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1.01
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1.21
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3
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0
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2
1.03
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44
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12
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28
1.95
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33
18
19
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1.96
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1.9
133
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29
1.95
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20
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1.9
228
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19
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1.96
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27
2.0
26
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3
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9
11
1.70
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2.3
17
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0
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23
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2.0
132
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310
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23
14
28
1.94
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10
20
1.33
16620364--16620401
20
1.9
20
94
0
67
65
2
10
21
1.35
16625712--16625768
25
2.3
25
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8
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24
7
7
61
1.47
16625764--16625821
30
1.9
30
92
0
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18
13
6
60
1.55
16625765--16625829
30
2.2
30
83
2
87
20
13
7
58
1.60
16627642--16627758
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1.9
62
81
0
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29
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17
27
1.98
16627642--16627759
31
3.8
31
78
0
128
28
25
17
27
1.98
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
16627739--16627863
50
2.5
51
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2
171
26
22
14
36
1.92
16631282--16631360
42
2.0
40
85
7
106
40
1
2
55
1.21
16635466--16635522
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1.9
30
85
0
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40
8
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22
1.84
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19
2.3
20
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10
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36
0
14
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50
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17
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31
1.97
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2.9
151
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17
26
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16636201--16636585
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344
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0
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0
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18
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0
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20
2.0
19
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5
60
71
2
25
0
0.98

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          321   322   323   324   325