Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A03
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  105315579

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   

This is table  6  of  325  ( 38900 repeats found )

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Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
1603956--1604035
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18
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1.20
1603951--1604031
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2.9
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4.2
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16
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15
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2.1
27
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110
2.2
110
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0
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0
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2.4
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2.0
33
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22
1
14
61
1.42
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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4
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0
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0
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1.30
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2.0
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15
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0
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15
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2.4
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1
41
1.19
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25
2.3
26
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73
32
1
1
63
1.14
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27
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70
52
7
3
35
1.48
1724925--1724983
29
2.1
28
84
9
75
50
5
0
44
1.24
1732609--1732711
38
2.7
38
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109
22
22
21
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13
2.4
13
94
0
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58
3
12
25
1.50
1748698--1748737
6
6.8
6
85
5
55
2
12
2
82
0.87
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29
2.1
30
88
8
92
25
3
11
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1.46
1760408--1760475
30
2.2
30
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2
118
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1
14
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0
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0
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19
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0
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10
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1763861--1763900
19
2.0
20
86
13
57
77
2
5
15
1.04
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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0
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1.89
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17
2.0
17
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14
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1.44
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11
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2.0
16
100
0
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2.0
49
100
0
200
33
6
22
39
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5.2
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10
116
21
22
21
33
1.97
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19
23
22
35
1.96
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4.8
23
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102
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23
20
35
1.96
1778643--1778754
45
2.4
46
78
11
122
20
23
20
35
1.96
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2.7
29
74
9
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53
1
2
42
1.22
1779669--1779736
31
2.3
28
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9
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1
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1.24
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58
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1780613--1780660
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0
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35
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1.23
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20
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1.99
1787043--1787120
28
2.7
29
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1
2
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1.22
1787054--1787121
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1787998--1788045
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35
0
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1.23
1788148--1788181
17
2.0
17
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0
50
35
0
29
35
1.58
1788363--1788458
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2.5
39
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6
108
20
23
28
27
1.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
1806398--1806454
29
1.9
30
86
10
82
33
10
10
45
1.73
1808771--1808809
21
1.9
21
89
5
62
56
12
7
23
1.62
1810271--1810729
229
2.0
229
100
0
918
32
21
19
26
1.97
1810699--1811006
153
2.0
153
95
0
553
30
18
11
39
1.86
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2.0
15
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0
0
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17
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45
0
0
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0.99
1817308--1817336
15
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15
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37
0
0
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2.1
17
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10
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42
0
2
54
1.15
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28
2.1
28
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31
6
1
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2.1
32
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0
125
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7
2
46
1.47
1829889--1829913
11
2.3
11
100
0
50
56
8
0
36
1.29
1831678--1831916
123
1.9
123
80
3
275
30
20
12
35
1.90
1831805--1832053
136
1.8
136
81
6
308
31
20
10
37
1.87
1852901--1852948
21
2.3
20
79
6
60
29
2
6
62
1.31
1859847--1859876
15
1.9
16
93
6
53
33
10
23
33
1.88
1868396--1868441
25
1.9
23
83
16
58
43
4
4
47
1.42
1876403--1876427
10
2.5
10
100
0
50
52
8
0
40
1.31
1876708--1876754
21
2.3
20
85
10
60
29
2
2
65
1.15
1877295--1877397
51
2.0
51
100
0
206
50
27
3
18
1.64
1880178--1880211
14
2.5
14
95
4
61
52
0
5
41
1.25
1884734--1884815
38
2.2
38
86
4
112
30
12
7
50
1.67
1895760--1895845
23
3.7
24
79
16
65
31
4
1
62
1.23
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
1895760--1895826
5
13.4
5
72
21
52
34
1
1
62
1.13
1905716--1905742
13
2.1
13
100
0
54
22
18
7
51
1.70
1907499--1907532
16
2.0
18
88
11
54
52
0
0
47
1.00
1910131--1910194
13
4.9
13
78
0
65
35
6
21
35
1.79
1911732--1911797
29
2.3
29
81
5
80
51
1
0
46
1.10
1912493--1912531
20
2.0
20
94
0
69
41
10
2
46
1.51
1912727--1913101
55
6.7
55
80
4
401
25
7
16
50
1.71
1912727--1913064
171
2.0
171
85
1
462
25
7
15
50
1.71
1913895--1913932
16
2.4
16
82
8
51
15
18
2
63
1.43
1920680--1920721
22
1.9
22
85
0
57
9
7
21
61
1.50
1921006--1921048
18
2.4
19
81
14
56
58
2
0
39
1.11
1921237--1921269
17
2.0
17
94
5
59
48
0
0
51
1.00
1922612--1923096
153
3.1
153
74
8
394
30
21
17
30
1.96
1922545--1923137
78
7.6
78
74
6
368
31
21
17
30
1.96
1926113--1926175
32
2.0
32
87
6
92
39
1
9
49
1.45
1941738--1941790
28
1.9
27
82
17
65
52
3
3
39
1.37
1944354--1944399
21
2.2
22
88
7
69
21
36
19
21
1.95
1946597--1946643
21
2.2
22
92
3
78
21
38
19
21
1.94
1948839--1948885
21
2.2
22
92
3
78
21
38
19
21
1.94
1953019--1953146
69
1.9
67
85
3
175
42
10
13
32
1.79
1955992--1956027
19
1.9
18
88
5
54
47
8
8
36
1.64
1958337--1958485
77
1.9
77
91
1
244
45
12
8
33
1.72
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
1960565--1960899
130
2.6
133
87
2
466
35
18
16
28
1.93
1969124--1969234
17
6.3
16
75
17
80
39
11
13
35
1.81
1969133--1969264
19
7.1
19
72
20
93
37
10
11
40
1.76
1969114--1969189
35
2.2
35
90
9
120
36
10
11
40
1.76
1969133--1969264
55
2.4
54
83
5
174
37
10
11
40
1.76
1969167--1969345
38
4.8
37
76
6
137
40
10
11
37
1.75
1969133--1969354
38
6.0
36
73
10
132
40
9
11
37
1.75
1969935--1969961
11
2.5
11
100
0
54
22
7
0
70
1.12
1969958--1970011
10
5.2
10
80
14
56
0
22
0
77
0.76
1969968--1970008
14
3.0
14
86
13
59
0
21
0
78
0.76

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
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          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
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          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
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          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325