Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A03
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  105315579

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
          81   82   83   84   85   86   87   88   89   90   91   92   93   94   95   96   
          97   98   99   100   101   102   103   104   105   106   107   108   109   110   111   112   
          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
          193   194   195   196   197   198   199   200   201   202   203   204   205   206   207   208   
          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   

This is table  264  of  325  ( 38900 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
86134083--86134426
50
6.9
50
79
2
384
29
26
17
26
1.97
86134775--86134821
19
2.3
20
82
10
60
46
17
0
36
1.48
86136361--86136407
23
2.0
23
83
4
58
25
4
51
19
1.65
86139693--86139724
16
2.0
16
93
0
55
34
18
0
46
1.49
86139924--86140318
50
7.9
50
75
3
362
30
25
18
26
1.98
86139985--86140166
101
1.8
101
86
0
265
29
24
19
26
1.98
86139927--86140319
151
2.6
151
91
0
642
30
25
18
25
1.98
86140667--86140713
19
2.3
20
82
10
60
48
12
0
38
1.41
86143407--86143479
32
2.3
33
90
6
109
26
8
12
53
1.66
86143416--86143479
32
2.0
32
96
0
119
23
9
14
53
1.69
86154343--86154392
26
1.9
26
95
0
91
30
34
24
12
1.91
86154207--86154470
103
2.6
102
90
3
404
29
29
20
19
1.97
86154798--86154862
30
2.2
29
81
8
76
30
27
6
35
1.81
86154805--86154862
30
1.9
30
85
0
80
31
24
6
37
1.82
86161696--86161960
103
2.6
104
90
3
417
29
29
20
19
1.97
86162288--86162352
30
2.2
29
81
8
76
30
27
6
35
1.81
86162295--86162352
30
1.9
30
85
0
80
31
24
6
37
1.82
86169718--86169760
21
2.0
21
82
8
52
6
11
9
72
1.29
86175243--86175293
26
1.9
27
84
4
68
23
27
0
49
1.51
86175326--86175378
21
2.5
21
82
14
65
47
1
3
47
1.31
86175326--86175373
20
2.3
20
86
10
62
47
0
4
47
1.21
86175384--86175440
24
2.4
24
76
5
62
47
5
0
47
1.24
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
86179416--86179858
222
2.0
222
96
0
827
32
20
13
33
1.91
86185075--86185107
7
4.7
7
96
0
57
30
24
0
45
1.53
86185555--86185616
30
2.1
29
90
3
97
20
1
16
61
1.43
86185555--86185616
29
2.1
30
88
8
92
20
1
16
61
1.43
86188016--86188135
56
2.1
56
96
0
222
45
9
24
21
1.81
86192444--86192798
47
7.6
47
95
0
613
32
8
29
29
1.86
86192444--86192798
187
1.9
187
94
0
620
32
8
29
29
1.86
86192917--86192995
37
2.1
37
90
0
122
24
18
31
25
1.98
86194217--86194376
73
2.2
73
100
0
320
23
31
20
25
1.98
86195424--86195542
46
2.6
44
82
7
132
24
30
20
25
1.99
86195470--86195638
46
3.6
46
75
13
134
23
27
20
28
1.99
86203844--86203998
37
4.2
37
82
8
147
21
15
18
44
1.86
86203802--86203998
74
2.6
74
80
6
193
22
15
17
43
1.87
86205896--86206189
50
5.8
50
75
5
245
26
16
25
31
1.96
86205952--86206134
101
1.8
101
87
2
278
26
18
25
30
1.98
86208321--86208370
25
2.0
25
96
0
91
40
26
12
22
1.88
86224621--86224673
23
2.3
23
83
3
63
56
15
16
11
1.67
86228432--86228470
20
2.0
20
85
10
53
69
5
7
17
1.32
86236837--86236869
16
2.1
16
88
11
50
33
24
18
24
1.97
86248587--86248786
40
5.0
40
85
2
258
32
16
26
25
1.96
86249446--86249499
16
3.6
16
74
16
53
38
33
0
27
1.57
86249695--86249733
7
5.6
7
82
11
53
56
28
0
15
1.40
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
86249695--86249759
21
3.0
21
75
16
62
50
27
3
18
1.61
86250113--86250144
15
2.1
15
100
0
64
81
0
12
6
0.87
86255764--86255797
17
1.9
18
88
5
52
52
2
2
41
1.31
86260885--86260918
17
1.9
18
88
5
52
52
2
2
41
1.31
86261800--86261829
6
5.0
6
95
0
51
0
20
0
80
0.72
86263727--86263784
29
2.0
29
100
0
116
27
17
20
34
1.95
86272154--86272190
3
12.3
3
100
0
74
67
0
0
32
0.91
86280952--86281012
27
2.3
27
85
0
86
36
24
4
34
1.77
86281153--86281198
4
12.2
4
82
17
55
0
26
0
73
0.83
86284752--86284784
17
2.0
17
94
5
59
36
15
0
48
1.45
86285065--86285567
46
11.0
46
89
0
686
21
23
13
40
1.89
86292161--86292322
88
1.8
88
82
5
211
24
25
21
27
1.99
86292223--86292804
132
4.4
132
83
4
681
25
23
21
30
1.99
86292154--86292452
44
6.8
44
69
6
176
24
24
21
29
1.99
86292223--86292806
264
2.2
263
86
2
794
25
23
21
30
1.99
86302897--86302934
19
2.0
20
84
5
51
31
18
15
34
1.92
86311091--86311170
14
5.7
14
72
15
58
47
28
3
20
1.67
86326015--86326069
24
2.2
26
81
12
71
45
0
1
52
1.11
86326207--86326301
45
2.1
45
88
1
138
32
27
5
34
1.79
86326282--86326333
16
3.2
16
94
0
86
34
36
0
28
1.58
86329152--86329310
25
6.4
25
72
9
101
18
25
20
36
1.94
86329216--86329328
50
2.3
49
80
3
127
18
22
23
35
1.96
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
86332143--86332246
52
2.0
52
100
0
208
23
30
13
32
1.93
86332505--86332572
9
7.6
9
73
6
57
45
17
7
29
1.75
86332504--86332572
27
2.6
27
78
0
75
46
17
7
28
1.75
86332592--86332638
6
7.5
6
81
9
58
19
0
4
76
0.95
86332603--86332646
20
2.1
21
87
4
63
27
0
4
68
1.09
86332663--86332706
13
3.6
13
82
17
58
9
2
47
40
1.48
86345762--86345934
89
2.0
87
95
2
310
41
4
2
52
1.35
86345891--86345926
16
2.2
17
90
5
56
41
0
0
58
0.98
86345773--86345955
88
2.1
89
85
4
244
45
2
2
50
1.26
86347391--86347439
24
2.0
24
84
0
62
34
6
22
36
1.79
86350650--86350757
55
2.0
55
96
0
198
31
9
18
40
1.82
86355015--86355058
21
2.2
20
83
4
52
45
0
2
52
1.13
86357380--86357413
16
2.1
16
88
0
50
35
0
0
64
0.94
86357438--86357669
3
76.0
3
67
22
103
31
5
3
59
1.37
86357619--86357669
19
2.7
19
88
8
77
27
3
3
64
1.28
86372583--86372806
104
2.2
104
93
1
378
31
31
19
17
1.95
86373135--86373198
30
2.2
29
81
10
76
29
28
6
35
1.82
86373142--86373198
30
1.9
30
85
3
80
29
24
7
38
1.82
86381365--86381399
16
2.2
16
100
0
70
0
25
5
68
1.11
86387065--86387149
28
3.0
28
77
0
98
34
16
17
31
1.93
86387685--86387823
69
2.0
69
95
0
251
48
7
7
36
1.60
86389414--86389461
24
2.0
24
87
0
69
18
20
8
52
1.71
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
86389426--86389530
41
2.6
40
87
3
156
24
21
6
46
1.75
86399325--86399368
9
4.8
9
77
5
52
34
2
40
22
1.67
86411285--86411456
93
1.8
93
93
0
299
27
29
20
22
1.99
86411277--86411452
46
3.8
46
79
12
207
28
28
20
22
1.98
86415820--86415859
3
13.3
3
89
0
62
65
0
5
30
1.14
86415934--86415981
12
4.0
12
83
0
51
70
2
2
25
1.09
86419666--86420716
70
15.1
70
74
6
673
31
22
18
27
1.97
86420273--86420666
206
1.9
209
82
7
489
31
21
19
27
1.97
86420860--86420895
17
2.1
17
89
0
54
33
5
19
41
1.75
86428580--86428653
27
2.5
30
82
17
109
28
2
20
48
1.63
86428597--86428652
27
2.1
27
100
0
112
30
3
17
48
1.65
86428951--86428988
18
2.1
18
85
9
51
23
7
10
57
1.58
86429266--86429312
6
7.7
6
80
4
58
23
0
2
74
0.93
86429268--86429312
19
2.4
18
89
7
72
24
0
2
73
0.95
86436818--86436853
17
2.1
18
89
5
56
33
0
5
61
1.19
86441741--86441805
26
2.5
26
85
5
69
16
24
23
35
1.95
86444948--86445117
46
3.7
45
75
13
143
28
18
27
24
1.98
86444948--86445118
93
1.8
92
80
8
204
29
18
27
24
1.98
86449828--86449873
22
2.1
22
84
11
60
39
6
10
43
1.66
86450921--86451110
95
2.0
95
85
8
258
45
3
3
48
1.34
86450952--86451135
95
1.9
94
82
8
230
47
2
2
47
1.28
86454112--86454158
21
2.2
21
85
11
60
21
8
6
63
1.44
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
86458127--86458164
18
2.1
19
90
5
60
21
21
5
52
1.66
86482481--86482701
46
4.7
47
77
11
181
22
28
20
28
1.98
86484106--86484181
40
1.9
40
86
5
109
27
26
18
27
1.98
86491749--86491942
46
4.3
46
64
10
112
31
23
18
26
1.97
86491645--86492689
134
7.9
134
92
3
1760
29
24
19
26
1.98
86492408--86492598
46
4.3
46
68
11
153
30
25
18
25
1.98
86492782--86492862
42
1.9
42
92
5
137
32
25
18
23
1.97
86492701--86492932
127
1.8
124
88
4
349
28
25
20
26
1.99
86497039--86497082
19
2.3
20
84
7
56
40
11
20
27
1.86
86501093--86501176
39
2.1
40
93
2
143
38
9
19
33
1.84

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
          81   82   83   84   85   86   87   88   89   90   91   92   93   94   95   96   
          97   98   99   100   101   102   103   104   105   106   107   108   109   110   111   112   
          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
          193   194   195   196   197   198   199   200   201   202   203   204   205   206   207   208   
          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325