Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A03
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  105315579

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
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          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
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          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   

This is table  12  of  325  ( 38900 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
3610340--3610380
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2.3
18
84
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0
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1.14
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51
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3
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2.0
32
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3
4
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0
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2.0
28
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0
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3
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28
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3626010--3626076
30
2.2
30
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2.0
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100
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5.2
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23
12
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3629149--3629286
47
3.0
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11
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3.9
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0
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2
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3630652--3630686
18
1.9
18
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0
61
51
2
2
42
1.31
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2.1
17
100
0
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36
11
5
47
1.63
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1.9
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3
100
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10
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1.77
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20
1.9
20
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0
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28
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1.76
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40
1.9
40
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5
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18
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177
0
59
0
39
1.03
3645607--3645833
10
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10
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0
177
0
59
0
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1.03
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144
1
61
0
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1.03
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2.1
25
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6
81
51
0
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46
1.11
3647472--3647525
26
2.1
26
89
6
83
51
0
1
46
1.11
3647464--3647529
27
2.4
29
80
14
86
50
0
1
48
1.10
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
3648039--3648154
54
2.1
54
81
12
132
46
3
7
42
1.49
3653096--3653199
56
1.9
54
86
7
149
20
18
21
40
1.92
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0
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0
0
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2.2
20
100
0
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30
13
9
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1.75
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100
0
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0
0
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1
54
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18
2.0
18
100
0
72
44
0
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50
1.25
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65
11
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1.44
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19
2.0
20
85
4
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2
5
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2.1
16
100
0
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19
9
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1.84
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19
8.2
19
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215
36
15
9
38
1.80
3700288--3700450
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4.4
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10
181
37
15
9
37
1.80
3700299--3700450
54
2.7
55
90
4
243
36
15
9
38
1.80
3700299--3700446
73
2.0
74
87
7
212
36
15
9
38
1.80
3701518--3701674
79
2.0
79
88
0
233
43
16
10
29
1.81
3704941--3704973
16
2.1
16
88
11
50
48
0
3
48
1.17
3713135--3713180
23
2.0
23
95
4
85
39
26
17
17
1.91
3713368--3713442
28
2.6
29
85
2
107
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4
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1.66
3719334--3719408
31
2.4
31
97
0
141
17
21
8
53
1.69
3724423--3724594
75
2.4
73
80
8
199
34
22
11
32
1.89
3724428--3724594
35
4.6
38
78
11
163
34
22
10
32
1.89
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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0
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25
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36
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467
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19
35
1.90
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1.9
31
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10
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1.71
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2.2
43
92
3
152
30
31
16
22
1.95
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1.9
13
100
0
50
32
12
32
24
1.91
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2.0
22
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0
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15
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2.0
22
91
0
72
48
15
2
33
1.57
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2.0
94
94
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14
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59
100
0
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2.0
28
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0
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43
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19
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0
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20
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2.0
171
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0
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39
10
25
25
1.87
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21
2.0
21
90
0
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19
29
21
29
1.98
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18
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0
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56
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1.37
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31
2.6
31
88
4
117
18
26
8
46
1.78
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
3844197--3844222
3
8.7
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100
0
52
0
0
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0.89
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3.0
19
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11
70
38
1
1
58
1.18
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3.0
20
88
7
70
43
0
0
56
0.99
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2.4
20
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80
38
0
0
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100
0
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28
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13
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1.76
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18
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47
0
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21
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0
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4
115
37
6
3
52
1.45
3856610--3856966
184
1.9
184
84
2
475
20
23
20
35
1.96
3860092--3860143
22
2.2
26
77
19
60
23
5
9
61
1.48
3860851--3860971
44
2.8
44
84
5
147
45
9
15
28
1.78
3863423--3863459
19
1.9
19
94
0
65
35
0
18
45
1.50
3863673--3863848
41
4.3
41
91
0
280
29
19
27
23
1.98
3863673--3863842
82
2.1
82
98
0
331
29
18
28
23
1.98
3865486--3865543
30
1.9
30
85
0
80
36
3
22
37
1.71
3872462--3872491
5
6.2
5
92
7
53
0
63
0
36
0.95
3876293--3876517
110
2.0
110
99
0
441
35
13
24
26
1.93
3887198--3887250
13
4.1
13
78
9
63
30
7
26
35
1.84
3888309--3888380
31
2.3
30
81
6
90
23
9
11
55
1.64
3892593--3892636
23
1.9
23
100
0
88
27
11
13
47
1.77
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
3900062--3900125
24
2.7
24
95
0
110
10
29
20
39
1.87
3902706--3902752
21
2.2
22
85
11
71
57
8
0
34
1.29
3902742--3902783
17
2.5
17
81
11
50
52
4
0
42
1.22
3902742--3902822
18
4.5
18
72
7
58
54
3
0
41
1.18
3902752--3902819
35
1.9
36
84
3
93
51
4
0
44
1.21
3905994--3906033
19
2.2
18
86
4
53
50
0
10
40
1.36
3908418--3908554
60
2.3
59
83
8
161
29
20
24
26
1.99
3910737--3910844
19
5.6
19
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20
116
9
26
25
38
1.86
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39
3.4
39
95
0
230
12
26
24
37
1.90
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21
2.4
21
80
16
66
79
2
0
18
0.83
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15
3.2
17
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21
54
79
2
0
18
0.83
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50
3.3
50
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4
219
31
12
17
39
1.86
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26
2.0
26
100
0
104
23
15
15
46
1.83
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21
2.0
21
95
0
77
23
6
16
53
1.67
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16
1.9
16
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0
53
45
19
0
35
1.51
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18
2.4
18
96
0
77
46
2
0
51
1.13
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18
2.6
16
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13
61
47
0
0
52
1.00
3950367--3950428
32
1.9
33
86
3
90
51
6
3
38
1.44
3950404--3950436
14
2.4
14
90
5
50
57
3
0
39
1.14
3951483--3951529
19
2.3
20
80
20
62
78
0
4
17
0.90
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13
3.2
13
84
9
54
80
0
4
15
0.87
3955824--3955850
12
2.2
12
100
0
54
7
0
33
59
1.25
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
3956052--3956116
32
2.0
32
93
0
112
52
7
23
16
1.70
3960223--3960255
17
1.9
17
100
0
66
36
0
0
63
0.95
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44
2.1
44
88
7
136
35
25
5
34
1.79
3960505--3960560
16
3.5
16
92
0
94
28
30
7
33
1.84
3961090--3961121
14
2.1
16
88
11
50
34
6
3
56
1.40
3961104--3961204
31
3.2
30
78
12
96
32
6
2
57
1.40
3961109--3961189
34
2.5
33
80
11
96
35
6
2
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1.38
3965222--3965495
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6.0
46
92
0
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22
24
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6
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1.58
3970370--3970408
18
2.0
20
90
9
64
46
0
0
53
1.00

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          321   322   323   324   325