Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A03
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  105315579

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
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          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   

This is table  247  of  325  ( 38900 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
80632711--80632736
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13
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0
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2.0
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0
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1.72
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2.2
22
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1.79
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5.8
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80673315--80673682
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27
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28
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10.6
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548
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8
28
28
1.86
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2.0
34
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0
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1.91
80677001--80677160
83
2.0
81
93
2
275
35
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29
26
1.86
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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680
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19
23
24
1.97
80687139--80687586
231
1.9
234
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2
724
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23
24
1.97
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4.1
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202
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13
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2.7
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19
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80688150--80688263
19
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15
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0
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0
100
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2.1
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100
0
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4.5
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5
4
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23
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3
94
0
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30
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0
35
1.58
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
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T
Entropy
(0-2)
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1.99
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4
183
27
26
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1.99
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32
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2.5
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1.61
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23
2.0
23
84
16
60
32
0
8
58
1.28
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
80824468--80824494
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0
54
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0
0
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0
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30
13
0
55
1.39
80843615--80844453
89
9.6
88
73
15
572
28
16
18
36
1.93
80843725--80843878
77
2.0
77
87
2
220
28
20
19
31
1.97
80843558--80844318
166
4.5
164
78
11
725
28
16
18
35
1.93
80843891--80844367
260
1.8
259
84
7
603
29
16
19
34
1.93
80844144--80844406
91
2.9
88
80
8
282
28
16
18
36
1.93
80846199--80846290
3
31.7
3
70
8
57
29
3
3
64
1.25
80846579--80846643
22
3.0
21
76
17
69
33
3
6
56
1.39
80846642--80846694
26
1.9
29
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11
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26
11
3
58
1.49
80846944--80846991
3
16.0
3
100
0
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0
0
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0.92
80847004--80847028
10
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0
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0
8
52
1.31
80846953--80847022
24
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23
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14
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32
0
5
61
1.20
80850713--80850760
24
2.1
22
84
7
60
31
10
25
33
1.89
80858247--80858330
25
3.4
25
85
6
109
26
23
20
29
1.99
80858397--80858435
11
3.7
11
80
13
55
33
20
10
35
1.86
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
80858380--80858454
20
3.8
20
89
6
102
36
18
9
36
1.83
80858397--80858453
9
5.8
10
76
15
57
35
19
8
36
1.83
80866318--80866440
26
4.8
26
95
1
205
26
23
24
26
2.00
80866491--80866546
20
2.9
20
87
10
73
32
19
8
39
1.83
80869917--80869985
34
2.0
34
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0
129
30
7
31
30
1.84
80871508--80871563
26
2.1
27
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3
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3
19
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1.69
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2.1
30
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0
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40
19
12
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1.88
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2.2
16
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0
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0
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15
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0
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30
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2.1
15
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0
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0
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0
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5
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66
0
9
23
1.21
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3
20.3
3
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6
52
68
0
5
26
1.10
80894917--80895002
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2.0
43
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4
104
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1
6
25
1.24
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2.0
19
100
0
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0
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26
4.2
26
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0
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6
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24
2.1
22
75
20
53
61
4
8
25
1.43
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44
2.5
44
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140
30
25
17
26
1.98
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2.6
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10
140
27
22
13
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1.92
80906024--80906058
16
2.2
16
100
0
70
22
22
5
48
1.72
80906896--80907013
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2.6
45
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4
132
28
23
17
29
1.97
80906904--80907141
122
2.0
122
83
3
300
28
21
19
31
1.97
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
80915205--80915252
19
2.5
20
82
6
62
47
6
18
27
1.72
80928994--80929165
93
1.8
93
93
0
299
27
30
20
20
1.98
80928987--80929162
46
3.8
46
79
12
198
28
30
20
20
1.98
80933896--80933942
24
2.1
22
75
20
53
61
4
8
25
1.43
80943430--80943472
19
2.4
17
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17
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51
0
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4.0
45
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7
204
32
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17
22
1.96
80945573--80945736
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0
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15
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51
20
0
27
1.47
80951528--80951560
12
2.7
13
90
9
52
57
3
0
39
1.14

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          321   322   323   324   325