Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A03
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  105315579

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   

This is table  50  of  325  ( 38900 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
15028885--15028929
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0
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2.3
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0
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0
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46
1.22
15032186--15032251
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1
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1.26
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2.7
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1
209
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2.8
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43
0
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0
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26
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23
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59
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2.0
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3.1
16
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2
0
43
1.12
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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15
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5
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1.45
15101232--15101306
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12
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0
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25
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76
15
56
59
0
5
34
1.21
15101478--15101555
22
3.6
21
70
22
63
67
0
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1.14
15111172--15111226
22
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19
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21
0.95
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10
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36
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1.09
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0
0.94
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2.7
217
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10
274
30
0
15
53
1.45
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2.0
22
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2.0
45
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20
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2.2
24
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24
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0
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101
1
11
29
58
1.41
15200529--15200608
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3.7
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1
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0
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30
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1.94
15257073--15257148
32
2.5
31
80
4
82
27
11
19
40
1.87
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
15260437--15260478
9
4.4
9
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6
57
4
11
0
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0.79
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23
24
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1.97
15269079--15269129
22
2.3
21
83
12
59
35
0
1
62
1.06
15270837--15270930
26
3.7
26
69
21
67
56
2
2
39
1.23
15273581--15273685
26
4.0
26
93
0
183
32
7
23
36
1.83
15278132--15278166
13
2.6
14
81
9
54
17
17
17
48
1.81
15280647--15280730
42
2.0
42
100
0
168
38
11
11
38
1.79
15281654--15281698
22
2.0
22
82
0
54
55
4
2
37
1.32
15284565--15284598
15
2.2
15
89
5
50
64
0
2
32
1.08
15294623--15294733
42
2.6
42
80
4
116
27
26
20
26
1.99
15294623--15294779
43
3.7
43
75
8
142
26
27
20
25
1.99
15294623--15294779
85
1.8
85
82
5
201
26
27
20
25
1.99
15302501--15302530
13
2.3
13
94
0
51
56
6
6
30
1.51
15309895--15309975
26
3.0
26
80
12
74
39
1
2
56
1.20
15309919--15309983
27
2.4
27
76
7
69
40
1
3
55
1.25
15314746--15314923
27
6.6
27
83
3
205
26
15
28
29
1.96
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
15314747--15314902
82
1.9
81
88
3
233
26
15
28
29
1.96
15314743--15314923
82
2.2
81
83
2
229
27
15
27
29
1.96
15322802--15322979
27
6.6
27
83
3
205
26
15
28
29
1.96
15322803--15322958
82
1.9
81
88
3
233
26
15
28
29
1.96
15322799--15322979
82
2.2
81
83
2
229
27
15
27
29
1.96
15324331--15324722
46
8.4
47
88
2
499
42
15
23
19
1.89
15324331--15324722
93
4.2
92
88
3
536
42
15
23
19
1.89
15326394--15326441
19
2.6
19
87
6
64
43
12
10
33
1.77
15326282--15326559
18
15.1
18
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13
145
38
17
10
33
1.84
15326755--15326840
45
1.9
45
87
0
127
40
18
19
20
1.91
15328434--15328484
22
2.3
22
79
0
57
5
15
1
76
1.07
15328424--15328474
17
3.1
16
78
10
50
5
17
1
74
1.11
15328482--15328506
12
2.1
12
100
0
50
40
0
0
60
0.97
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31
2.0
32
84
9
85
47
4
0
47
1.23
15346377--15346441
30
2.1
29
86
8
85
36
3
0
60
1.13
15346421--15346471
18
2.7
19
78
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59
29
0
3
66
1.09
15351763--15351887
6
19.2
6
69
19
58
4
19
2
73
1.12
15351765--15351885
21
6.1
20
69
17
65
4
19
2
72
1.14
15351763--15351822
13
4.6
13
78
11
61
5
16
1
76
1.04
15355075--15355140
33
2.0
33
90
0
105
30
31
12
25
1.92
15357027--15357067
20
2.0
21
86
13
59
51
0
2
46
1.14
15358045--15358081
16
2.3
16
86
13
58
40
0
0
59
0.97
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
15358180--15358242
20
3.2
19
71
8
54
49
3
0
47
1.17
15371067--15371122
11
5.1
11
80
4
60
51
0
0
48
1.00
15376338--15376363
11
2.4
11
100
0
52
92
0
7
0
0.39
15376770--15376872
43
2.4
43
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3
136
43
9
8
37
1.69
15378850--15378883
10
3.3
10
87
4
50
35
0
8
55
1.31
15379710--15379760
23
2.2
23
78
0
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58
1
0
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1.09
15382241--15382289
24
2.0
24
100
0
98
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20
16
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2.0
31
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0
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1.76
15393147--15393207
24
2.7
23
87
9
90
36
3
6
54
1.43
15393160--15393206
24
2.0
24
100
0
94
38
2
8
51
1.45

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
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          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
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          321   322   323   324   325