Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A03
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  105315579

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          321   322   323   324   325   

This is table  1  of  325  ( 38900 repeats found )

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Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
1--7872
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43
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3.0
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0
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2.0
23
95
0
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27
1.91
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2.3
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10
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29
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48
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2.0
26
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2.1
71
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1
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1.81
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
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Percent
Indels
Score
A
C
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(0-2)
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132
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16
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1.89
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2.2
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172
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1.61
70412--70451
19
2.2
18
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15
2
40
1.60
75036--75128
43
2.2
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3
163
52
13
5
27
1.62
75150--75189
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2.2
18
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4
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42
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76936--76974
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0
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19
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100
0
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0
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3
36
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2.0
22
100
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3
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0
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35
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2.3
29
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30
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131294--131521
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302
3
30
7
58
1.44
131294--131591
132
2.2
132
77
11
290
4
30
8
56
1.49
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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0
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25
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40
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26
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1
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28
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15
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60
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30
18
1.98
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
254522--254546
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0
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1.46
318189--318224
12
3.0
12
83
0
54
50
16
5
27
1.68
322632--322682
26
2.0
26
84
7
68
54
7
7
29
1.57
339245--339297
26
2.0
26
96
0
97
43
16
11
28
1.83
343813--343974
81
2.0
81
81
4
193
21
11
19
47
1.80
348541--348566
7
3.7
7
100
0
52
42
0
0
57
0.98
351267--351301
18
1.9
18
88
0
52
34
8
22
34
1.85
366765--366853
31
2.9
30
75
11
90
34
14
12
38
1.84
368279--368320
19
2.2
20
86
4
59
59
2
2
35
1.23
369895--369937
11
3.9
11
85
11
61
51
0
2
46
1.13
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
369895--369937
22
1.9
23
90
4
70
51
0
2
46
1.13
369895--369945
17
3.1
17
74
23
54
54
0
1
43
1.11
372610--372653
19
2.3
19
84
11
54
61
2
18
18
1.45
378016--378045
8
3.6
8
91
8
51
76
3
0
20
0.92
378033--378067
10
3.4
10
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4
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0
0
11
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19
2.9
19
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5
65
81
1
0
16
0.79
378016--378068
9
5.7
9
82
8
61
81
1
0
16
0.79
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17
2.0
17
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0
59
32
0
0
67
0.91
378719--378755
14
2.6
15
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8
51
29
0
0
70
0.88
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17
1.9
17
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0
57
57
0
3
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1.14
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2.6
26
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13
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0
7
29
1.21
385466--385527
29
2.1
29
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5
72
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0
6
29
1.18
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11
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15
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55
1
1
40
1.22
385682--385755
23
3.2
23
77
17
73
59
2
1
36
1.20
385944--386000
24
2.4
24
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0
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8
3
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1.42
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44
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2
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22
32
16
29
1.95
387852--387899
24
2.0
24
100
0
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20
29
12
37
1.90
387808--387943
68
2.0
68
92
0
227
23
31
13
31
1.93
387876--388018
44
3.3
44
82
7
186
25
30
14
30
1.95
387764--387970
112
1.8
112
89
0
324
25
31
14
28
1.94
387931--388010
40
2.0
40
85
0
106
26
31
16
26
1.96
400435--400469
3
11.7
3
100
0
70
68
0
0
31
0.90
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
400433--400481
9
5.4
9
92
0
62
67
8
0
24
1.18
400678--400730
24
2.2
24
86
0
70
62
9
5
22
1.47
401560--401589
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2.3
13
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0
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90
0
6
3
0.56
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24
3.5
24
91
0
121
33
28
14
22
1.94
411167--411250
24
3.5
23
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6
105
34
27
14
23
1.94
414997--415047
20
2.5
20
90
0
75
43
7
23
25
1.81
427180--427883
364
1.9
362
90
1
1122
35
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9
38
1.80
437372--437679
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7.5
41
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20
133
16
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51
22
1.73
437539--437713
42
4.2
41
68
19
112
17
9
50
22
1.75
437658--437805
69
2.1
69
88
0
215
16
10
47
24
1.78

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          321   322   323   324   325