Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A03
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  105315579

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   

This is table  298  of  325  ( 38900 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
97158254--97158314
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30
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2.0
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0
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452
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179
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2.0
56
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1.9
20
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0
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71
1.14
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
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T
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220
2.6
220
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0
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20
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12
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0
3
26
1.03
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2.0
57
98
0
217
23
7
10
58
1.58
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
97333556--97333810
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11
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30
1.67
97334163--97334314
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0
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20
28
26
1.99
97336113--97336274
39
4.2
39
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0
191
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20
29
27
1.99
97338610--97338639
15
2.0
15
93
0
51
43
30
0
26
1.55
97338663--97338696
14
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14
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0
59
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0
20
1.51
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40
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0
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28
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97339203--97339457
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136
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0
375
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97342135--97342175
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21
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2
0
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0
0
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1
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1.20
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11
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25
0
2
72
0.98
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3
22.3
3
80
12
73
32
1
0
66
1.01
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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125
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16
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53
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29
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3
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13
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1.84
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20
2.9
21
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0
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2.1
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38
2
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2.0
20
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14
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2.0
20
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29
100
0
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17
10
30
1.84
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
97436306--97436364
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2.5
24
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2.7
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3.6
25
95
0
155
26
13
30
29
1.94

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          321   322   323   324   325