Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A03
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  105315579

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   

This is table  28  of  325  ( 38900 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
8577690--8577869
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2.3
42
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1.96
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5.8
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26
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27
1.98
8586037--8586213
60
2.9
62
91
4
279
26
18
27
27
1.98
8586037--8586213
91
1.9
92
89
3
277
26
18
27
27
1.98
8586238--8586402
47
3.7
46
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6
169
28
15
26
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1.96
8586332--8586446
42
2.7
43
89
4
171
30
14
26
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1.95
8594373--8594552
31
5.8
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90
3
274
28
19
26
26
1.99
8594577--8594701
47
2.7
45
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3
151
28
16
27
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1.97
8594628--8594767
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3.3
42
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15
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31
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274
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19
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26
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26
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132
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1.95
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42
2.7
42
83
4
151
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14
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26
1.95
8615758--8615823
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2.3
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2.0
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108
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8629483--8629622
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4.9
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119
23
16
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8629740--8629884
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2.5
59
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11
174
50
9
17
22
1.75
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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3.2
29
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9
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44
10
10
1.74
8632528--8632619
27
3.3
27
82
8
112
33
44
10
10
1.74
8636237--8636324
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2.1
42
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8638566--8638622
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1.64
8638570--8638646
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11
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54
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0
2
28
1.04
8647069--8647105
13
3.1
12
88
11
58
64
0
2
32
1.07
8646911--8647428
148
3.5
150
87
4
744
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5
7
30
1.51
8649973--8650034
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2.3
27
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41
6
9
41
1.63
8650315--8650363
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2.5
20
93
0
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8
16
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1.33
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0
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17
1.9
18
94
5
61
76
8
2
11
1.12
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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0
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0
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2.2
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178
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2
154
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19
25
25
1.98
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2.1
222
94
0
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19
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1.98
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2.0
578
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1
2013
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19
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1.9
756
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19
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1.98
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20
21
26
1.98
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32
21
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1.98
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10
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0
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0
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1.9
120
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1
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16
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1.98
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2.0
20
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25
0
5
69
1.09
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
8699577--8699646
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30
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14
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2.1
18
94
0
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24
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15
37
1.90
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2.1
37
85
4
102
39
22
2
35
1.68
8722928--8723008
30
2.7
29
83
5
99
43
18
2
35
1.64
8724100--8724128
14
2.0
15
93
6
51
44
41
0
13
1.44
8726529--8726572
3
14.7
3
100
0
88
65
0
34
0
0.93
8728565--8728599
4
8.5
4
93
6
61
0
25
45
28
1.54
8735171--8735244
31
2.4
31
95
0
130
20
32
28
18
1.96
8740635--8740660
5
5.2
5
100
0
52
80
0
19
0
0.71
8741088--8741212
57
2.2
55
85
2
160
26
8
14
50
1.72
8741161--8741253
21
4.5
21
67
24
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25
8
13
51
1.70
8741087--8741303
61
3.8
55
77
8
200
26
9
15
49
1.74
8742093--8742124
14
2.3
14
100
0
64
40
15
6
37
1.73
8743683--8743723
11
3.7
11
80
0
55
19
14
9
56
1.66
8746054--8746152
35
2.8
35
76
8
103
43
16
9
31
1.79
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
8753713--8753849
35
3.9
35
74
9
118
40
18
9
30
1.83
8754606--8754664
30
1.9
31
86
3
84
47
3
20
28
1.66
8754918--8754942
8
3.1
8
100
0
50
24
0
0
76
0.80
8756382--8756435
25
2.0
25
86
10
72
31
1
1
64
1.14
8756382--8756435
3
18.3
3
81
11
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31
1
1
64
1.14
8756967--8757023
24
2.3
25
81
3
71
42
8
1
47
1.45
8757180--8757274
22
4.0
23
71
16
70
31
9
5
53
1.55
8757550--8757578
11
2.7
11
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5
51
37
0
6
55
1.27
8757562--8757622
20
3.0
20
72
13
52
32
6
6
54
1.52
8761042--8761173
51
2.6
51
87
0
201
27
27
16
28
1.97
8763204--8763284
38
2.1
38
100
0
162
22
35
2
39
1.67
8764567--8764618
16
3.2
16
94
0
86
28
0
36
34
1.58
8764599--8764693
45
2.1
44
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1
136
34
5
27
32
1.79
8764855--8764889
18
2.0
17
88
5
52
54
0
0
45
0.99
8764813--8764885
27
2.7
27
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8
76
52
2
0
45
1.15
8765002--8765036
18
2.0
17
88
5
52
54
0
0
45
0.99
8764774--8765048
147
1.9
149
96
1
509
46
3
2
47
1.33
8765022--8765200
55
3.1
54
64
22
128
49
7
2
41
1.43
8765122--8765156
18
2.0
17
88
5
52
60
0
0
40
0.97
8765232--8765263
16
1.9
17
93
6
57
46
0
0
53
1.00
8764985--8765277
120
2.4
120
92
2
482
50
5
2
42
1.36
8765293--8765481
91
2.1
91
85
2
254
48
3
4
44
1.38
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
8766014--8766043
12
2.5
12
94
0
51
43
20
23
13
1.86
8766305--8766335
14
2.2
14
100
0
62
45
29
6
19
1.75
8776513--8776594
41
2.0
41
92
4
139
45
4
21
28
1.73
8777300--8777713
206
2.0
206
100
0
828
35
19
13
31
1.90
8778139--8778198
30
2.1
28
87
12
86
11
25
36
26
1.90
8781630--8781680
20
2.5
20
81
12
59
49
1
0
49
1.12
8781637--8781715
25
3.2
24
73
18
63
46
3
1
48
1.28
8789731--8790080
3
115.0
3
70
12
160
61
3
6
28
1.39
8789797--8789877
41
2.0
41
85
4
110
61
6
4
27
1.40
8789933--8790069
25
5.8
24
69
17
79
59
3
7
29
1.41

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          321   322   323   324   325