Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A03
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  105315579

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
          81   82   83   84   85   86   87   88   89   90   91   92   93   94   95   96   
          97   98   99   100   101   102   103   104   105   106   107   108   109   110   111   112   
          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
          193   194   195   196   197   198   199   200   201   202   203   204   205   206   207   208   
          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   

This is table  190  of  325  ( 38900 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
61685302--61685331
7
4.3
7
95
0
51
3
26
60
10
1.45
61689526--61689566
19
2.2
19
91
8
66
31
9
7
51
1.62
61691672--61691762
45
2.0
45
91
0
146
37
26
10
25
1.89
61695823--61695848
7
3.7
7
100
0
52
26
0
0
73
0.84
61711216--61711386
45
3.9
45
87
3
224
24
30
22
22
1.99
61719529--61719567
16
2.3
18
82
13
55
74
2
0
23
0.94
61720522--61720595
4
19.5
4
81
10
66
0
52
0
47
1.00
61720522--61720594
22
3.3
22
94
0
119
0
53
0
46
1.00
61720535--61720595
26
2.3
26
91
0
95
0
50
0
49
1.00
61720522--61720581
18
3.3
18
83
0
66
0
56
0
43
0.99
61727564--61727623
16
3.8
16
86
0
84
36
0
33
30
1.58
61727564--61727625
32
1.9
32
90
0
97
37
0
33
29
1.58
61727601--61727711
45
2.6
43
80
12
133
35
5
27
31
1.80
61727951--61727997
16
3.0
16
78
12
53
51
2
0
46
1.13
61727835--61728371
120
4.5
121
93
0
850
50
5
2
41
1.39
61728096--61728130
18
2.0
17
88
5
52
54
0
0
45
0.99
61728122--61728151
16
1.9
15
93
6
51
50
10
0
40
1.36
61728052--61728357
59
5.1
58
66
16
158
50
4
2
41
1.39
61728353--61728520
47
3.7
46
70
18
143
47
3
3
45
1.37
61728368--61728544
91
1.9
92
88
4
254
49
3
2
44
1.33
61728509--61728547
17
2.5
15
84
12
51
58
0
0
41
0.98
61732203--61732257
3
18.7
3
96
3
103
0
30
0
69
0.89
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
61738197--61738362
53
3.1
53
88
6
221
25
15
28
30
1.96
61742146--61742249
42
2.4
44
77
4
113
25
16
22
36
1.94
61742122--61742280
43
3.7
43
75
5
151
25
18
24
32
1.97
61742868--61742921
26
2.1
26
100
0
108
50
3
14
31
1.61
61744747--61744808
21
3.0
21
69
9
63
41
17
24
16
1.89
61763267--61763886
47
12.7
47
86
8
830
29
28
8
33
1.86
61763692--61763734
17
2.6
17
96
3
79
37
25
0
37
1.56
61763596--61763830
113
2.1
113
99
0
463
31
28
6
33
1.83
61763643--61763783
64
2.2
65
93
6
241
32
27
5
34
1.80
61767626--61767928
40
7.6
40
88
1
419
27
27
20
24
1.99
61771185--61771225
19
2.2
19
91
8
66
31
9
7
51
1.62
61771190--61771231
20
2.1
20
86
8
59
30
7
7
54
1.54
61772679--61772722
21
2.1
21
100
0
88
36
29
11
22
1.89
61778769--61778840
21
3.5
21
75
11
60
44
16
18
20
1.87
61789112--61789573
10
47.9
9
80
14
329
57
18
2
21
1.52
61789049--61789506
5
93.4
5
79
16
475
57
18
2
21
1.51
61788975--61789479
65
7.6
66
83
11
403
57
18
2
21
1.52
61788975--61789574
25
25.0
24
77
16
435
56
18
2
21
1.54
61801115--61801379
92
2.9
89
76
12
241
24
29
18
27
1.98
61802730--61802935
46
4.4
47
77
11
176
21
27
21
29
1.99
61806821--61807000
49
3.7
49
75
5
168
24
28
19
27
1.98
61809005--61809050
22
2.1
22
100
0
92
50
19
4
26
1.66
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
61813921--61814019
44
2.2
44
80
5
110
28
26
16
29
1.97
61813937--61814378
44
10.0
44
69
7
232
26
26
16
30
1.97
61813727--61814468
177
4.2
176
85
2
932
27
25
16
29
1.97
61818741--61818790
24
2.1
24
88
0
73
6
20
18
56
1.62
61821146--61821195
23
2.3
21
83
10
64
62
4
0
34
1.14
61821201--61821225
13
1.9
13
100
0
50
64
0
0
36
0.94
61825171--61825392
117
1.9
117
87
0
327
26
23
14
34
1.94
61828958--61829076
46
2.6
44
84
7
141
23
31
16
28
1.96
61840755--61840936
39
4.6
39
81
8
192
24
21
28
25
1.99
61840755--61840936
79
2.3
78
83
6
208
24
21
28
25
1.99
61845258--61845296
21
1.9
21
89
5
62
30
0
12
56
1.37
61845495--61845543
25
2.0
25
95
0
89
10
26
32
30
1.89
61845419--61845683
102
2.6
103
88
6
378
18
20
30
29
1.97
61852573--61852838
104
2.6
103
93
1
444
18
21
30
29
1.97
61854044--61854189
40
3.7
40
86
5
199
26
21
27
24
2.00
61854057--61854223
80
2.1
79
82
5
203
26
20
26
25
1.99
61856848--61856889
20
2.1
20
86
8
59
30
7
7
54
1.54
61857965--61858047
43
1.9
43
97
0
157
33
10
7
48
1.66
61862326--61862530
103
2.0
102
92
2
340
42
15
16
25
1.87
61867494--61867522
13
2.2
13
100
0
58
24
20
24
31
1.98
61877765--61877863
49
2.0
49
98
0
189
47
17
2
33
1.59
61888973--61889010
3
12.7
3
100
0
76
34
0
0
65
0.93
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
61892999--61893081
43
1.9
43
87
4
123
21
22
30
25
1.99
61893814--61893855
20
2.1
20
100
0
84
50
16
19
14
1.79
61898155--61898191
6
6.2
6
93
0
65
81
2
0
16
0.81
61906554--61906618
28
2.3
28
89
5
96
33
26
7
32
1.85
61906724--61906814
28
3.2
28
87
4
121
23
24
20
31
1.98
61911638--61911674
6
6.2
6
87
0
56
78
2
2
16
0.98
61914859--61915018
80
2.0
80
96
0
293
39
20
10
30
1.85
61919734--61919938
106
1.9
106
97
0
392
38
9
14
37
1.79
61920398--61920472
25
3.1
25
60
21
59
25
20
25
29
1.99
61920377--61920472
48
2.0
48
97
0
183
28
18
23
29
1.98
61920394--61920468
23
3.2
23
62
20
55
28
18
25
28
1.98
61922085--61922424
45
7.6
45
85
2
425
24
19
27
28
1.99
61929247--61929299
21
2.5
21
82
14
65
49
1
0
49
1.12
61944107--61944220
57
2.0
57
98
0
219
32
17
18
31
1.94
61957513--61957762
50
5.0
50
76
1
241
26
17
26
29
1.98
61957518--61957699
101
1.8
101
88
0
283
28
18
24
28
1.98
61961891--61961989
42
2.3
42
82
5
119
33
23
17
26
1.96
61961870--61962043
43
4.0
44
77
8
144
34
24
16
24
1.95
61967147--61967234
30
2.9
30
78
6
88
29
23
17
29
1.97
61969765--61969842
41
1.9
40
84
10
104
16
39
23
20
1.92
61970693--61970867
46
3.8
48
86
5
209
24
21
30
23
1.99
61973079--61973252
46
3.7
46
78
7
190
22
29
20
27
1.98
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
61998124--61998164
18
2.3
19
83
12
59
65
0
0
34
0.93
61998114--61998223
36
2.8
36
69
27
89
60
0
0
37
1.09
61998116--61998201
43
2.0
43
84
8
113
63
0
1
34
1.02
61998362--61998469
17
6.2
18
69
12
55
32
1
0
64
1.10
61998371--61998426
17
3.3
17
78
12
62
26
3
0
69
1.04
61998370--61998432
26
2.5
25
84
5
81
25
3
0
71
1.01
61998456--61998481
9
2.9
9
100
0
52
19
0
0
80
0.71
62004585--62004719
40
3.4
40
94
2
236
28
25
22
22
1.99
62006548--62006716
46
3.7
46
91
1
241
40
12
23
23
1.89
62008717--62008907
105
1.9
101
82
8
242
25
26
16
31
1.97
62009448--62009476
14
2.1
14
100
0
58
20
6
6
65
1.40
62009723--62009803
39
2.1
39
100
0
162
29
7
24
38
1.83
62015714--62015762
16
3.3
15
83
8
64
48
0
0
51
1.00
62015881--62015943
32
2.0
32
84
6
83
44
6
6
42
1.55
62020157--62020194
20
1.9
19
89
5
58
31
5
13
50
1.63
62024839--62024905
32
2.1
32
100
0
134
58
0
8
32
1.29
62028758--62028810
3
18.0
3
82
3
54
32
7
1
58
1.37
62028766--62028827
29
2.2
27
86
11
81
29
12
3
54
1.53
62028980--62029025
21
2.2
21
84
0
56
28
8
4
58
1.47
62029047--62029106
3
20.0
3
78
0
66
33
5
3
58
1.36
62030523--62030564
18
2.2
20
91
8
70
64
4
0
30
1.14
62032300--62032334
17
2.1
17
88
0
52
37
2
8
51
1.47
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
62037030--62037087
30
2.0
29
89
3
89
58
17
15
8
1.61
62037029--62037082
15
3.7
15
78
11
58
59
18
14
7
1.58
62040282--62040414
46
2.9
46
81
9
130
33
21
21
23
1.98
62042476--62042500
10
2.5
10
100
0
50
40
8
0
52
1.31
62043132--62043180
20
2.5
20
96
0
89
32
34
12
20
1.90
62049918--62049969
26
2.0
26
96
0
95
13
23
34
28
1.92
62049841--62050207
103
3.6
104
93
3
627
18
20
30
30
1.97
62056794--62057164
104
3.6
104
92
2
613
18
19
30
30
1.96
62057081--62057132
26
2.0
26
96
0
95
13
23
34
28
1.92
62066600--62066713
57
2.0
57
94
0
201
33
15
25
25
1.95

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
          81   82   83   84   85   86   87   88   89   90   91   92   93   94   95   96   
          97   98   99   100   101   102   103   104   105   106   107   108   109   110   111   112   
          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
          193   194   195   196   197   198   199   200   201   202   203   204   205   206   207   208   
          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325