Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A03
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  105315579

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          321   322   323   324   325   

This is table  283  of  325  ( 38900 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
92553199--92553615
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92553199--92553615
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20
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43
1.32
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
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2.4
25
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26
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20
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1.98
92633965--92634206
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2.0
123
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371
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1.98
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1
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1.53
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
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(0-2)
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18
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34
0.93
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
92721902--92721941
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0
187
20
19
28
30
1.97
92745407--92745438
15
2.1
15
94
0
55
40
21
6
31
1.78
92748385--92748444
21
3.0
21
88
9
81
16
18
20
45
1.86
92748396--92748458
21
3.2
20
84
13
78
12
22
20
44
1.85
92753486--92753637
42
3.6
42
74
0
160
19
19
13
47
1.82
92753490--92753679
84
2.3
84
85
1
256
20
20
14
45
1.85
92753534--92753701
21
8.1
21
70
7
85
17
21
15
45
1.85
92753539--92753682
42
3.4
42
76
9
150
17
21
15
45
1.85
92754655--92754699
23
1.9
24
81
4
56
22
8
20
48
1.76
92755967--92756068
51
2.0
51
100
0
204
33
7
25
33
1.85
92758442--92758581
44
3.0
44
76
17
147
21
17
27
33
1.95
92758480--92758586
52
2.0
53
87
1
153
23
16
26
33
1.96
92766470--92766521
23
2.3
21
81
18
68
28
17
17
36
1.92
92765855--92767109
637
2.0
639
97
0
2388
34
19
9
35
1.85
92772506--92772534
14
2.0
15
93
6
51
62
10
13
13
1.55
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
92772611--92772710
11
9.3
11
70
20
68
57
5
3
35
1.36
92772642--92772681
14
2.7
15
84
7
55
62
2
0
35
1.09
92772632--92772682
15
3.5
15
78
5
59
60
3
0
35
1.15
92772605--92772710
20
5.1
20
74
21
76
56
4
2
35
1.35
92772696--92772781
27
3.3
24
80
9
82
52
6
8
32
1.58
92773048--92773074
3
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3
100
0
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0
0
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2.0
24
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0
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60
0
6
33
1.22
92773169--92773225
3
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3
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10
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0
5
35
1.20
92773282--92773350
19
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26
1.44
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20
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20
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8
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64
2
10
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1.39
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5
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0
69
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0
0
56
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19
2.0
20
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4
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77
2
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5
1.04
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13
1.9
13
100
0
50
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0
32
0
0.90
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18
4.6
18
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0
110
31
10
19
37
1.87
92776155--92776236
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2.3
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0
128
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10
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37
1.87
92776200--92776253
28
1.9
28
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7
74
33
9
18
38
1.83
92781763--92781869
26
4.1
26
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0
178
34
24
8
32
1.85
92783065--92783191
44
2.9
43
79
9
150
31
28
16
23
1.96
92783678--92783718
20
2.0
20
100
0
82
39
19
4
36
1.73
92786982--92787050
33
2.1
33
89
8
104
46
0
11
42
1.40
92787852--92787880
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1.9
15
100
0
58
34
0
0
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18
2.1
18
100
0
76
57
10
21
10
1.61
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
92789274--92789327
25
2.2
25
100
0
108
33
24
7
35
1.83
92800539--92800608
25
2.8
25
95
0
131
25
27
22
24
2.00
92810290--92810337
20
2.3
21
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80
35
10
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1.85
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20
100
0
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0
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20
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23
0
5
71
1.05
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27
0
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0
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13
3.5
12
81
18
52
4
11
0
83
0.79

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          321   322   323   324   325