Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A03
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  105315579

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
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          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   

This is table  39  of  325  ( 38900 repeats found )

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Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
11681409--11681449
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2.2
19
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0
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0
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0
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100
0
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27
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21
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36
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93
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20
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3.0
54
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220
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4.2
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11753948--11754014
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2.3
28
92
2
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38
4
16
40
1.69
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2.2
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1.9
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2.1
15
100
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12
12
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2.1
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11781510--11781679
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2
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1.26
11781516--11781679
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1
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30
2
2
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0
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4.9
46
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0
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26
22
1.95
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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24
25
1.98
11789011--11789574
263
2.2
257
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810
29
19
24
25
1.98
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2.0
25
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2
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1.26
11790329--11790497
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22
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19
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2
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1.26
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0
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0.82
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
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Entropy
(0-2)
11824699--11824741
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0
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13
55
1.39
11836797--11836829
6
5.5
6
96
0
57
15
3
0
81
0.80
11839790--11839818
13
2.2
13
100
0
58
31
0
13
55
1.39
11855889--11856243
47
7.6
46
71
14
219
22
29
21
26
1.99
11855880--11856243
94
3.9
93
78
10
359
21
29
21
27
1.99
11855888--11856243
141
2.5
138
77
8
362
22
29
21
26
1.99
11859029--11859060
13
2.5
13
100
0
64
37
0
12
50
1.41
11859076--11859139
20
3.2
20
80
4
76
42
25
23
9
1.84
11861700--11861896
41
4.8
41
91
5
308
28
21
22
27
1.99
11862111--11862208
33
2.9
33
84
7
108
30
10
22
36
1.87
11869372--11869568
41
4.8
41
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5
308
28
21
22
27
1.99
11869799--11869881
32
2.4
32
86
9
103
28
12
25
33
1.92
11872228--11872310
31
2.6
31
80
3
85
59
19
6
15
1.57
11872542--11872594
21
2.5
21
87
0
79
5
49
16
28
1.69
11878165--11878285
9
13.6
9
69
12
54
34
2
19
42
1.65
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
11878215--11878302
43
2.0
43
88
2
131
36
1
17
45
1.56
11878239--11878449
113
1.9
112
91
3
343
34
0
16
48
1.53
11878395--11878424
13
2.3
13
100
0
60
36
0
10
53
1.35
11878427--11878475
9
5.4
9
90
0
80
28
0
20
51
1.48
11878427--11878473
18
2.6
18
100
0
94
27
0
21
51
1.48
11878239--11878453
56
3.8
56
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4
326
34
0
16
47
1.53
11878882--11878972
36
2.5
37
75
22
104
51
2
9
36
1.47
11882555--11882713
26
6.2
26
92
1
266
36
25
5
32
1.80
11882555--11882713
77
2.1
77
95
1
246
36
25
5
32
1.80
11884131--11884179
18
2.7
18
81
9
55
40
0
0
59
0.98
11885639--11885761
60
2.1
60
87
1
176
35
3
39
21
1.70
11885852--11886302
230
2.0
229
81
3
530
37
23
14
24
1.92
11885839--11886376
114
4.7
114
82
5
550
36
24
14
24
1.93
11887249--11887281
17
2.0
17
88
5
50
12
0
45
42
1.41
11887235--11887329
45
2.2
43
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3
118
16
0
34
48
1.47
11887334--11887469
41
3.3
40
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8
150
19
21
23
36
1.95
11894700--11894760
17
3.6
17
81
0
77
37
34
14
13
1.85
11894700--11894775
34
2.2
34
83
0
98
34
34
17
14
1.90
11899087--11899124
19
2.0
19
89
0
58
28
7
28
34
1.85
11899853--11899895
18
2.5
17
85
7
52
34
20
16
27
1.94
11901935--11901986
25
2.1
25
100
0
104
19
9
23
48
1.78
11903754--11903783
14
2.1
14
93
0
51
56
6
16
20
1.62
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
11904418--11904451
15
2.3
15
89
0
50
58
5
2
32
1.37
11906014--11906059
22
2.1
22
95
0
83
41
8
8
41
1.67
11912397--11912429
16
2.1
16
100
0
66
33
36
0
30
1.58
11920329--11920361
17
1.9
17
100
0
66
24
21
6
48
1.72
11924186--11924215
12
2.5
12
94
0
51
13
23
20
43
1.86
11924729--11924936
91
2.3
91
86
2
274
45
4
3
46
1.41
11924966--11924997
16
1.9
17
93
6
57
53
0
0
46
1.00
11924952--11925244
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2.4
120
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459
42
2
4
50
1.36
11925193--11925227
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2.0
17
88
5
52
45
0
0
54
0.99
11925181--11925449
147
1.9
143
92
4
450
47
2
2
47
1.31

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          321   322   323   324   325