Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A03
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  105315579

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
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          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   

This is table  294  of  325  ( 38900 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
95970564--95970602
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1.59
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2.2
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0
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1
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5
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36
1.80
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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0
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25
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1
66
1.27
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0
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10
0
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113
24
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11
48
1.78
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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25
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1.84
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0
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169
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23
14
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1.94
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2.9
43
80
0
108
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30
1.92
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50
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2
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1.28
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17
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1.80
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1.8
167
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17
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1.81
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2.0
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198
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17
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1.81
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1
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1.10
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0
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1.95
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2.4
13
94
5
53
13
0
0
86
0.57
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
96143837--96143869
14
2.4
14
85
15
50
27
15
6
51
1.66
96146525--96146554
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2.0
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100
0
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20
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1.89
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1.84
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2
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1.16
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29
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51
3
5
39
1.42
96183183--96183241
29
2.0
29
96
0
109
40
10
6
42
1.65
96183898--96183946
22
2.2
22
81
0
53
22
4
30
42
1.72
96185541--96185576
9
3.9
9
89
7
54
58
5
0
36
1.22
96185541--96185576
19
1.9
19
88
5
56
58
5
0
36
1.22
96185977--96186095
31
3.6
31
80
13
123
39
3
3
53
1.34
96186018--96186106
31
2.9
31
90
6
130
35
3
5
55
1.40
96192758--96192802
18
2.4
20
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14
60
48
4
15
31
1.65
96194213--96194241
11
2.6
11
100
0
58
37
17
10
34
1.84
96196990--96197019
16
1.9
16
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53
76
0
0
23
0.78
96201442--96201501
31
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0
5
23
1.05
96201575--96201600
10
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10
100
0
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50
0
0
50
1.00
96212964--96213002
20
2.0
20
85
10
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79
0
12
7
0.93
96212960--96213015
11
5.4
10
79
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80
0
12
7
0.90
96215617--96215650
16
2.2
16
89
5
52
61
5
0
32
1.20
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
96215777--96215891
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3.1
35
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60
2
7
29
1.39
96215559--96215991
74
5.9
73
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1
609
60
3
7
28
1.40
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6
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6
100
0
58
51
0
0
48
1.00
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10
8.9
10
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15
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26
4
0
68
1.09
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29
3.5
29
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28
5
0
67
1.12
96221061--96221148
9
9.3
9
68
18
54
27
4
0
68
1.09
96221046--96221146
48
2.1
48
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5
123
27
4
0
67
1.11
96221245--96221281
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1.9
19
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0
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2
0
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1.42
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1
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1.09
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7
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0
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0
0
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0
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50
2
2
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1.32
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2.0
17
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9
0
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240
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1200
45
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1.63
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16
2.6
17
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62
2
0
35
1.08
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2.3
45
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140
43
18
16
21
1.87
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2.1
40
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116
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19
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1.80
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17
2.1
17
88
0
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0
0
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0.95
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30
2.1
30
90
0
97
58
11
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24
1.56
96236397--96236427
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2.2
14
94
0
53
19
6
12
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1.53
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18
2.2
18
86
8
55
30
0
2
67
1.04
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
96237376--96237412
19
1.9
19
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0
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2
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37
1.62
96237584--96237617
16
2.0
18
88
11
54
38
0
2
58
1.13
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31
2.0
32
85
8
87
45
0
7
46
1.32
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2.1
142
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316
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3
10
40
1.54
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15
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0
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1.40
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0
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0
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0
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30
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29
28
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35
1.82
96242939--96242995
30
1.9
30
85
3
80
29
24
7
38
1.82

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          321   322   323   324   325