Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A03
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  105315579

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          321   322   323   324   325   

This is table  322  of  325  ( 38900 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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22
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48
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1.27
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2.5
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87
48
0
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103750192--103750242
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2.4
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257
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2.0
179
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Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
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G
T
Entropy
(0-2)
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2
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1.09
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
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(0-2)
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11
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30
1.41
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
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Score
A
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Entropy
(0-2)
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18
2.2
18
86
8
55
60
0
0
40
0.97
104123755--104123796
21
2.0
21
100
0
84
33
4
19
42
1.72
104127019--104127089
31
2.3
31
80
4
81
21
8
19
50
1.73
104135695--104135734
22
1.9
22
90
10
66
27
0
5
67
1.11
104136390--104136430
19
2.1
19
86
13
57
73
2
4
19
1.13
104140485--104140617
67
2.0
67
89
2
205
45
17
11
26
1.82
104152912--104152970
9
6.6
9
90
0
82
42
20
10
27
1.84
104152990--104153030
6
6.5
6
83
10
55
17
0
4
78
0.93
104158595--104158629
17
2.0
18
88
5
54
25
37
0
37
1.57
104160499--104160530
14
2.3
14
100
0
64
12
25
6
56
1.59
104162767--104162825
29
2.0
30
83
9
77
35
15
11
37
1.84
104164852--104164890
10
3.9
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0
78
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0
0
28
0.86
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101
6.9
100
74
6
485
31
20
18
29
1.96
104170628--104171305
300
2.3
300
83
3
853
32
20
18
28
1.96
104171308--104171338
15
2.1
15
100
0
62
25
38
0
35
1.56
104172291--104172335
21
2.1
22
83
4
56
42
8
22
26
1.83
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
104176029--104176112
29
2.8
30
79
12
102
26
14
11
47
1.78
104176029--104176109
30
2.7
30
78
12
96
27
14
8
49
1.73
104185581--104185640
28
2.1
28
87
6
86
35
0
5
60
1.19
104187405--104187440
17
2.1
17
89
5
54
66
0
0
33
0.92
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16
2.8
16
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6
54
18
11
20
50
1.77
104192083--104192135
16
3.3
16
81
0
52
58
11
1
28
1.43
104195235--104195328
10
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10
72
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55
54
3
1
41
1.23
104195230--104195265
18
2.0
18
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0
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0
0
38
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104195413--104195443
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1.9
16
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0
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35
6
9
48
1.62
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2.2
26
83
6
69
53
0
1
44
1.11
104205262--104205329
21
3.1
21
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14
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20
10
19
50
1.76
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100
0
50
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0
0
68
0.90
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15
2.3
15
100
0
68
50
11
11
26
1.73
104216604--104216672
33
2.1
33
88
0
102
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5
7
1.32
104219186--104219850
197
3.4
194
87
2
913
25
12
20
41
1.87
104220385--104220413
13
2.1
14
93
6
51
0
3
6
89
0.57
104234301--104234359
31
1.9
31
89
0
91
47
10
11
30
1.73
104238601--104238636
16
2.2
16
90
0
54
47
16
0
36
1.47
104241316--104241354
19
2.1
19
85
0
51
61
5
0
33
1.18
104251071--104251187
60
2.0
59
82
1
144
45
14
13
26
1.82
104251155--104251261
31
3.5
30
79
5
117
42
19
11
26
1.84
104252998--104253043
18
2.5
19
75
10
51
43
0
13
43
1.43
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
104255363--104256040
350
1.9
351
88
3
1019
26
14
19
39
1.90
104266796--104266820
9
2.8
9
100
0
50
92
0
0
8
0.40
104269678--104269944
75
3.6
74
90
2
408
14
22
26
36
1.93
104273869--104273916
14
3.5
13
80
11
51
35
0
4
60
1.16
104273874--104273913
14
2.9
14
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55
37
0
5
57
1.21
104280066--104280117
9
5.7
9
73
13
52
73
1
3
21
1.10
104280066--104280116
17
2.8
17
80
13
57
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1
3
21
1.11
104280307--104280354
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4
0
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1.20
104280574--104280599
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2.0
13
100
0
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7
7
0
0.77
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24
2.0
23
82
4
56
56
2
2
39
1.24

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
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          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
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          321   322   323   324   325