Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A03
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  105315579

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
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          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   

This is table  185  of  325  ( 38900 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
60093999--60094029
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1.9
16
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0
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41
0
22
35
1.54
60114320--60114379
22
2.7
22
78
0
66
18
25
18
38
1.93
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17
2.4
17
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0
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1.32
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2.5
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0
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2.9
22
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22
23
19
1.96
60118796--60119002
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150
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10
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1.87
60118824--60118976
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2.8
54
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11
179
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9
24
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1.85
60118958--60119045
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3.3
27
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3
106
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9
20
39
1.83
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2.1
27
90
0
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19
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1.95
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2.4
22
83
0
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1.83
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122
29
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2.3
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20
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1.84
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3.5
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28
7
22
41
1.81
60125992--60126051
22
2.7
22
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21
23
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1.97
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2.9
41
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0
195
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29
21
22
1.99
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27
13.5
27
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181
31
8
19
41
1.80
60126613--60126897
81
3.5
79
77
10
229
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7
18
43
1.78
60126704--60126876
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3.2
53
74
8
154
30
9
18
41
1.83
60126923--60126975
26
2.0
26
92
7
90
33
11
18
35
1.87
60126666--60126975
134
2.3
133
79
2
352
30
8
19
41
1.82
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
60128850--60128877
2
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2
100
0
56
50
0
50
0
1.00
60130755--60130904
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2.0
75
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0
264
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24
16
23
1.95
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27
6.7
27
80
7
177
42
20
8
27
1.82
60137299--60137477
81
2.2
80
82
4
209
42
20
8
27
1.82
60137470--60137792
27
12.0
27
84
0
394
36
18
19
25
1.95
60137995--60138065
25
2.8
24
87
4
88
29
22
22
25
1.99
60137995--60138077
25
3.4
25
79
14
68
31
20
22
25
1.98
60139550--60139574
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1.9
13
100
0
50
40
0
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44
1.47
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21
2.2
21
100
0
94
53
12
12
21
1.72
60149976--60150068
48
1.9
48
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134
30
24
16
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1.96
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19
2.4
19
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56
50
0
9
40
1.34
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5
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5
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17
52
3
27
0
68
1.06
60151683--60151785
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14
69
16
74
3
31
0
65
1.11
60151681--60151787
57
2.0
54
87
9
155
3
30
0
65
1.10
60156505--60156604
29
3.5
28
70
10
94
39
15
24
22
1.92
60156505--60156749
58
4.2
58
79
9
230
39
13
24
22
1.90
60156534--60156762
29
7.9
29
73
7
178
38
14
25
21
1.91
60156502--60156761
87
3.0
87
76
4
220
38
13
25
21
1.91
60165394--60165607
47
4.6
47
89
2
313
32
8
30
28
1.87
60165726--60165804
37
2.1
37
86
4
106
26
17
30
25
1.97
60166568--60166780
49
4.5
48
77
10
190
26
19
28
25
1.99
60166564--60166689
44
2.8
46
84
9
170
25
19
27
27
1.98
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
60174065--60174324
49
5.5
46
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12
188
26
19
30
24
1.98
60173966--60174324
94
3.8
93
75
8
314
26
19
30
23
1.98
60174107--60174280
44
3.7
45
76
9
145
26
20
28
24
1.99
60177185--60177362
27
6.6
27
81
3
178
26
14
28
30
1.95
60177185--60177362
54
3.3
54
84
3
214
26
14
28
30
1.95
60178914--60179059
48
3.0
48
87
4
204
27
23
19
30
1.98
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2.2
33
78
7
76
27
19
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30
1.98
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2.8
20
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0
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36
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1.89
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3.8
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153
26
20
22
30
1.99
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25
25
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0
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3.7
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20
27
30
1.98
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1.8
93
91
0
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22
20
28
29
1.98
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2.0
20
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451
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8
30
30
1.88
60215145--60215460
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30
30
1.88
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99
24
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25
1.96
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251
22
16
33
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1.95
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29
2.5
29
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94
27
16
30
26
1.97
60218125--60218260
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3.5
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215
25
22
27
24
2.00
60223916--60224248
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329
25
27
21
25
2.00
60223973--60224248
118
2.4
116
82
7
301
25
27
21
25
2.00
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
60223928--60224171
77
3.1
77
84
8
298
26
27
21
25
1.99
60223928--60224211
79
3.6
76
81
8
295
26
26
21
26
1.99
60224553--60224620
29
2.3
29
82
7
84
27
33
14
23
1.94
60224618--60224751
40
3.2
43
91
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233
28
33
14
23
1.94
60226606--60226681
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2.1
37
89
0
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26
31
19
22
1.98
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530
30
30
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30
1.87
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5
532
30
30
8
30
1.87
60249359--60249388
14
2.1
14
93
0
51
56
20
0
23
1.42
60250323--60250475
77
2.0
77
94
0
270
40
9
16
33
1.80
60255606--60255756
45
3.4
45
79
2
144
33
29
14
21
1.93
60258485--60258757
135
2.0
134
92
3
451
39
11
19
29
1.87
60287205--60287249
16
2.8
16
90
6
65
55
22
17
4
1.60
60287205--60287255
8
6.4
8
75
8
50
54
21
17
5
1.63
60287205--60287255
24
2.1
24
85
0
66
54
21
17
5
1.63
60296774--60296883
58
1.9
57
86
1
157
26
15
30
27
1.96
60296761--60296873
29
4.0
29
85
6
142
26
15
30
28
1.96
60307890--60307929
21
1.9
21
89
0
62
45
22
7
25
1.78
60310340--60310385
23
2.0
23
95
0
83
28
13
23
34
1.92
60321390--60321441
15
3.6
14
76
7
59
25
19
25
30
1.98
60321445--60321508
23
2.7
24
90
2
103
39
14
18
28
1.90
60321541--60321624
24
3.5
24
74
6
80
36
10
20
32
1.87
60322111--60322155
17
2.6
17
82
10
56
51
0
8
40
1.33
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
60325054--60325089
18
2.0
18
88
0
54
36
19
19
25
1.95
60326345--60326471
18
6.9
19
81
12
167
36
11
14
37
1.82
60326345--60326471
53
2.3
55
84
8
170
36
11
14
37
1.82
60328458--60328629
93
1.8
93
91
0
281
29
29
19
21
1.98
60328451--60328626
46
3.8
46
75
12
180
30
28
19
21
1.97
60335591--60335796
87
2.4
86
84
8
262
32
22
22
22
1.98
60335921--60336617
207
3.4
207
91
1
1112
30
17
22
29
1.97
60336930--60337073
18
7.9
18
86
4
193
38
10
15
36
1.82
60336930--60337073
35
4.0
35
90
4
216
38
10
15
36
1.82
60339260--60339332
36
2.0
36
86
5
103
43
2
23
30
1.67
60339328--60339373
23
2.0
23
95
0
83
26
17
10
45
1.81
60350845--60350884
15
2.6
15
96
4
71
50
0
0
50
1.00
60350898--60350935
19
2.0
19
94
0
67
44
0
0
55
0.99
60350905--60350952
19
2.5
19
86
3
60
50
6
0
43
1.27
60351490--60351522
17
1.9
17
88
11
50
42
9
15
33
1.78
60352463--60352494
4
8.0
4
92
0
55
75
0
21
3
0.95
60358632--60358708
38
2.0
38
94
0
136
35
11
19
33
1.88
60363926--60363981
27
2.1
27
96
0
103
46
3
7
42
1.48
60363926--60363996
27
2.6
26
86
8
72
50
2
8
38
1.47
60364440--60364522
9
9.0
9
74
13
71
45
3
1
49
1.27
60369924--60370107
40
4.6
40
81
6
212
26
24
25
23
2.00
60369924--60370143
80
2.8
79
84
4
257
25
24
25
24
2.00
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
60384365--60384478
43
2.7
43
76
1
113
32
23
17
26
1.97
60390685--60390858
49
3.5
49
92
0
258
24
16
28
29
1.97
60392001--60392997
47
20.7
47
95
2
1627
29
29
8
32
1.87
60392001--60392976
49
20.3
49
95
2
1659
29
29
8
32
1.87
60392001--60392997
192
5.2
192
93
3
1670
29
29
8
32
1.87
60397034--60397465
40
10.8
39
88
4
549
26
26
20
26
1.99
60398851--60399431
49
12.0
49
95
2
993
29
29
8
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1.87
60404265--60404313
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1.9
25
87
4
71
26
22
32
18
1.97
60406392--60406569
27
6.6
27
83
3
205
26
15
28
29
1.96
60406393--60406548
82
1.9
81
88
3
233
26
15
28
29
1.96

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
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          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
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          321   322   323   324   325