Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A03
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  105315579

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
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          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   

This is table  25  of  325  ( 38900 repeats found )

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Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
7572946--7572995
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2.0
26
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2.0
20
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19
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35
1.95
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
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Percent
Indels
Score
A
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Entropy
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1.95
7616745--7617127
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164
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0
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4.3
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1
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0
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19
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0
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19
18
1.95
7638396--7638802
163
2.5
164
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1
595
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18
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2.1
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2
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1.08
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
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Entropy
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0
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18
16
25
1.91
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23
2.5
22
82
8
58
62
5
0
31
1.18
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
7666992--7667057
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2.6
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1.20
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1.96
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177
2.9
176
83
3
633
28
21
18
31
1.97
7668666--7669211
265
2.1
266
86
1
747
29
22
17
30
1.97
7675350--7675638
127
2.3
126
79
1
319
38
19
16
25
1.92
7675431--7675669
127
1.9
127
86
1
345
38
21
15
24
1.92
7675764--7675817
23
2.5
23
82
8
60
61
7
0
31
1.24
7675993--7676059
21
3.0
23
76
21
72
64
0
5
29
1.17
7676026--7676071
15
2.9
15
90
6
65
67
0
6
26
1.15
7676064--7676097
14
2.4
14
90
9
52
67
0
5
26
1.13
7676036--7676100
29
2.2
30
79
17
75
64
0
7
27
1.20
7685065--7685136
16
4.4
16
68
10
56
45
1
1
51
1.18
7692383--7692442
2
30.0
2
100
0
120
50
0
50
0
1.00
7693672--7693723
24
2.1
26
82
7
63
1
55
0
42
1.10
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
7696016--7696062
9
5.2
9
89
0
76
31
8
12
46
1.72
7696390--7696548
80
2.0
80
97
0
300
37
13
11
36
1.82
7699050--7699083
15
2.3
15
89
0
50
17
11
0
70
1.16
7712255--7712363
28
3.9
28
78
2
103
33
22
21
22
1.98
7714537--7714561
12
2.1
12
100
0
50
56
0
0
44
0.99
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23
2.0
23
100
0
94
25
21
21
31
1.98
7718648--7718699
20
2.5
20
84
3
68
26
11
11
50
1.73
7719375--7719427
24
2.2
24
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0
79
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18
1.81
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16
2.0
16
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0
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18
15
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1.90
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23
2.0
23
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12
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45
10
6
36
1.65
7740596--7740640
23
2.0
23
82
8
56
40
13
8
37
1.76
7742199--7742676
239
2.0
239
95
0
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17
7
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1.78
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23
2.5
26
80
17
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33
16
9
40
1.81
7749696--7749742
23
2.0
23
100
0
94
38
12
12
36
1.82
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19
2.6
19
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59
6
4
30
1.41
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21
2.0
21
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9
50
57
0
11
30
1.35
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22
2.0
22
100
0
88
45
9
13
31
1.75
7752708--7752787
31
2.7
29
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5
88
50
10
6
33
1.61
7753820--7753870
26
2.0
26
88
0
75
60
21
9
7
1.53
7757978--7758028
27
2.0
25
85
11
68
49
5
3
41
1.45
7758962--7759000
11
3.3
11
80
19
51
69
20
0
10
1.17
7758962--7759010
25
1.9
25
87
4
71
67
20
0
12
1.22
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
7759263--7759308
19
2.4
18
82
10
56
80
6
13
0
0.89
7759256--7759328
23
3.1
23
79
13
85
78
8
12
1
1.03
7759279--7759322
13
3.6
12
82
11
54
79
9
11
0
0.93
7760295--7760328
17
1.9
18
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5
61
8
5
2
82
0.93
7760560--7760599
20
1.9
22
85
10
57
40
10
0
50
1.36
7760670--7760725
24
2.3
23
77
14
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28
5
7
58
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7764561--7764611
11
4.9
11
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15
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29
1
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1.29
7764611--7764648
19
2.1
19
90
5
60
36
0
5
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7765461--7765522
18
3.3
18
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24
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3
1
29
1.17
7769327--7769361
15
2.2
16
90
5
54
37
0
0
62
0.95

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          321   322   323   324   325