Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A13
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  109233746

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
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          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   326   327   328   329   330   331   332   

This is table  10  of  332  ( 39766 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
2761447--2761670
74
3.0
73
90
1
340
33
22
17
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1.96
2761260--2762148
240
3.7
240
96
0
1620
33
21
17
28
1.95
2761595--2761763
93
1.8
92
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6
252
34
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16
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1.94
2761522--2761836
166
1.9
165
91
1
515
33
21
16
28
1.96
2761687--2762217
73
7.0
73
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11
453
33
20
17
28
1.95
2770533--2770580
16
3.1
15
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60
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4
2
29
1.23
2770529--2770580
8
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78
8
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65
3
1
28
1.21
2770528--2770584
24
2.4
24
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11
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64
3
3
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1.26
2770728--2770942
23
9.0
23
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6
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2770785--2770844
28
2.2
27
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3
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3
5
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1.36
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30
2.3
30
94
0
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20
4
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2778381--2778444
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2.1
31
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5
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32
1
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18
2.9
18
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33
0
11
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39
3.9
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0
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46
3
20
30
1.66
2787084--2787237
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2.0
80
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2
258
46
3
20
30
1.66
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29
2.0
26
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10
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10
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0
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21
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1.75
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17
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19
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20
2
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2.2
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65
22
20
15
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2808767--2808881
44
2.6
44
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2
149
35
13
22
27
1.92
2808767--2808900
46
3.0
45
82
4
153
35
14
23
26
1.93
2817055--2817123
36
1.9
36
90
0
111
14
36
20
28
1.92
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
2825429--2825481
26
2.0
26
100
0
106
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15
18
22
1.87
2829400--2829439
11
3.6
11
82
0
53
10
17
5
67
1.37
2839443--2839483
21
2.0
21
85
0
55
63
0
17
19
1.31
2841755--2841797
3
15.0
3
88
9
63
32
0
30
37
1.58
2848257--2848305
17
2.7
18
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6
64
71
2
0
26
0.97
2848281--2848350
30
2.4
29
81
9
88
58
0
1
40
1.07
2848281--2848348
29
2.4
28
82
7
82
58
0
1
39
1.07
2848505--2848547
9
4.7
9
80
5
50
23
2
0
74
0.93
2852990--2853060
31
2.3
29
78
19
74
61
4
1
32
1.23
2855168--2855198
14
2.1
15
94
5
55
74
0
6
19
1.03
2855205--2855249
16
3.1
15
81
15
58
80
0
15
4
0.87
2855186--2855243
20
2.8
20
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71
77
1
12
8
1.06
2856106--2856197
44
2.1
44
84
8
116
20
20
23
34
1.96
2856382--2856439
18
3.4
18
68
18
61
32
8
17
41
1.80
2858405--2858461
29
2.0
29
82
6
71
45
5
12
36
1.64
2871811--2872023
46
4.6
46
79
9
202
30
18
27
24
1.98
2875103--2875256
42
3.6
44
75
18
123
30
25
18
25
1.98
2880726--2880810
39
2.2
39
93
0
152
37
21
25
15
1.92
2880728--2880792
21
3.2
21
70
12
73
40
20
26
13
1.89
2880749--2880812
18
3.4
18
73
12
56
35
21
26
15
1.94
2882018--2882052
16
2.1
18
89
10
56
37
14
2
45
1.59
2887887--2888035
76
2.0
76
90
0
235
32
14
17
35
1.90
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
2888812--2888855
19
2.5
17
81
7
52
61
0
11
27
1.30
2888911--2888987
38
2.0
38
100
0
154
45
23
5
25
1.73
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25
1.9
26
84
12
66
46
2
8
42
1.45
2907442--2907488
24
1.9
25
82
4
60
63
12
2
21
1.39
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91
2.0
91
100
0
364
37
17
13
31
1.88
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57
2.1
56
84
10
152
25
22
6
45
1.77
2924914--2925022
43
2.5
43
85
5
141
24
14
24
35
1.93
2928064--2928111
23
2.1
23
100
0
96
52
8
16
22
1.71
2943831--2943870
14
2.5
17
80
11
50
72
5
0
22
1.04
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3
35.7
3
69
14
65
31
5
3
59
1.39
2944863--2944960
38
2.6
36
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12
117
31
6
4
58
1.42
2944858--2944925
29
2.4
29
82
7
77
30
4
4
60
1.36
2961614--2961692
39
2.0
39
90
0
122
6
35
18
39
1.77
2961963--2961999
18
2.2
18
85
9
51
27
0
8
64
1.21
2961980--2962655
107
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107
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1
15
51
1.53
2961980--2962655
327
2.1
322
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5
1002
31
1
15
51
1.53
2961980--2962655
220
3.1
218
81
11
775
31
1
15
51
1.53
2962232--2962735
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15
231
31
1
14
52
1.50
2962700--2962731
15
2.1
16
94
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57
37
0
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1.25
2962711--2962760
23
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0
73
34
0
2
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1.05
2962709--2962762
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4.2
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31
0
1
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1.02
2962721--2962766
23
2.0
23
100
0
92
30
0
0
69
0.89
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
2962725--2962769
11
3.9
12
80
8
58
28
0
0
71
0.87
2962729--2962784
27
2.1
26
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12
78
30
0
1
67
1.01
2964827--2964921
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2.9
34
81
7
106
17
43
11
27
1.84
2970157--2970201
23
2.0
23
90
0
72
31
2
0
66
1.04
2970165--2970219
29
2.0
27
85
7
74
30
1
0
67
1.01
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2.6
29
78
12
84
28
1
5
64
1.23
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28
2.9
28
78
7
83
30
1
3
64
1.18
2970747--2970841
36
2.6
37
72
12
88
51
3
0
45
1.17
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2.1
31
81
6
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51
4
0
43
1.23
2970878--2970918
18
2.2
19
91
4
66
65
0
7
26
1.18
2974015--2974066
25
2.1
25
100
0
104
34
11
17
36
1.86
2976899--2976958
29
2.1
29
96
0
111
13
28
15
43
1.84
3005213--3005270
29
2.0
29
93
3
100
41
10
17
31
1.83
3006448--3006473
5
5.2
5
100
0
52
19
0
0
80
0.71
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48
3.4
48
88
0
220
24
14
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1.93
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25
2.0
25
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0
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23
7
11
1.61
3017286--3017326
21
2.0
21
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7
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1.70
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15
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0
1
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1.11
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2.5
35
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52
2
0
44
1.13
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21
2.1
21
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12
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9
0
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12
5.5
12
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10
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40
0
0
60
0.97
3024056--3024120
23
2.8
24
73
17
66
40
0
0
60
0.97
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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3.2
16
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17
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37
0
1
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1.07
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18
3.3
17
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16
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35
0
1
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1.06
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27
2.1
29
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17
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0
0
46
1.00
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15
2.4
15
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0
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5
0
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1.24
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24
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17
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0
0
50
1.00
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19
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7
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2.1
18
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0
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1.91
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2.2
18
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1.93
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0
0
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0
0
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2.1
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5
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0
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0
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5
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0
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2.0
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20
1.9
20
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0
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13
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31
1.93
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24
2.8
24
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1
2
25
1.09
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2.9
16
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0
76
70
0
0
29
0.88
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19
2.7
20
82
14
65
60
3
1
33
1.26
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
3114081--3114122
9
4.7
9
80
11
50
33
0
4
61
1.17
3114080--3114136
18
3.1
18
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14
53
36
1
3
57
1.26
3116612--3116768
81
2.0
80
87
7
234
31
14
7
46
1.72
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126
1.8
126
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1
368
39
17
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26
1.91
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18
2.3
18
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59
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4
23
1.51
3118577--3118751
3
60.0
3
70
13
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2
2
30
1.18
3118578--3118751
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10.3
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2
2
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24
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18
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64
1
2
31
1.17
3118577--3118735
20
8.0
20
69
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64
1
2
31
1.18
3118967--3119016
24
2.1
24
88
0
73
24
4
46
26
1.70

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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