Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A13
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  109233746

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
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          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   326   327   328   329   330   331   332   

This is table  6  of  332  ( 39766 repeats found )

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Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
1763146--1763203
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1.9
30
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0
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1768914--1768956
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22
85
0
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2.0
185
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1.9
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2
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62
0
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3
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52
63
0
2
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2.1
23
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0
52
0
1.00
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2.4
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29
2.4
29
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4
4
32
1.36
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62
5
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2.3
26
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6
7
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2.0
15
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0
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0
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2.3
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1
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9
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92
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2
36
1.53
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2
11
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2.0
26
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1
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19
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2
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1.15
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2.2
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1
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2
67
1.23
1832499--1832577
29
2.7
27
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13
70
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2
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1.29
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2.0
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125
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50
0
50
1.00
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2.0
40
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0
0
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37
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34
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2.5
28
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4
35
1.39
1878308--1878377
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0
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10
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18
0
2
79
0.85
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
1889391--1889433
10
4.0
11
79
14
54
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0
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2.0
21
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36
0
0
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0
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2.0
17
100
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7
0
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1.25
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11
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23
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10
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2.1
16
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59
15
18
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1.54
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2
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1.60
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0
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14
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0
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1.78
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15
10
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2.2
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12
35
1.84
1930367--1930439
19
3.9
19
89
7
123
35
16
10
36
1.84
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
1930558--1930596
21
1.9
20
84
5
51
10
2
15
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1.23
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145
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357
25
23
17
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1931333--1931910
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13.1
44
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28
25
15
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1.96
1931272--1931689
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1.9
219
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579
29
25
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29
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173
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3
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15
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17
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1.75
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16
10
36
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16
10
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1940368--1940458
19
4.9
19
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152
36
16
10
36
1.84
1940577--1940616
21
2.0
20
85
5
53
12
2
15
70
1.28
1945453--1945480
6
4.7
6
100
0
56
82
0
0
17
0.68
1947306--1947347
21
2.0
21
95
0
75
52
26
0
21
1.47
1951306--1951349
21
2.1
21
91
0
70
15
6
0
77
0.97
1951309--1951348
17
2.3
18
91
4
64
15
7
0
77
0.98
1953713--1953772
10
6.4
10
75
21
67
60
0
3
36
1.14
1953894--1953949
23
2.4
24
80
13
64
60
3
5
30
1.36
1955548--1955706
83
1.9
83
84
1
212
28
16
16
38
1.91
1955548--1955735
83
2.3
81
79
6
198
30
18
15
36
1.91
1955749--1955958
110
1.9
110
88
0
312
27
21
17
32
1.96
1955887--1956042
83
1.9
83
86
2
224
30
21
16
31
1.95
1955778--1956363
202
2.9
202
92
2
965
29
20
17
33
1.95
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
1956089--1956244
83
1.9
83
84
0
213
30
19
16
33
1.94
1956172--1956403
119
1.9
119
92
0
392
29
19
17
33
1.95
1971464--1971493
14
2.1
14
93
0
51
36
6
10
46
1.64
1979894--1979930
15
2.5
16
87
12
53
43
10
24
21
1.84
1983581--1983628
26
1.9
25
84
16
64
56
2
6
35
1.36
1984003--1984040
14
2.5
16
87
8
53
63
0
5
31
1.17
1983961--1984030
25
2.8
26
70
12
65
60
2
4
32
1.31
1984181--1984237
20
2.7
21
81
13
71
64
1
0
33
1.04
1984182--1984237
23
2.6
22
83
10
71
66
1
0
32
1.03
1985419--1985497
37
2.1
38
86
9
110
16
6
39
37
1.74
1991471--1991504
16
2.1
16
89
10
52
55
0
8
35
1.31
1991929--1991979
26
2.0
26
84
0
66
35
9
17
37
1.83
1991899--1992014
62
1.9
61
87
1
169
33
7
15
43
1.76
1991955--1992037
36
2.3
36
82
0
94
37
7
14
40
1.74
1991884--1992028
18
7.6
18
70
16
96
34
8
14
42
1.76
1993883--1993972
44
2.0
44
97
0
171
42
24
3
30
1.71
1996535--1996567
16
2.1
17
88
11
52
45
0
0
54
0.99
1997079--1997120
20
2.1
20
86
8
59
59
0
38
2
1.10
1997657--1997769
56
2.0
56
92
0
190
38
10
19
31
1.86
1998930--1999106
43
4.2
43
87
3
238
44
20
9
26
1.81
1998934--1999106
84
2.1
83
86
5
242
44
20
9
26
1.81
2000745--2000778
15
2.2
16
94
5
61
35
41
5
17
1.74
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
2000881--2001011
62
2.1
61
83
5
156
45
23
8
22
1.79
2001063--2001207
62
2.3
61
95
2
254
48
12
12
26
1.76
2001181--2001232
25
2.1
25
100
0
104
44
15
23
17
1.86
2001180--2001231
16
3.7
16
67
32
55
46
15
23
15
1.83
2001206--2001480
64
4.2
64
89
2
363
45
16
14
23
1.84
2001720--2001790
24
3.0
24
75
4
72
57
9
9
22
1.60
2001717--2001789
12
6.1
12
72
12
51
56
10
9
23
1.63
2002206--2002244
20
2.0
20
89
0
60
30
30
12
25
1.93
2002275--2002347
31
2.4
29
82
8
92
21
10
20
46
1.81
2010590--2010627
20
1.9
20
84
10
51
47
13
13
26
1.79

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
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          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
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          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
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          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   326   327   328   329   330   331   332