Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A13
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  109233746

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
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This is table  9  of  332  ( 39766 repeats found )

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Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
2547563--2547614
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21
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2.1
30
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0
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0
0
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0
0
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0.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
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Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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58
0
0
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130
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2
4
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1.35
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2.0
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19
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11
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0
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28
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28
0
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21
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2.9
19
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33
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35
2.3
35
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2
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1.20
2586362--2586461
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17
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23
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3
58
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2.3
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18
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2588360--2588523
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1.9
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224
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19
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10.2
10
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64
0
3
32
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9
10.4
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85
64
0
3
33
1.09
2589908--2590007
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19
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0
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33
1.09
2589906--2590015
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138
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0
3
31
1.18
2590062--2590107
21
2.2
21
84
7
58
54
8
4
32
1.51
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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19
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2
2
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2.3
43
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0
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19
1.98
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1.94
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20
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0
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0
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60
28
0
3
68
1.05
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13.8
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72
16
69
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0
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19
92
0
72
31
0
2
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1.9
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40
1
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0
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44
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14
28
29
1.96
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
2651182--2651232
15
3.3
15
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27
5
0
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1.14
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2.2
31
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29
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0
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1.99
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23
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14
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72
0.85
2658679--2658715
10
3.7
10
86
13
58
27
0
0
72
0.84
2658807--2658870
18
3.5
17
78
15
74
35
0
1
62
1.05
2658809--2658877
9
7.1
10
80
9
56
33
1
1
63
1.12
2658809--2658877
29
2.4
28
82
2
84
33
1
1
63
1.12
2658914--2659156
134
1.8
134
83
6
330
44
12
9
32
1.75
2659397--2659524
19
6.7
18
75
19
91
59
2
3
34
1.29
2659406--2659523
10
12.4
9
73
12
60
59
2
3
34
1.28
2659437--2659523
9
9.5
8
75
19
57
60
2
4
32
1.29
2666940--2667047
26
4.2
26
92
2
164
34
7
22
36
1.82
2669872--2669915
20
2.2
20
100
0
88
47
0
18
34
1.49
2681656--2681709
22
2.4
21
80
17
56
33
5
0
61
1.19
2681665--2681721
27
2.1
28
78
15
66
35
5
1
57
1.31
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
2681678--2681739
27
2.4
26
81
7
72
32
3
1
62
1.20
2681759--2681804
13
3.0
15
76
23
51
30
8
0
60
1.26
2682972--2683077
53
2.0
53
98
0
203
37
10
5
46
1.62
2686062--2686146
19
4.2
21
87
4
61
36
17
10
35
1.85
2686079--2686176
19
5.2
19
90
7
155
35
15
11
37
1.83
2692873--2692900
14
2.0
14
100
0
56
21
21
21
35
1.96
2694409--2694437
9
3.2
9
100
0
58
10
0
0
89
0.48
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16
1.9
16
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0
53
48
0
51
0
1.00
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18
3.2
18
80
15
68
25
5
0
70
1.08
2712906--2712954
19
2.4
21
83
10
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14
2
32
51
1.54
2726429--2726468
16
2.4
17
83
8
55
50
0
12
37
1.41
2726429--2726471
17
2.5
18
77
11
54
48
0
11
39
1.40
2728844--2728950
20
5.3
20
73
6
83
40
1
14
42
1.57
2728844--2728950
40
2.7
40
74
11
110
40
1
14
42
1.57
2733448--2733485
12
3.2
12
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0
58
39
28
7
23
1.83
2735100--2735135
4
8.8
4
93
6
63
50
0
0
50
1.00
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26
3.1
25
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3
99
24
16
22
37
1.93
2744106--2744161
27
2.1
27
100
0
112
16
23
3
57
1.55
2754722--2754751
16
1.9
16
93
6
53
40
0
3
56
1.16
2754923--2754981
30
1.9
31
93
3
102
30
8
13
47
1.73
2754923--2754990
31
2.2
30
87
7
93
29
10
14
45
1.78
2759607--2759647
7
5.6
7
85
8
55
68
2
0
29
1.03
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
2759599--2759644
22
2.0
22
91
4
74
71
2
0
26
0.97
2759596--2759654
8
7.5
8
79
11
59
67
1
1
28
1.10
2759596--2759665
31
2.3
30
76
13
72
67
1
1
30
1.08
2759791--2760021
23
9.8
23
69
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4
6
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1.44
2759812--2759874
22
2.7
23
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11
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52
4
7
34
1.52
2759863--2759930
30
2.3
29
84
2
82
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4
4
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1.37
2759888--2759947
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2.2
20
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7
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60
0
4
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1.17
2760508--2760652
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4.8
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186
20
4
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27
1.68
2761356--2761523
92
1.8
91
87
6
250
33
20
17
27
1.95

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
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          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
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