Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A13
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  109233746

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  296  of  332  ( 39766 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
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T
Entropy
(0-2)
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28
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1.98
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
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Indels
Score
A
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T
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Indices
Period
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Copy
Number
Consensus
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Score
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18
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28
1.98
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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29
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20
28
28
1.99
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99
30
20
23
25
1.98
98552420--98552468
24
2.0
25
92
4
82
42
38
10
8
1.68
98553080--98553330
71
3.5
71
77
6
206
35
19
20
25
1.96
98553221--98553348
36
3.6
36
72
6
116
36
19
21
21
1.95
98553183--98553315
36
3.7
35
72
3
113
32
20
22
24
1.98
98555121--98555163
2
21.5
2
85
0
59
51
44
2
2
1.27
98556512--98556568
30
1.9
30
89
3
89
38
1
0
59
1.08
98556555--98556595
20
2.0
21
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4
57
39
2
7
51
1.43
98556758--98556813
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1.9
29
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48
1
12
37
1.52
98557311--98557341
16
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16
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0
0
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25
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1
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1.33
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2.1
33
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0
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1.86
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6
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6
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0
0
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10
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3
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64
0
2
33
1.08
98582394--98582431
20
1.9
20
88
0
58
28
28
10
31
1.90
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
98590089--98590152
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2.1
31
91
2
103
59
3
6
31
1.38
98590103--98590158
30
1.9
29
92
7
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3
7
28
1.40
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2.0
20
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0
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0
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1.51
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13
2.1
13
100
0
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22
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1.90
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1.9
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4
155
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1.82
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17
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1.44
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2.0
15
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0
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1.93
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1.60
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1.96
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18
0
0
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4.0
11
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18
0
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63
18
0
2
79
0.83
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21
2.1
22
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22
1.75
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20
2.8
20
82
15
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39
5
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1.57
98636321--98636376
20
2.8
20
75
20
62
48
12
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35
1.58
98636514--98636626
20
5.7
20
73
4
84
43
7
12
37
1.70
98636747--98636812
20
3.2
21
79
12
66
36
6
16
40
1.73
98636762--98636853
20
4.6
21
77
9
93
34
7
11
45
1.70
98636762--98636853
40
2.3
40
84
0
121
34
7
11
45
1.70
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
98636924--98636967
20
2.2
20
88
4
63
34
9
9
47
1.67
98637031--98637103
20
3.6
21
76
12
73
41
8
5
45
1.57
98637027--98637122
40
2.4
40
82
3
104
44
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6
42
1.54
98637069--98637122
20
2.8
20
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48
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5
42
1.44
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2.3
18
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0
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1.82
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118
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0
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3.4
14
83
10
55
18
0
36
44
1.50

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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