Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A13
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  109233746

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
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This is table  11  of  332  ( 39766 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
3118999--3119082
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0
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3119007--3119093
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0
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3119380--3119862
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23
21
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1.99
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268
2.8
267
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2
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26
23
21
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2.0
446
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402
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20
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22
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3.1
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17
120
19
19
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1.94
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172
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20
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4.7
43
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4
201
19
21
22
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2.2
22
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0
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4
10
0
85
0.71
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2.7
18
79
14
57
46
10
20
22
1.80
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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126
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16
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18
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1.51
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14
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17
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18
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53
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2
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0
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3
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1.25
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2.6
15
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4
53
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5
0
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1.14
3127517--3127623
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2.5
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2
28
1.25
3127843--3127892
24
2.1
24
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2.0
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2.6
17
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0
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18
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53
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19
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21
55
55
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7
33
1.45
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10
4.6
10
82
7
53
30
2
0
67
1.02
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2.4
19
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15
15
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15
3.1
14
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1.51
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2.0
22
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0
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1.68
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25
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26
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1.50
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28
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13
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2
64
1.16
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1
1
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15
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2
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17
18
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192
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1.16
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1.38
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2
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1
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20
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19
2.6
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10
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53
0
2
44
1.13
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
3222590--3222615
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2.0
13
100
0
52
30
15
0
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19
17
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2.1
14
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0
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1.92
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86
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11
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0
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2.1
19
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61
0
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24
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1
1
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17
90
0
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62
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2
32
1.23
3246255--3246361
54
2.0
54
100
0
214
44
6
14
33
1.71
3252118--3252146
7
4.1
7
100
0
58
44
13
41
0
1.44
3252420--3252467
22
2.2
22
96
0
87
37
10
8
43
1.69
3261030--3261300
123
2.2
123
88
5
406
29
24
18
27
1.98
3261031--3261300
41
6.6
41
89
4
368
29
24
18
27
1.98
3262871--3262895
13
1.9
13
100
0
50
68
24
0
8
1.16
3277168--3277464
138
2.1
138
80
4
319
25
12
11
50
1.74
3277545--3277595
16
3.1
16
76
18
59
72
0
0
27
0.85
3277547--3277595
17
2.9
17
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22
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73
0
0
26
0.83
3280510--3280542
17
1.9
17
100
0
66
66
0
0
33
0.92
3285082--3285128
23
2.0
24
84
12
62
21
25
0
53
1.46
3289630--3289669
20
2.0
20
100
0
80
35
10
15
40
1.80
3294160--3294640
132
3.7
130
82
5
450
34
18
20
27
1.96
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
3297476--3297583
44
2.4
44
87
3
144
29
23
13
33
1.93
3307500--3307773
46
6.0
46
92
0
406
39
14
23
22
1.91
3312739--3312769
16
1.9
16
93
0
53
54
3
6
35
1.42
3313298--3313332
2
17.5
2
93
0
61
51
0
2
45
1.16
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3
17.7
3
88
0
79
64
3
0
32
1.12
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21
2.0
20
90
5
62
0
25
22
52
1.47
3314945--3315230
44
6.6
43
73
11
153
26
21
21
30
1.98
3314976--3315274
46
6.8
45
75
11
241
26
21
21
31
1.98
3327537--3327566
15
2.0
15
93
0
51
53
3
6
36
1.44
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2
19.5
2
94
0
69
51
0
2
46
1.14
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3
20.7
3
89
0
97
64
3
0
32
1.09
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21
2.0
20
90
5
62
0
25
22
52
1.47
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17
2.2
18
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4
51
28
5
10
55
1.56
3334896--3334964
29
2.3
28
79
16
68
44
0
2
52
1.16
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30
2.2
31
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2
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29
19
8
41
1.82
3351226--3351314
44
2.0
43
95
2
160
30
10
13
46
1.76
3351658--3351703
9
5.3
9
87
10
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71
6
0
21
1.08
3351657--3351703
16
2.8
17
87
6
69
72
6
0
21
1.07
3353066--3353127
30
2.1
29
82
11
74
51
1
0
46
1.10
3353875--3353902
14
2.0
14
100
0
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35
0
0
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24
2.2
24
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0
77
55
9
1
32
1.43
3358243--3358294
24
2.2
24
89
0
77
55
9
1
32
1.43
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
3360211--3360262
24
2.2
24
89
0
77
55
9
1
32
1.43
3363952--3363984
17
2.0
16
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5
57
66
0
0
33
0.92
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19
2.4
19
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0
63
60
2
0
37
1.09
3382264--3382298
14
2.5
14
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13
54
31
11
25
31
1.91
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15
2.2
15
94
5
57
21
9
0
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1.17
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14
2.0
14
100
0
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0
0
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0
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0
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16
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0
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2.1
23
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0
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31
2.0
32
84
3
85
43
6
1
48
1.37

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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