Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A13
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  109233746

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  202  of  332  ( 39766 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
67276218--67276395
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67276239--67276394
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28
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1.98
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51
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3
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86
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1.37
67284058--67284131
20
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0
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0
0
50
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2.1
16
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0
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45
0
3
51
1.16
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2
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2.0
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2.2
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1.98
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20
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21
20
30
1.98
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75
2.7
75
83
5
261
27
19
20
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1.97
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2.1
16
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52
2
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23
1.60
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0
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20
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15
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25
19
22
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1.97
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20
19
33
1.97
67353119--67353367
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3.3
74
82
6
286
24
18
22
33
1.97
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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0
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19
1.94
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2.0
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53
1.42
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21
2.1
21
95
4
81
34
6
4
54
1.47
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
67429245--67429304
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2.0
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51
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1.66
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2.8
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19
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27
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10
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11
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11
91
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52
42
2
0
54
1.15
67469914--67469953
19
2.0
21
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9
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55
7
10
27
1.60
67474428--67474454
2
13.5
2
100
0
54
51
48
0
0
1.00
67475001--67475058
18
3.3
18
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20
52
72
3
5
18
1.18
67475029--67475074
6
7.7
6
95
0
83
82
0
2
15
0.76
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26
4.2
26
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0
198
30
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26
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1.84
67497424--67497483
21
3.0
20
83
9
77
58
1
5
35
1.30
67497601--67497781
94
1.9
96
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7
235
39
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14
27
1.89
67497910--67497975
28
2.2
30
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42
0
1
56
1.08
67499647--67499862
46
4.7
45
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1.98
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1.91
67512595--67512807
92
2.3
92
90
0
327
39
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1.91
67513093--67513125
17
2.0
17
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59
48
0
15
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1.45
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42
2.0
42
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0
170
44
23
11
20
1.84
67527879--67527938
19
3.2
19
95
0
102
30
20
28
21
1.98
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2.0
154
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0
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1.50
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20
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18
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0
2
27
1.01
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12
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0
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5
0
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1.08
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15
2.3
15
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0
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0
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40
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202
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1.98
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28
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25
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1.96
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27
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27
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119
32
23
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20
1.98
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27
2.1
27
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1.87
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4.3
10
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9
50
75
0
25
0
0.81
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
67564175--67564257
24
3.4
24
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15
0
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0
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3
0
60
1.15

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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