Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A13
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  109233746

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
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          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   326   327   328   329   330   331   332   

This is table  257  of  332  ( 39766 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
85824505--85824613
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53
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0
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1.92
85824479--85824940
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332
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2.5
127
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16
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24
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75
16
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63
4
7
25
1.40
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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5
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0
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0.82
85866192--85866261
14
4.7
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0
25
0
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85871403--85871641
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1.9
16
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0
0
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11
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54
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40
15
16
28
1.88
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126
3.2
125
86
0
546
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18
16
28
1.92
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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0
0
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33
1
0
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1.02
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32
1
0
66
1.01
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2.1
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2
9
64
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2.1
33
100
0
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14
22
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26
2.1
25
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13
65
75
0
3
20
0.96
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
86006675--86006740
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2.1
114
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1
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33
11
27
27
1.91
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28
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42
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0
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7
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1.72
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14
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32
1.66
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10
74
41
14
3
40
1.63
86033882--86033916
3
11.7
3
100
0
70
34
0
0
65
0.93
86035816--86035879
23
2.7
23
76
9
67
60
3
18
17
1.48
86036719--86036812
49
1.9
49
88
0
143
42
17
14
25
1.87
86039873--86039943
25
2.8
25
80
4
72
40
8
16
33
1.79
86039887--86039950
25
2.6
25
82
0
74
40
9
17
32
1.81
86041085--86041131
21
2.2
21
77
7
51
8
38
0
53
1.32
86041308--86041340
17
1.9
17
88
11
50
12
18
3
66
1.36
86044862--86044931
35
2.0
35
97
0
131
31
21
2
44
1.67
86046511--86046544
16
2.1
16
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0
59
5
20
29
44
1.75
86053514--86053637
61
2.0
61
95
0
221
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11
29
1.91
86057205--86057276
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28
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0
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26
1.88
86061521--86061552
16
2.0
16
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0
55
78
0
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15
0.95
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27
6.6
27
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3
205
29
28
15
26
1.96
86065441--86065596
82
1.9
81
88
3
233
29
28
15
26
1.96
86076499--86076676
27
6.6
27
84
3
205
29
28
15
26
1.96
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
86076520--86076675
82
1.9
81
88
3
233
29
28
15
26
1.96
86084676--86084853
27
6.6
27
84
3
205
29
28
15
26
1.96
86084697--86084852
82
1.9
81
88
3
233
29
28
15
26
1.96
86098727--86098785
7
8.4
7
81
10
50
62
0
0
37
0.95
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27
2.4
27
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19
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62
0
0
37
0.96
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19
2.5
19
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0
60
29
2
6
62
1.31
86104411--86104448
19
2.0
19
94
0
67
18
7
0
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1.06
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19
2.1
19
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0
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35
1.70
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42
2.2
43
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30
23
19
26
1.98
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49
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212
25
18
27
28
1.98
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16
2.1
19
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14
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2
21
27
1.63
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48
6.6
48
84
1
386
27
30
18
23
1.98
86126973--86127290
143
2.2
144
84
1
395
27
30
18
23
1.98
86129946--86129990
21
2.1
21
95
0
81
40
4
20
35
1.72
86132248--86132303
11
5.6
10
79
12
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35
10
17
35
1.85
86132266--86132303
20
1.9
20
100
0
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36
10
18
34
1.85
86132348--86132420
25
3.0
24
79
4
65
27
23
24
24
2.00
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20
1.9
20
94
0
67
36
10
21
31
1.87
86140131--86140186
11
5.6
10
75
12
53
35
10
19
33
1.87
86144014--86144038
11
2.3
11
100
0
50
8
24
24
44
1.80
86153772--86153810
8
4.6
8
81
12
51
56
2
0
41
1.13
86153772--86153815
12
3.5
12
81
6
52
56
2
0
40
1.11
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
86154666--86154803
43
3.3
41
76
11
136
29
23
17
29
1.97
86154652--86154806
84
1.8
84
84
5
215
30
25
16
27
1.97
86172931--86173071
43
3.3
43
85
5
189
29
29
18
23
1.98
86175184--86175279
49
2.0
49
95
0
174
54
18
3
23
1.58
86195521--86195588
28
2.4
28
95
0
118
33
26
7
32
1.84
86195694--86195785
29
3.2
28
84
7
123
20
23
22
32
1.98
86208346--86208432
45
1.9
45
90
0
138
25
11
24
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9.5
50
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4
444
26
17
25
30
1.97
86234766--86235208
101
4.4
99
78
4
438
27
17
25
30
1.97
86234770--86235206
151
2.9
151
93
1
698
26
16
25
30
1.97

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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