Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A13
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  109233746

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
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This is table  22  of  332  ( 39766 repeats found )

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Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
6265039--6265081
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21
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5
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6282711--6282759
21
2.4
20
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22
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2.0
31
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12
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62
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2.3
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26
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2.3
84
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0
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29
22
19
28
1.98
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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29
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0
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50
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4.6
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1.8
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294
25
31
17
26
1.97
6305955--6306214
139
1.9
140
93
0
450
25
30
17
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1.97
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6308304--6308352
19
2.6
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2.0
28
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114
24
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0
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1
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0
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0
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23
22
1.98
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2.4
18
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3
52
18
30
37
13
1.90
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2.0
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2.0
145
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19
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1.95
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20
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1.66
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1.9
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2.0
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33
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0
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19
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21
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21
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216
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20
21
24
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3.0
41
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4
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25
30
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1.99
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19
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36
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1
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28
1.41
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2.2
26
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17
68
0
36
0
63
0.95
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
6423352--6423402
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1.9
27
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4
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23
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25
25
2.00
6424200--6424249
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0
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54
55
0
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2
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3
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1.26
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6
77
16
50
66
32
0
2
1.03
6431298--6431435
3
45.3
3
79
5
143
33
6
0
59
1.28
6431618--6431656
16
2.5
16
87
4
53
23
5
2
69
1.21
6446536--6446751
88
2.5
88
86
3
274
29
18
22
30
1.97
6446533--6446793
44
6.0
44
76
3
222
30
18
21
28
1.97
6446726--6447134
225
1.8
224
80
3
500
32
20
20
26
1.97
6447340--6447397
11
4.9
11
74
14
53
62
34
0
3
1.12
6447401--6447443
20
2.2
19
91
4
68
51
37
4
6
1.50
6448562--6448728
24
6.9
24
76
0
154
27
5
1
65
1.25
6448529--6448729
3
66.3
3
71
7
129
29
5
1
62
1.28
6448592--6448730
48
2.9
48
95
0
242
27
5
1
66
1.21
6449963--6450021
20
2.9
20
80
12
68
32
0
3
64
1.10
6450087--6450132
18
2.5
18
82
3
56
28
4
4
63
1.33
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
6450393--6450434
20
2.1
20
100
0
84
30
19
4
45
1.71
6450502--6450551
21
2.4
21
81
15
52
30
0
8
62
1.24
6450560--6450608
25
2.0
25
84
4
64
59
2
4
34
1.28
6450575--6450623
25
2.0
25
84
8
64
61
4
2
32
1.26
6450742--6450774
17
1.9
17
93
0
57
33
0
3
63
1.10
6453425--6453543
59
2.0
59
100
0
238
31
17
21
28
1.96
6453950--6454000
24
2.2
22
80
13
59
25
13
5
54
1.61
6454064--6454137
25
2.9
25
76
15
71
33
10
2
52
1.50
6463127--6463153
13
2.1
13
100
0
54
44
7
22
25
1.79
6468944--6469478
162
3.3
158
80
13
548
29
18
20
32
1.96
6469125--6469330
73
2.9
72
83
9
287
27
18
23
30
1.98
6469323--6469354
15
2.1
15
94
0
55
21
6
6
65
1.38
6469271--6469478
86
2.4
85
85
4
267
30
17
19
33
1.95
6469348--6469564
86
2.6
84
79
7
201
29
17
17
35
1.93
6595722--6595781
30
2.0
30
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0
93
28
25
5
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1.76
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25
2.8
26
79
12
85
18
28
16
36
1.93
6603508--6603567
25
2.4
25
80
0
66
25
26
20
28
1.99
6605320--6605357
19
2.0
18
90
10
58
68
0
31
0
0.90
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16
2.6
16
96
0
75
71
0
26
2
0.98
6613614--6613672
29
2.0
29
100
0
118
37
0
20
42
1.52
6614162--6614214
18
2.9
18
78
10
63
32
11
20
35
1.88
6614431--6614502
35
2.1
35
94
0
126
30
5
18
45
1.72
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
6615972--6616008
13
2.9
13
88
11
51
24
0
8
67
1.17
6619299--6619432
54
2.5
54
97
0
250
23
20
25
31
1.98
6620739--6620815
13
5.9
13
87
6
95
32
7
25
33
1.85
6622845--6623082
72
3.3
72
89
2
365
55
16
5
22
1.63
6623458--6623505
18
2.7
18
96
0
87
39
12
12
35
1.81
6624437--6624506
21
3.3
21
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18
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45
7
11
35
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21
2.0
21
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0
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38
0
21
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2.0
26
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86
36
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17
28
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25
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17
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16
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1.93
6632285--6632380
37
2.5
37
81
6
102
36
19
17
26
1.94

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          321   322   323   324   325   326   327   328   329   330   331   332