Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A13
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  109233746

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
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This is table  20  of  332  ( 39766 repeats found )

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Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
5759822--5759917
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3.4
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290
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1.9
18
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1.9
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22
1.9
22
85
9
59
64
7
0
28
1.20
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2.1
22
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0
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2.0
33
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1.9
116
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330
29
18
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2.1
21
100
0
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2.2
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2.0
25
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20
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51
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1.94
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2.0
223
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50
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0
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2.5
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17
25
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16
2.8
16
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3
52
67
11
0
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1.22
5883062--5883105
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2.0
22
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38
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0
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19
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79
1.02
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2.9
26
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12
4
3
79
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5886101--5886147
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11
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17
2
4
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2.5
24
81
10
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42
0
5
52
1.23
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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14
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49
1.19
5886118--5886325
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287
36
0
6
57
1.24
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107
54
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1
40
1.28
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1.9
19
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2
0
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1.11
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1.9
32
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60
1
0
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1.07
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0
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2.2
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60
0
0
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1.04
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1
3
15
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3.2
32
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1
4
15
1.02
5886609--5886660
17
3.2
15
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17
50
82
1
7
7
0.91
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20
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2.3
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30
6
13
49
1.66
5899733--5899780
19
2.6
19
80
9
55
35
2
14
47
1.56
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
5899789--5899886
43
2.3
42
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5
151
31
4
13
51
1.60
5902412--5902464
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17.7
3
80
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30
5
1
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1.29
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2.1
23
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14
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21
23
25
1.99
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418
30
22
23
23
1.99
5915293--5915431
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120
25
21
24
28
1.99
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44
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11
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30
20
23
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174
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170
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5
518
31
20
22
25
1.98
5915591--5915963
87
4.3
86
74
8
308
30
21
22
26
1.99
5915591--5915967
46
8.7
44
73
12
235
29
21
23
25
1.99
5915680--5915931
131
1.9
128
79
7
276
28
21
24
26
1.99
5915591--5915968
174
2.2
174
84
1
463
29
21
23
25
1.99
5917325--5917377
3
17.7
3
80
7
63
30
5
1
62
1.29
5917411--5917459
24
2.1
23
82
14
57
38
8
2
51
1.43
5919808--5919844
19
2.1
18
90
10
58
21
21
8
48
1.76
5930195--5930244
26
2.0
25
88
4
73
40
0
0
60
0.97
5933872--5933896
13
1.9
13
100
0
50
64
12
8
16
1.49
5938463--5938505
18
2.3
19
84
4
52
48
0
0
51
1.00
5939559--5939630
36
2.0
36
94
0
126
41
15
15
27
1.87
5942157--5942347
72
2.7
72
77
3
179
36
23
16
24
1.95
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
5952735--5952781
23
2.1
23
84
7
62
21
6
2
70
1.20
5955962--5955986
11
2.3
11
100
0
50
60
0
24
16
1.36
5957317--5957365
24
2.0
24
100
0
98
46
12
4
36
1.60
5966379--5966806
213
2.0
210
90
2
678
34
21
12
32
1.91
5973410--5973897
47
10.2
47
90
4
733
32
7
31
28
1.86
5973673--5973764
31
3.2
31
63
32
76
34
5
30
29
1.80
5973712--5973736
9
2.8
9
100
0
50
36
0
32
32
1.58
5973691--5973783
31
3.2
30
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32
76
33
7
31
27
1.85
5980853--5980879
12
2.2
12
100
0
54
25
44
29
0
1.54
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10
4.0
10
83
6
53
23
0
0
76
0.78
5985851--5985901
22
2.4
22
80
3
59
29
0
0
70
0.87
5985847--5985902
14
3.9
14
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4
58
30
0
0
69
0.89
5989676--5989751
37
2.0
38
87
2
109
46
3
2
47
1.35
5989750--5989916
20
8.4
20
67
14
62
59
1
8
29
1.38
5995351--5995418
25
2.8
25
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2
66
35
10
17
36
1.84
6008142--6008182
19
2.2
19
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4
57
29
0
2
68
1.03
6008141--6008195
28
1.9
29
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3
85
30
1
5
61
1.29
6008142--6008277
10
14.4
9
67
13
69
27
2
4
65
1.23
6010373--6010399
14
1.9
14
100
0
54
85
0
14
0
0.61
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7
4.3
7
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8
53
51
0
0
48
1.00
6014581--6014611
15
2.1
15
94
5
55
51
0
0
48
1.00
6014612--6014655
17
2.6
17
75
13
54
59
0
2
38
1.10
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
6016626--6016679
27
2.0
27
96
0
99
11
31
33
24
1.90
6017280--6017334
21
2.7
20
80
8
56
25
10
1
61
1.39
6018504--6018555
17
3.3
17
71
20
58
46
0
0
53
1.00
6023910--6024183
139
2.0
139
95
0
494
36
18
12
32
1.88
6025764--6025815
24
2.2
24
92
0
86
44
28
5
21
1.75
6025771--6025816
24
1.9
24
100
0
92
41
26
6
26
1.80
6028538--6028595
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1.9
30
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0
89
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1.71
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2.5
13
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0
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31
0
12
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1.37
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4.7
50
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4
297
26
24
29
19
1.99
6028933--6029182
100
2.4
103
88
6
364
26
24
29
20
1.99

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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