Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A13
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  109233746

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  51  of  332  ( 39766 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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0
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2.0
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21
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4.6
45
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21
29
1.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
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C
G
T
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15218448--15218702
104
2.4
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16
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2.0
132
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66
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2.0
19
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22
90
0
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2
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61
1.35
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2
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4
22
1.25
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19
2.2
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12
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4
21
1.26
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1.98
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3
0
61
1.15
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
15300575--15300711
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0
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1.17
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32
83
7
89
35
3
1
59
1.22
15314952--15314992
21
2.0
21
90
9
66
34
4
0
60
1.18
15321829--15321912
26
3.2
26
96
0
150
36
25
4
33
1.77
15322988--15323055
33
2.1
33
97
0
127
13
14
27
44
1.83
15323349--15323510
44
3.7
44
80
1
164
27
22
15
33
1.95
15323355--15323516
88
1.8
88
85
5
229
29
22
16
31
1.96
15323403--15323530
44
2.9
45
79
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145
32
20
17
29
1.95
15325085--15325158
33
2.2
35
87
7
116
51
33
8
6
1.58
15330754--15330780
5
5.4
5
100
0
54
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0
0
18
0.69
15331311--15331682
43
8.5
44
79
5
169
31
23
20
25
1.98
15331481--15331729
44
5.7
43
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356
27
22
20
28
1.99
15331481--15331729
87
2.8
86
89
4
347
27
22
20
28
1.99
15332027--15332071
21
2.1
21
100
0
90
0
57
17
24
1.40
15332630--15332667
19
2.1
18
85
9
51
52
0
7
39
1.31
15338223--15338262
21
1.9
21
94
0
71
47
12
10
30
1.74
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
15343380--15343410
15
2.1
15
93
0
53
32
9
0
58
1.31
15344208--15344483
41
6.8
41
85
4
337
19
22
22
36
1.95
15345178--15345202
10
2.5
10
100
0
50
40
12
40
8
1.72
15349919--15349982
32
2.0
32
100
0
128
18
28
12
40
1.87
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6
5.3
6
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0
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50
12
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1.77
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16
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0
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0
25
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15
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13
58
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5
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2.0
41
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1.93
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4
82
27
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36
1.91
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24
2.7
26
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13
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2
1
64
1.18
15374475--15374541
25
2.8
24
84
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80
31
2
1
64
1.18
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2.1
12
100
0
50
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0
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205
1.8
205
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0
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28
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2
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25
1.97
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11
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37
0
0
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30
0
2
67
1.04
15388863--15388887
12
2.1
12
100
0
50
32
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0
60
1.26
15390648--15390700
17
3.2
16
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10
63
75
3
20
0
0.96
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20
2.0
20
89
0
60
48
7
0
43
1.31
15393514--15393588
30
2.5
29
78
6
78
52
9
4
34
1.53
15393573--15393610
15
2.4
17
86
8
53
60
0
5
34
1.19
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
15394266--15394301
15
2.4
15
86
13
56
22
5
41
30
1.76
15394632--15394671
15
2.6
15
81
18
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32
0
0
67
0.91
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29
2.2
30
89
2
98
43
0
1
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15396698--15396748
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2.6
19
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27
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1
0
73
0.92
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0
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3.8
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0
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6
9.3
6
100
0
112
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0
0
50
1.00

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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