Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A13
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  109233746

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
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This is table  308  of  332  ( 39766 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
101354628--101354666
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19
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2
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0
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0
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1.00
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2.3
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1.11
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2.4
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17
42
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100
0
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2.2
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2.2
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60
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1.54
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2.2
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100
0
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65
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6
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2.6
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10
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2.9
158
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34
19
14
30
1.92
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2.4
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261
36
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13
32
1.89
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2.9
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287
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15
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1.9
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50
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5
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4.1
11
82
0
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4
0
35
1.17
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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28
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101413517--101413558
20
2.0
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4
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42
2
0
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1.13
101413524--101413569
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2.3
21
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7
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45
0
0
54
0.99
101413602--101413757
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1.9
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4
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10
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0
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0
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0.52
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28
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5
57
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101414179--101414251
20
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1
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16
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2.0
20
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2.0
22
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0
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0
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65
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1.34
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0
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22
2.5
22
78
18
64
22
7
5
64
1.38
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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62
1.40
101461583--101461677
38
2.5
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37
12
0
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2.7
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0
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20
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1.70
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23
2.0
23
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39
1.87
101479416--101479528
50
2.2
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20
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2.1
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46
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16
1.47
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
101519402--101519599
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0
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1.13
101537478--101537508
16
1.9
16
93
0
53
58
0
0
41
0.98
101540969--101540998
5
5.8
5
96
4
51
83
0
0
16
0.65
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44
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1
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29
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32
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101547712--101547768
30
1.9
30
89
7
89
57
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3
19
1.54
101547757--101547805
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0
0
18
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2.0
24
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4
69
36
0
4
59
1.17
101550417--101550470
23
2.2
24
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1.28
101551153--101551712
128
4.4
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559
24
17
22
35
1.95
101552198--101552240
20
2.2
20
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0
59
23
27
13
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1.93
101553228--101553277
24
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24
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0
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101553234--101553274
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2.0
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12
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101553217--101553277
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0
240
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1.93
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18
2.1
18
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19
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0
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10
23
34
1.89
101561793--101561887
48
2.0
48
89
0
145
30
22
18
28
1.97
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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7
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0
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0.80
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1.84
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24
2.0
24
100
0
98
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32
2.0
32
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0
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11
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12
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0
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8
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1.60
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2.2
41
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2
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1.96
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1.97
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0
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25
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27
26
1.99
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2.3
494
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2065
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1.74
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2.5
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2
2
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1.16
101577882--101577940
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1.9
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10
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3
1
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1.16
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2.0
35
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4
56
1.28
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2.4
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3
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20
18
30
1.96
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0
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0
0
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2.0
21
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2
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9
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14
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20
1.9
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55
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7
5
48
1.54
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8
100
0
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0
0
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16
0
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14
2.1
14
93
0
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16
0
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1.47
101627866--101627923
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1
39
1.43
101627873--101627912
14
2.9
14
84
0
53
45
10
2
42
1.51
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
101627906--101627946
20
2.0
21
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14
0
43
1.45
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7
11.4
7
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7
0
36
1.29
101627978--101628062
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2.7
32
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100
55
10
0
34
1.34
101627969--101628044
40
1.9
40
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5
100
55
7
0
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1.29
101630914--101630986
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36
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6
28
1.51
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2.0
45
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0
140
20
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1.87
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2.2
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6.0
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0
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14
39
1.91
101645806--101646074
92
2.9
92
92
1
432
21
24
14
39
1.91

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
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