Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A13
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  109233746

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  312  of  332  ( 39766 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
102461481--102461520
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15
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0
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2.7
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70
10
0
44
46
1.37
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2.0
30
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0
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1.9
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18
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0
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0
0
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29
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2.0
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0
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0
0
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80
0.71
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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27
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0
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102518743--102518786
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0
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0
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3.5
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14
35
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0
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0
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1.69
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2.4
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93
0
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18
1.86
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
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Entropy
(0-2)
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0.95
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2.0
22
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29
24
1.82
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2.1
18
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15
23
0
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1.9
219
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139
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41
89
6
235
28
22
20
28
1.98
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
102599444--102599507
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9
26
1.86
102599724--102599879
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3.8
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89
6
235
28
22
20
28
1.98
102600924--102600948
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1.9
13
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1
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2
1029
43
10
12
33
1.77
102621840--102622007
47
3.6
45
70
19
132
45
2
3
47
1.35
102621766--102621973
91
2.3
91
89
0
317
46
3
3
46
1.37
102621787--102621948
44
3.6
43
69
19
116
45
1
3
48
1.30
102621786--102621862
28
2.8
28
73
9
52
42
1
3
51
1.28
102622123--102622177
24
2.2
26
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12
71
45
0
1
52
1.11
102622318--102622408
45
2.0
44
87
2
128
34
28
5
31
1.80
102622389--102622440
16
3.2
16
94
0
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34
36
0
28
1.58
102625338--102625513
46
3.8
46
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12
207
20
20
29
29
1.98
102625335--102625506
93
1.8
93
94
0
308
20
20
29
28
1.98
102628014--102628148
40
3.4
40
72
9
125
31
25
17
25
1.97
102628281--102628330
15
3.2
15
81
15
57
48
14
0
38
1.44
102629077--102629109
5
7.0
5
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57
0
0
42
0.98
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18
2.9
18
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52
1
0
45
1.11
102639095--102639124
13
2.3
13
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0
51
33
3
6
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1.42
102646571--102647239
177
3.8
176
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5
792
27
22
19
30
1.98
102647118--102647604
133
3.7
133
90
1
755
31
20
19
28
1.97
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
102647130--102647604
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10.7
44
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17
200
31
20
19
28
1.97
102647717--102647842
63
2.0
64
88
1
191
34
17
19
28
1.95
102662788--102663036
50
4.8
50
85
4
284
20
29
24
26
1.99
102662787--102663036
100
2.4
104
88
6
357
20
29
24
26
1.99
102663131--102663162
13
2.5
13
94
0
55
56
12
0
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1.37
102663373--102663430
30
1.9
30
89
0
89
31
24
3
41
1.71
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23
2.1
23
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0
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16
8
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2.1
32
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0
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22
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21
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20
2.0
20
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7
5
22
1.38
102673991--102674030
19
2.0
20
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4
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65
7
5
22
1.38
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46
3.9
46
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1
220
22
22
14
40
1.90
102678972--102679152
92
2.0
92
85
2
247
22
22
14
40
1.90
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11
4.0
11
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6
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20
46
4
27
1.71
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2.0
21
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4
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20
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2
30
1.63
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36
2.6
36
94
0
157
28
20
16
34
1.94
102687049--102687141
18
5.2
18
84
0
123
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21
16
34
1.95
102691185--102691227
11
4.0
11
84
6
61
20
46
4
27
1.71
102691184--102691226
21
2.0
21
90
4
68
20
46
2
30
1.63
102694226--102694724
46
10.8
46
88
2
660
20
24
14
41
1.89
102694226--102694724
139
3.6
139
90
1
750
20
24
14
41
1.89
102694226--102694725
185
2.7
184
90
1
768
20
24
14
41
1.89
102694495--102694568
25
3.1
25
64
28
70
20
21
18
39
1.93
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
102699060--102699117
27
2.1
27
83
6
71
53
3
5
37
1.40
102700597--102700630
15
2.4
14
95
5
59
58
5
0
35
1.22
102700587--102700628
16
2.7
15
82
17
50
57
4
0
38
1.20
102701244--102701270
14
1.9
14
100
0
54
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0
0
25
0.83
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2.0
24
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0
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28
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1.76
102707440--102707468
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2.1
14
100
0
58
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24
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1.93
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17
0
0
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18
24
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1.97
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2.0
19
100
0
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1.93
102721481--102721513
17
1.9
17
93
0
57
30
0
27
42
1.56

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
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          321   322   323   324   325   326   327   328   329   330   331   332