Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A13
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  109233746

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  153  of  332  ( 39766 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
50148347--50148425
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50158626--50159015
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16
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50160958--50161145
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191
37
19
27
15
1.93
50160967--50161145
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39
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0
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24
25
1.94
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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1.94
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2.9
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1.99
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2.8
101
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373
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1.97
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1.9
151
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2.5
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29
15
25
1.96
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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1.95
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101
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93
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299
21
21
28
29
1.98
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
50332535--50332569
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4.0
43
76
10
158
29
29
18
23
1.97
50349982--50350145
42
3.9
42
75
11
131
29
29
17
23
1.97
50354259--50354298
20
2.0
20
100
0
80
60
15
10
15
1.60
50361423--50361725
48
6.3
48
97
0
552
34
6
29
30
1.82
50361865--50361964
34
2.8
36
89
4
150
24
19
30
27
1.98
50380690--50380818
46
2.8
46
93
0
222
29
29
20
20
1.98
50380695--50380837
46
3.1
45
86
4
137
28
29
20
20
1.98
50388118--50388293
46
3.8
46
75
12
180
30
27
19
23
1.98
50388719--50388778
30
2.0
30
90
0
93
30
25
8
36
1.85
50390573--50390738
42
3.9
42
79
6
201
25
17
25
30
1.97
50394382--50394541
85
1.9
85
94
0
284
31
10
24
33
1.89
50396731--50396773
21
2.0
22
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13
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51
6
2
39
1.42
50399150--50399322
46
3.7
46
78
10
190
21
21
27
29
1.99
50399147--50399317
93
1.8
93
91
0
279
21
22
28
28
1.99
50415182--50415280
43
2.3
43
77
10
112
21
19
31
28
1.97
50415670--50415704
18
2.0
17
88
5
52
34
0
17
48
1.47
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
50420730--50420765
17
2.1
17
94
0
63
38
11
13
36
1.81
50441269--50441444
43
4.1
43
99
0
343
22
13
35
27
1.92
50441426--50441499
29
2.6
29
89
4
105
25
16
32
25
1.96
50441810--50442005
40
4.9
40
81
5
184
26
22
26
23
2.00
50441810--50442006
80
2.5
81
80
7
206
26
23
26
23
2.00
50443108--50443443
168
2.0
168
98
0
654
31
14
19
34
1.92
50446962--50446994
13
2.6
13
90
4
50
48
12
0
39
1.40
50449922--50449984
6
11.4
5
85
6
54
76
0
4
19
0.96
50449932--50449974
12
3.7
12
93
3
70
81
0
2
16
0.79
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21
2.2
20
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4
63
17
26
26
28
1.98
50454408--50454440
13
2.6
13
90
4
50
48
12
0
39
1.40
50456587--50456700
43
2.7
42
80
5
113
25
16
25
32
1.96
50464754--50464832
28
2.8
28
92
0
140
32
12
26
27
1.93
50467771--50468039
46
5.6
46
84
10
358
34
14
22
28
1.93
50467831--50468039
52
4.1
51
85
9
293
35
13
22
28
1.92
50467917--50467950
7
4.7
7
88
3
50
44
2
26
26
1.69
50468003--50468148
37
4.0
37
92
1
233
36
16
21
25
1.94
50471716--50471926
54
3.9
53
70
11
151
21
23
17
38
1.93
50486536--50486589
27
2.0
28
85
3
74
42
3
27
25
1.72
50492517--50492651
43
3.1
43
73
11
116
23
17
25
33
1.96
50499574--50499847
140
2.0
140
96
0
503
39
12
6
41
1.69
50505137--50505230
23
4.1
23
78
6
84
34
19
22
24
1.97
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
50513271--50513362
43
2.1
43
82
11
109
25
18
29
27
1.98
50519954--50520030
25
3.1
25
86
1
102
25
22
22
29
1.99
50520827--50520895
27
2.6
28
82
13
83
26
23
20
30
1.98
50520839--50520903
27
2.4
27
84
5
87
23
24
16
35
1.95
50520957--50521012
27
2.1
26
86
3
76
41
12
10
35
1.78
50521021--50521174
27
5.7
27
79
6
141
26
6
20
46
1.75
50521022--50521172
81
1.9
81
84
0
203
27
6
19
46
1.75
50521020--50521187
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3.1
54
75
10
162
27
6
21
44
1.77
50520965--50521178
27
7.8
27
75
9
119
30
7
18
43
1.77
50521166--50521321
27
5.8
27
84
4
199
40
8
21
29
1.83

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
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          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
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          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
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          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   326   327   328   329   330   331   332