Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A13
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  109233746

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  105  of  332  ( 39766 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
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(0-2)
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Indices
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Score
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Period
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Score
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Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
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Matches
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Indels
Score
A
C
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Entropy
(0-2)
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0
61
31
0
5
62
1.18
33987510--33987582
12
5.7
12
73
19
58
80
2
12
4
0.95
33987510--33987579
25
2.8
23
78
10
59
81
2
11
4
0.94
33989636--33989676
21
2.0
21
95
0
73
70
0
21
7
1.11
33991020--33991054
13
2.7
13
95
0
61
31
0
5
62
1.18
33993959--33994129
46
3.7
46
77
14
190
29
28
20
21
1.98
33993964--33994133
93
1.8
92
92
1
286
28
29
20
21
1.98
33997530--33997577
15
3.3
15
73
5
53
29
0
27
43
1.55
33997524--33997567
14
3.1
14
74
6
52
27
0
34
38
1.57
33997524--33997583
29
2.1
29
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0
102
28
0
30
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1.56
34001625--34001687
5
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5
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15
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76
3
17
3
1.05
34001625--34001687
11
6.0
10
74
20
58
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3
17
3
1.05
34001735--34001765
12
2.6
12
100
0
62
45
12
16
25
1.83
34001768--34001792
12
2.1
12
100
0
50
76
0
16
8
1.02
34001762--34001817
18
3.1
18
79
5
60
69
1
19
8
1.24
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
34001768--34001849
30
2.7
31
81
5
96
64
0
21
13
1.28
34001827--34001881
12
4.3
12
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13
56
61
1
21
14
1.42
34003981--34004077
30
3.2
30
77
2
97
28
25
15
29
1.96
34004678--34004735
10
5.7
10
76
11
64
29
27
13
29
1.94
34004678--34004738
20
3.0
20
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9
79
27
26
13
32
1.93
34007080--34007112
15
2.3
15
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10
52
81
6
3
9
0.95
34007091--34007139
13
3.7
13
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57
73
4
6
16
1.19
34007091--34007147
12
4.4
12
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3
8
15
1.24
34008075--34008109
18
1.9
18
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57
0
20
22
1.41
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10
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11
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29
27
13
29
1.94
34010175--34010235
20
3.0
20
83
9
79
27
26
13
32
1.93
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19
2.1
18
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14
51
28
15
34
21
1.94
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20
2.5
20
86
0
64
16
16
40
28
1.89
34016709--34016752
17
2.5
17
85
10
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72
4
20
2
1.13
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21
3.2
21
65
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58
7
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11
1.57
34016771--34016867
42
2.3
42
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1
151
56
5
23
14
1.58
34016871--34016932
18
3.4
18
77
0
61
59
0
30
9
1.29
34016862--34016933
36
2.0
36
86
0
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63
0
27
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1.23
34018553--34018600
20
2.4
20
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0
51
20
27
18
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1.96
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13
2.2
13
100
0
58
20
17
24
37
1.93
34028181--34028235
20
2.7
20
80
2
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29
25
16
29
1.97
34030789--34030832
22
2.0
22
90
0
70
27
34
4
34
1.77
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
34031131--34031171
13
3.0
13
89
7
55
70
2
12
14
1.26
34033426--34033468
20
2.2
20
86
0
59
53
2
30
13
1.53
34035768--34035811
22
2.0
22
95
0
79
25
36
4
34
1.76
34039144--34039187
22
2.0
21
82
4
52
84
2
11
2
0.81
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30
3.2
30
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2
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28
26
15
28
1.96
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28
2.9
28
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10
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4
4
16
1.17
34060615--34060711
30
3.2
30
68
8
81
27
16
28
26
1.97

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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