Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A13
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  109233746

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
          81   82   83   84   85   86   87   88   89   90   91   92   93   94   95   96   
          97   98   99   100   101   102   103   104   105   106   107   108   109   110   111   112   
          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
          193   194   195   196   197   198   199   200   201   202   203   204   205   206   207   208   
          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   326   327   328   329   330   331   332   

This is table  199  of  332  ( 39766 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
66194779--66195010
44
5.3
44
64
13
120
37
22
19
20
1.95
66195522--66195570
24
2.0
25
88
4
73
46
44
2
6
1.39
66196679--66197178
3
166.7
3
69
12
213
29
8
2
59
1.40
66196701--66196811
23
4.7
23
73
10
73
31
8
3
56
1.46
66196902--66196944
20
2.2
20
87
8
61
25
6
0
67
1.15
66196902--66196955
23
2.3
23
84
6
65
29
7
0
62
1.22
66203125--66203299
46
3.7
46
76
14
155
26
17
29
26
1.97
66205560--66205617
20
2.8
20
79
5
62
60
1
0
37
1.07
66208990--66209037
20
2.4
20
82
0
51
54
2
6
37
1.38
66209413--66209457
21
2.3
20
88
11
67
44
6
0
48
1.29
66215114--66215160
22
2.2
22
92
3
78
46
14
23
14
1.82
66218182--66218251
34
2.1
34
97
0
131
31
17
24
27
1.97
66219651--66219692
22
1.9
22
90
0
66
47
16
16
19
1.83
66223582--66224302
47
15.4
47
96
0
1250
32
8
29
29
1.87
66224420--66224498
37
2.1
37
86
4
106
25
18
29
26
1.98
66226316--66226661
40
8.5
40
91
4
548
23
22
28
25
1.99
66226316--66226661
127
2.8
121
90
6
552
23
22
28
25
1.99
66226316--66226638
167
1.9
167
95
0
583
22
22
29
25
1.99
66230138--66230759
47
13.4
47
93
3
996
32
8
29
29
1.87
66230138--66230759
139
4.5
139
92
4
1006
32
8
29
29
1.87
66230563--66230695
46
3.0
40
96
2
131
33
9
29
28
1.88
66230877--66230956
37
2.1
38
90
2
126
25
18
31
25
1.98
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
66247747--66248008
139
1.9
139
95
0
470
33
7
19
39
1.79
66248967--66249053
43
2.0
43
100
0
174
33
9
16
41
1.80
66251054--66251109
20
2.8
20
80
2
67
39
1
3
55
1.28
66251503--66251539
18
2.1
18
89
0
56
54
13
2
29
1.53
66258698--66258827
49
2.7
49
79
7
147
23
27
20
28
1.99
66258742--66258965
46
4.8
46
74
12
179
24
29
19
25
1.98
66258846--66258965
46
2.5
48
90
2
181
24
30
18
27
1.98
66260150--66260216
30
2.2
31
86
2
91
55
11
5
26
1.59
66260246--66260301
11
5.1
11
77
12
53
64
0
12
23
1.27
66271166--66271229
24
2.7
24
80
0
65
70
12
9
7
1.34
66272288--66272313
7
3.7
7
100
0
52
0
15
53
30
1.42
66276491--66276546
30
1.9
29
85
7
78
33
23
10
32
1.89
66276502--66276560
30
2.0
30
93
0
100
37
20
8
33
1.83
66279682--66279852
93
1.8
93
92
0
288
28
27
21
22
1.99
66279681--66279849
46
3.7
46
75
13
175
28
27
20
23
1.99
66279775--66279860
46
1.9
45
85
4
120
31
29
18
20
1.97
66280266--66280325
30
2.0
30
90
0
93
30
25
8
36
1.85
66288709--66288775
30
2.3
31
82
12
79
19
2
5
71
1.20
66289525--66289565
21
1.9
22
85
14
59
12
31
24
31
1.92
66291559--66291610
13
3.8
13
78
12
52
17
1
3
76
1.02
66291574--66291624
21
2.6
19
84
6
66
25
3
1
68
1.17
66292201--66292227
8
3.4
8
100
0
54
88
0
0
11
0.50
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
66292711--66292782
33
2.1
35
85
12
96
47
2
4
45
1.36
66299660--66299741
17
4.9
17
89
5
123
43
6
4
45
1.50
66299659--66299741
33
2.5
33
92
2
130
44
6
4
44
1.49
66300298--66300346
21
2.3
22
86
6
66
44
2
4
48
1.33
66300369--66300415
23
2.0
23
84
8
60
76
0
4
19
0.95
66300802--66300873
31
2.3
32
74
11
78
26
4
2
66
1.23
66303531--66303705
82
2.1
85
92
5
293
28
25
18
27
1.98
66303670--66303888
48
4.6
47
77
7
192
22
30
19
27
1.98
66303670--66303888
94
2.3
95
85
4
289
22
30
19
27
1.98
66311385--66311599
94
2.3
94
81
4
247
22
27
21
27
1.99
66311475--66311596
46
2.6
48
88
5
169
22
25
22
29
1.99
66315938--66315970
6
5.5
6
92
0
57
51
15
15
18
1.77
66316193--66316242
11
4.5
11
87
2
64
34
8
0
58
1.28
66316196--66316245
16
3.1
16
82
8
57
34
8
0
58
1.28
66316309--66316380
37
1.9
37
81
10
85
41
18
0
40
1.50
66323845--66323878
17
1.9
18
94
5
61
44
17
5
32
1.73
66331125--66331182
31
1.9
31
85
3
82
24
25
8
41
1.83
66331137--66331195
31
1.9
31
89
0
91
25
22
6
45
1.76
66331712--66331752
20
2.0
20
100
0
82
24
19
29
26
1.98
66334551--66334580
14
2.1
14
93
0
51
46
36
0
16
1.47
66342330--66342359
14
2.1
14
93
0
51
46
36
0
16
1.47
66358047--66358124
39
2.0
39
87
0
111
28
25
14
32
1.94
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
66364940--66365017
39
2.0
39
87
0
111
28
25
14
32
1.94
66372496--66372533
16
2.3
17
95
4
69
50
36
5
7
1.54
66375339--66375522
67
2.8
64
80
8
203
23
31
15
28
1.96
66376258--66376318
30
2.0
30
83
0
77
31
22
8
37
1.84
66377608--66377707
29
3.5
29
80
1
112
27
14
30
29
1.95
66378481--66378522
18
2.3
18
95
0
75
33
16
23
26
1.96
66381777--66381805
13
2.2
13
100
0
58
41
6
0
51
1.28
66382928--66382966
20
2.0
20
90
10
62
33
0
20
46
1.51
66385767--66385972
112
1.9
110
89
3
324
23
22
16
36
1.94
66385877--66386441
117
4.9
114
81
6
573
24
20
14
40
1.90
66385779--66386441
117
5.8
114
81
6
556
24
21
14
39
1.91
66385891--66386434
229
2.4
229
81
5
607
24
20
14
40
1.89
66385761--66386443
111
5.9
115
80
7
672
24
20
14
39
1.91
66388357--66388411
26
2.1
26
83
6
67
45
0
1
52
1.11
66388362--66388419
5
10.8
5
80
12
62
43
0
1
55
1.10
66388363--66388420
8
6.7
9
74
21
61
43
0
1
55
1.10
66388365--66388420
12
4.5
12
81
16
69
42
0
1
55
1.10
66389734--66389772
18
2.1
19
90
4
62
41
0
10
48
1.37
66390263--66390303
19
2.2
19
87
12
59
46
0
24
29
1.53
66392392--66392454
24
2.8
23
83
9
69
61
1
15
20
1.41
66392392--66392455
21
2.9
21
80
15
67
60
1
15
21
1.43
66392388--66392507
21
5.2
21
64
20
62
57
1
15
25
1.47
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
66392480--66392745
27
10.4
27
73
17
212
60
0
11
27
1.31
66392470--66392745
76
3.6
76
94
0
473
60
0
12
26
1.32
66392388--66392836
49
9.4
48
72
18
232
61
0
12
25
1.35
66392729--66392761
16
2.0
17
88
5
50
69
0
0
30
0.88
66392660--66392810
43
3.4
43
82
9
162
62
0
9
27
1.26
66392800--66392833
17
2.0
17
88
11
52
64
0
17
17
1.29
66393257--66393332
5
13.8
5
75
16
62
53
0
15
30
1.42
66393248--66393351
23
4.2
24
73
17
79
53
0
16
29
1.43
66393248--66393332
28
3.0
26
78
13
89
55
0
15
29
1.41
66397375--66397431
29
2.0
29
86
6
80
50
3
1
43
1.29
66397579--66397623
19
2.3
20
92
3
74
24
11
20
44
1.83
66404135--66404181
22
2.1
22
100
0
94
57
19
14
8
1.63
66405425--66405482
18
3.4
18
68
18
61
41
17
8
32
1.80
66406435--66406506
33
2.2
33
88
11
105
54
6
0
38
1.28
66407384--66407425
21
2.0
22
86
13
61
71
7
0
21
1.09
66407345--66407587
90
2.7
88
78
10
278
58
12
4
24
1.54
66408095--66408160
27
2.4
27
92
0
105
48
31
1
18
1.57
66408321--66408465
46
3.2
44
74
12
141
24
27
13
34
1.93
66408337--66408499
46
3.6
45
74
11
147
25
24
12
36
1.91
66408459--66408714
113
2.2
114
91
1
406
33
18
21
25
1.96
66410693--66410735
21
2.0
21
95
0
77
72
0
2
25
0.97
66412373--66413060
342
2.0
342
99
0
1349
30
20
19
28
1.97
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
66419359--66419422
11
5.6
11
73
17
51
76
3
9
10
1.12
66419359--66419422
23
2.8
22
75
15
67
76
3
9
10
1.12
66419365--66419422
17
3.4
17
76
4
64
77
3
8
10
1.10
66427615--66427658
23
1.9
23
86
9
63
70
2
6
20
1.21
66437659--66437707
7
6.7
7
80
15
55
67
0
4
28
1.09
66437650--66437707
29
2.0
29
100
0
116
68
0
6
24
1.13
66437703--66437733
5
6.2
5
92
0
53
58
0
3
38
1.15
66441311--66441554
63
3.9
62
83
3
283
27
4
32
35
1.77
66441311--66441554
126
1.9
126
85
3
330
27
4
32
35
1.77
66443270--66443388
7
17.0
7
85
0
103
39
0
26
33
1.62

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
          81   82   83   84   85   86   87   88   89   90   91   92   93   94   95   96   
          97   98   99   100   101   102   103   104   105   106   107   108   109   110   111   112   
          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
          193   194   195   196   197   198   199   200   201   202   203   204   205   206   207   208   
          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   326   327   328   329   330   331   332