Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09
Please cite: G. Benson, "Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences" Nucleic Acid Research(1999) Vol. 27, No. 2, pp. 573-580. Sequence: Gbar_A13 Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000 Length: 109233746

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  243  of  332  ( 39766 repeats found )
Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
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Matches
Percent
Indels
Score
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Score
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Score
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1.71
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
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A
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(0-2)
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1.09
81026096--81026140
21
2.1
21
84
8
56
60
8
0
31
1.28
81042913--81043177
45
6.0
45
89
2
376
26
27
21
24
1.99
81044002--81044080
25
3.2
24
84
10
88
49
10
13
26
1.74
81044012--81044088
25
3.1
25
88
7
120
49
10
11
28
1.72
81044046--81044090
14
3.4
14
70
17
51
48
8
11
31
1.69
81050478--81050724
45
5.7
44
86
7
328
26
25
22
25
2.00
81050478--81050724
129
1.9
131
88
6
378
26
25
22
25
2.00
81051538--81051633
25
3.8
25
87
5
133
45
10
17
26
1.80
81051591--81051635
14
3.4
14
70
17
51
48
8
11
31
1.69
81053915--81054039
46
2.7
46
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8
166
27
20
30
22
1.98
81053919--81054085
46
3.6
46
84
8
157
26
18
31
23
1.97
81056700--81056855
43
3.7
41
80
6
150
22
17
26
33
1.96
81056747--81056851
42
2.5
42
80
1
129
24
18
23
33
1.97
81057501--81057544
23
2.0
22
86
4
61
25
0
20
54
1.45
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
81065139--81065288
43
3.5
41
78
6
124
30
24
18
26
1.98
81073946--81073983
20
1.9
20
84
10
51
55
5
7
31
1.51
81074451--81074517
19
3.0
24
63
24
65
44
2
5
46
1.43
81076484--81076590
42
2.6
41
73
10
99
28
26
14
30
1.94
81086313--81086387
29
2.6
29
89
0
105
29
32
17
21
1.96
81086619--81086653
8
4.4
8
92
0
61
14
22
20
42
1.88
81095707--81095850
40
3.6
40
95
0
243
21
18
31
29
1.97
81104022--81104245
40
5.6
40
95
0
394
23
17
29
29
1.97
81106456--81106500
21
2.1
21
100
0
90
24
22
22
31
1.99
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2.0
69
97
0
260
38
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10
34
1.84
81117073--81117126
17
3.2
16
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22
7
7
62
1.46
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42
3.6
42
75
10
143
30
14
24
31
1.94
81119191--81119358
85
2.0
84
80
5
187
29
14
25
31
1.94
81123078--81123102
13
1.9
13
100
0
50
32
0
20
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1.50
81124186--81124329
44
3.4
42
81
9
141
23
16
26
33
1.96
81124189--81124329
42
3.3
42
80
8
135
24
17
26
31
1.97
81124522--81124567
21
2.3
20
82
10
58
30
0
23
45
1.53
81128719--81128843
48
2.6
48
85
2
153
25
18
28
28
1.98
81133527--81133552
13
2.0
13
100
0
52
46
0
0
53
1.00
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40
5.5
40
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2
334
23
23
28
24
2.00
81140504--81140585
40
2.0
40
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0
146
23
24
24
28
2.00
81145708--81145765
21
2.8
21
91
0
89
15
34
25
24
1.95
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
81162524--81162552
13
2.2
13
100
0
58
31
0
13
55
1.39
81162846--81162884
19
2.1
19
85
9
53
23
10
0
66
1.22
81171239--81171294
17
3.4
17
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50
21
0
28
1.49
81171235--81171294
15
4.0
15
75
12
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50
23
0
26
1.50
81174777--81174887
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143
23
14
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1.93
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43
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169
23
15
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1.94
81184683--81184797
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2
131
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22
29
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5.1
56
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0
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7
204
25
22
27
24
2.00
81187188--81187372
40
4.7
40
82
6
207
25
22
27
24
2.00

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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