Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A13
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  109233746

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
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This is table  102  of  332  ( 39766 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
33041216--33041254
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2.0
20
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90
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15
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1.96
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2.7
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1
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1.35
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3.1
18
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19
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1.27
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0
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1.02
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100
0
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1.00
33047925--33047981
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1
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1.00
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27
27
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2.1
12
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0
50
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16
0
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1.02
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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1
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1.00
33070688--33070744
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60
3
17
1
77
1.00
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20
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28
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2.5
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0
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25
30
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100
0
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2.2
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26
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20
28
1.98
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2.9
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248
23
27
19
29
1.98
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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1.9
116
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1.84
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178
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28
30
1.95
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6.6
27
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173
26
14
28
30
1.95
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2.2
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7
211
26
15
28
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1.96
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22
28
22
1.99
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2.0
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29
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29
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1.98
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3.8
24
77
15
86
75
5
7
12
1.18
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
33220634--33220697
28
2.3
28
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12
80
73
6
15
4
1.20
33220634--33220715
28
3.0
26
79
15
76
69
6
15
8
1.34
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11
4.6
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33
18
12
35
1.89
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1.9
25
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69
27
16
22
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1.96
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55
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161
28
29
24
17
1.97
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27
2.3
26
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84
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23
1.93
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2.1
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185
32
20
27
19
1.97
33236919--33237037
27
4.4
27
89
0
166
25
21
20
32
1.97
33236919--33237037
54
2.2
54
90
0
184
25
21
20
32
1.97
33244657--33244708
27
1.9
27
84
0
68
65
1
25
7
1.30
33246101--33246134
4
9.0
4
93
6
54
20
0
0
79
0.73
33248992--33249185
55
3.6
53
78
2
199
17
24
20
37
1.94
33255319--33255371
23
2.4
22
76
20
56
9
18
1
69
1.25
33256759--33256811
23
2.4
22
76
20
56
9
18
1
69
1.25
33272060--33272241
79
2.3
80
84
6
237
25
28
22
24
2.00
33272039--33272241
39
5.1
40
81
9
229
25
28
22
24
1.99
33287050--33287087
20
2.0
20
85
10
53
2
21
2
73
1.07
33289893--33289926
15
2.2
15
89
5
50
20
17
5
55
1.62
33289926--33289958
10
3.4
10
91
8
50
0
12
3
84
0.72
33298432--33298472
17
2.4
18
80
8
50
14
24
4
56
1.58
33298403--33298456
24
2.2
25
78
15
60
11
22
3
62
1.43
33300709--33300782
13
5.8
13
74
19
66
14
9
2
72
1.20
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
33300709--33300752
22
2.0
23
90
4
72
13
6
2
77
1.07
33300731--33300785
28
2.0
28
89
7
85
16
10
5
67
1.39
33303566--33303660
36
2.6
36
78
6
102
23
21
24
31
1.98
33303660--33303770
42
2.6
43
92
2
188
12
26
30
30
1.93
33304102--33304222
45
2.7
44
89
5
179
27
19
23
30
1.98
33308483--33308545
21
3.0
21
83
2
72
33
31
4
30
1.78
33308939--33308963
13
1.9
13
100
0
50
36
16
32
16
1.90
33309442--33309538
30
3.2
30
76
2
97
28
14
26
29
1.95
33311463--33311608
28
5.2
27
79
8
150
28
34
13
23
1.93
33311463--33311608
57
2.6
54
78
8
150
28
34
13
23
1.93
33313704--33313812
26
4.2
26
91
0
182
33
7
23
34
1.83
33317855--33317937
30
2.7
30
78
9
80
13
21
1
63
1.35
33320512--33320576
12
5.4
12
75
25
50
61
0
24
13
1.32
33322796--33322834
15
2.6
14
84
15
51
0
17
2
79
0.84
33322796--33322845
20
2.4
20
80
16
57
0
18
4
78
0.91
33324816--33324970
46
3.3
46
72
15
156
22
21
27
28
1.99
33333782--33333943
46
3.5
46
75
15
172
20
20
29
29
1.98
33335830--33335873
12
3.6
12
87
12
63
15
6
6
70
1.31
33335813--33335851
19
2.2
17
90
9
60
15
7
2
74
1.15
33337539--33337636
30
3.3
30
75
0
97
29
16
26
27
1.97
33340446--33340498
23
2.4
22
76
20
56
9
18
1
69
1.25
33342318--33342378
20
3.0
20
86
9
79
31
13
27
27
1.94
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
33346915--33346953
11
3.5
11
82
10
53
15
5
5
74
1.17
33347317--33347366
14
3.6
14
86
0
64
42
4
32
22
1.72
33347317--33347375
28
2.1
28
87
0
82
38
3
32
25
1.72
33350831--33350884
20
2.7
20
82
0
63
24
20
18
37
1.94
33350831--33350904
30
2.5
30
86
8
98
21
20
18
39
1.93
33350831--33350895
20
3.2
20
71
16
53
23
21
16
38
1.93
33352405--33352437
12
2.8
12
86
13
50
81
9
3
6
0.95
33352407--33352437
11
2.7
11
95
5
53
83
6
3
6
0.88
33354772--33354818
20
2.3
20
85
0
67
29
36
12
21
1.91
33359193--33359239
20
2.3
20
85
0
67
29
36
12
21
1.91

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
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          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
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          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
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          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
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          321   322   323   324   325   326   327   328   329   330   331   332