Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A13
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  109233746

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
          81   82   83   84   85   86   87   88   89   90   91   92   93   94   95   96   
          97   98   99   100   101   102   103   104   105   106   107   108   109   110   111   112   
          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
          193   194   195   196   197   198   199   200   201   202   203   204   205   206   207   208   
          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   326   327   328   329   330   331   332   

This is table  274  of  332  ( 39766 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
91529546--91529589
24
1.9
22
82
17
54
38
2
2
56
1.24
91530854--91530892
20
1.9
20
89
5
60
15
7
2
74
1.15
91531698--91531783
39
2.2
40
89
6
131
37
1
4
56
1.27
91532174--91532215
21
2.0
21
100
0
84
33
4
4
57
1.41
91536567--91536611
23
2.0
23
91
4
74
40
22
4
33
1.74
91536555--91536611
22
2.6
22
84
13
73
42
21
5
31
1.75
91536567--91536624
19
2.8
20
84
10
64
39
18
6
34
1.78
91538605--91538664
29
2.0
29
84
9
77
25
33
31
10
1.89
91539322--91539372
26
2.0
26
96
0
93
54
9
11
23
1.66
91543136--91543184
3
16.3
3
89
0
71
2
26
0
71
0.97
91547832--91547873
3
14.0
3
94
0
75
0
35
0
64
0.94
91549228--91549268
19
2.1
18
86
13
55
51
0
4
43
1.23
91549353--91549409
9
6.2
9
74
11
53
54
1
0
43
1.10
91549347--91549409
28
2.3
29
81
13
71
55
1
0
42
1.09
91549666--91549765
11
8.7
11
68
22
55
43
5
0
52
1.23
91549685--91549716
16
2.0
16
93
0
55
53
6
0
40
1.26
91549812--91549854
11
4.2
11
80
14
56
23
0
2
74
0.93
91552657--91552764
26
4.2
26
91
0
180
33
7
23
36
1.83
91554252--91554304
26
2.0
26
85
7
72
37
22
15
24
1.92
91556765--91556798
14
2.4
14
85
0
50
52
8
2
35
1.47
91561452--91561814
46
7.9
45
87
3
433
21
23
13
41
1.88
91561457--91561816
92
3.9
92
88
1
499
21
23
13
41
1.88
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
91561467--91561816
183
1.9
184
88
1
524
21
23
12
42
1.87
91565290--91565379
29
3.1
29
90
1
128
31
27
12
28
1.93
91571307--91571336
16
1.9
16
93
6
53
16
0
10
73
1.09
91571311--91571361
25
2.0
25
82
14
61
17
0
9
72
1.11
91583667--91583691
12
2.1
12
100
0
50
92
0
8
0
0.40
91584628--91584820
88
2.2
88
80
2
199
32
21
16
29
1.95
91584695--91584842
44
3.4
44
68
3
136
34
23
14
27
1.93
91586689--91586732
17
2.6
17
76
16
56
29
9
0
61
1.27
91586907--91586936
16
1.9
16
93
6
53
16
0
10
73
1.09
91586911--91586961
25
2.0
25
82
14
61
17
0
9
72
1.11
91589924--91589984
23
2.7
22
80
9
70
45
0
3
50
1.17
91590731--91590787
27
2.2
27
90
6
91
70
0
0
29
0.88
91598873--91598929
27
2.1
27
96
0
105
52
3
3
40
1.35
91598883--91598940
27
2.1
27
87
0
80
55
5
6
32
1.49
91602668--91602694
14
1.9
14
100
0
54
29
18
22
29
1.97
91606715--91606780
33
2.0
33
82
5
80
30
24
16
28
1.97
91610909--91610963
25
2.2
26
87
9
78
34
0
0
65
0.93
91610908--91610965
26
2.2
27
82
14
77
34
0
0
65
0.93
91610998--91611164
12
13.6
12
71
14
83
31
2
1
64
1.14
91611033--91611137
19
5.5
19
68
20
67
31
3
0
63
1.18
91611028--91611144
26
4.6
26
74
12
107
32
3
0
63
1.17
91611040--91611118
14
5.6
14
80
17
83
32
5
1
60
1.26
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
91610942--91611167
58
3.9
60
75
15
149
34
2
1
61
1.20
91610995--91611164
26
5.7
29
74
20
79
31
2
1
64
1.13
91611556--91611638
43
2.1
41
82
17
104
30
2
10
56
1.46
91615168--91615200
16
2.1
16
94
0
57
54
0
42
3
1.15
91631633--91631765
33
4.0
33
84
5
171
30
23
18
27
1.98
91638652--91638742
45
2.0
45
100
0
182
39
10
6
42
1.66
91643121--91643253
33
4.0
33
81
0
158
32
21
20
25
1.98
91643121--91643253
66
2.0
66
85
0
176
32
21
20
25
1.98
91646175--91646398
46
4.8
46
78
13
226
27
17
31
23
1.97
91646177--91646445
47
5.7
49
78
12
228
27
17
30
24
1.97
91646177--91646436
140
1.9
141
83
7
350
28
17
30
24
1.97
91647494--91647532
6
6.3
6
94
5
69
15
0
0
84
0.62
91647489--91647542
13
4.1
13
88
9
74
14
3
0
81
0.82
91649855--91649994
27
5.2
28
87
5
166
34
22
24
18
1.96
91649855--91649994
54
2.6
55
86
2
185
34
22
24
18
1.96
91650095--91650172
26
2.9
27
82
5
86
32
15
20
32
1.94
91651613--91651772
26
6.2
25
92
5
239
36
23
5
33
1.79
91651613--91651772
52
3.1
52
95
1
277
36
23
5
33
1.79
91651613--91651772
78
2.1
78
96
0
293
36
23
5
33
1.79
91655429--91655530
34
2.7
39
75
20
108
37
14
9
38
1.80
91655921--91655972
25
2.0
26
85
10
72
0
28
3
67
1.08
91655985--91656015
12
2.6
12
94
0
53
0
9
3
87
0.66
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
91656197--91656225
5
6.0
5
96
4
51
58
0
0
41
0.98
91665880--91666034
25
6.4
24
69
12
93
34
20
25
18
1.96
91674278--91674326
19
2.5
20
75
18
50
34
4
8
53
1.50
91677323--91677355
15
2.1
17
88
11
52
39
0
0
60
0.97
91681159--91681247
9
9.7
9
85
3
115
38
0
4
57
1.19
91681436--91681512
8
10.6
7
71
20
52
76
1
2
19
0.97
91681436--91681479
19
2.2
20
88
8
63
77
0
0
22
0.77
91681435--91681487
20
2.7
19
80
11
63
75
0
0
24
0.80
91681436--91681513
24
3.2
24
81
13
72
76
1
2
19
0.96
91681436--91681524
13
6.0
14
73
19
65
75
2
2
20
1.02
91681552--91681621
30
2.5
26
75
20
70
65
5
7
21
1.38
91681544--91681748
114
1.8
112
81
11
256
63
9
5
20
1.45
91681699--91682337
154
4.2
155
90
5
984
60
7
5
26
1.45
91681699--91682333
299
2.1
304
89
5
982
60
7
5
26
1.46
91682268--91682335
30
2.5
25
72
20
64
70
4
1
23
1.13
91689526--91689589
33
1.9
33
87
0
92
18
15
43
21
1.87
91691653--91692270
155
4.2
149
87
8
895
27
5
7
59
1.48
91692130--91692368
119
2.0
120
92
0
399
28
5
7
58
1.50
91691975--91692555
273
2.1
274
91
2
929
27
5
7
59
1.49
91692249--91692541
153
1.9
150
91
3
480
26
5
8
59
1.48
91693081--91693125
20
2.2
20
88
0
63
0
28
0
71
0.87
91693396--91693694
154
1.9
153
89
3
458
30
16
12
41
1.84
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
91695128--91695173
22
2.1
22
95
0
83
47
0
0
52
1.00
91695135--91695181
22
2.1
22
92
0
76
46
2
0
51
1.13
91698679--91698722
18
2.5
17
82
13
54
34
6
2
56
1.38
91698679--91698737
19
3.2
19
81
11
52
33
6
1
57
1.35
91700078--91700224
26
5.6
25
79
6
141
59
4
4
31
1.37
91700081--91700227
52
2.8
52
80
4
170
59
4
4
31
1.39
91700982--91701019
20
1.9
20
88
0
58
84
2
2
10
0.83
91701392--91701419
14
2.0
14
100
0
56
28
0
7
64
1.20
91703692--91703734
16
2.7
16
100
0
86
27
13
30
27
1.95
91708720--91708982
47
5.6
47
86
2
348
33
8
29
28
1.86
91711205--91711552
40
8.7
40
91
1
556
24
22
28
24
1.99
91715336--91715598
47
5.6
47
89
1
382
31
8
30
28
1.87
91720386--91720433
15
3.3
15
81
16
57
39
12
25
22
1.89
91724547--91724596
12
3.9
13
71
12
50
60
0
6
34
1.21
91724626--91724690
21
3.2
20
82
10
78
61
0
3
35
1.12
91724622--91724739
18
6.5
18
70
18
84
60
1
4
33
1.26
91724771--91724821
19
2.7
19
84
3
68
68
1
3
25
1.17
91727356--91727404
25
2.0
25
84
8
64
34
2
4
59
1.28
91729342--91729468
60
2.1
59
81
9
143
25
19
26
27
1.99
91729824--91729865
18
2.3
18
95
0
75
28
19
11
40
1.87
91732916--91732953
19
2.0
19
94
0
67
50
15
7
26
1.72
91733014--91733077
16
4.1
16
89
4
103
37
6
34
21
1.79
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
91733014--91733077
31
2.0
32
93
3
112
37
6
34
21
1.79
91733329--91733733
102
3.8
102
81
14
521
52
4
0
42
1.28
91733291--91733565
119
2.3
120
97
0
516
52
3
0
43
1.24
91733497--91733540
22
2.0
23
86
4
63
61
2
0
36
1.09
91733522--91733669
26
5.8
26
68
20
80
54
3
0
41
1.22
91733622--91733662
13
3.2
12
80
12
55
58
0
0
41
0.98
91751179--91751274
30
3.2
30
82
5
131
15
44
18
20
1.86
91754358--91754398
20
2.0
20
100
0
82
34
9
31
24
1.88
91758817--91758845
14
2.1
14
93
6
51
62
0
0
37
0.96
91766357--91766403
23
2.0
24
84
8
62
46
4
0
48
1.21

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
          81   82   83   84   85   86   87   88   89   90   91   92   93   94   95   96   
          97   98   99   100   101   102   103   104   105   106   107   108   109   110   111   112   
          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
          193   194   195   196   197   198   199   200   201   202   203   204   205   206   207   208   
          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   326   327   328   329   330   331   332