Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A13
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  109233746

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  264  of  332  ( 39766 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
88297503--88297563
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82
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2
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1.47
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
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34
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19
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28
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27
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1.94
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22
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7
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26
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21
1.68
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Period
Size
Copy
Number
Consensus
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Score
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2.2
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1.67
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21
1.9
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0
53
42
7
2
47
1.45
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
88422030--88422112
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39
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6
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1.46
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0
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105
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34
0
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28
6
2
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1.31
88437470--88437564
43
2.2
44
86
5
131
27
20
25
27
1.99
88437830--88437985
44
3.6
42
77
8
143
38
19
17
23
1.93
88438078--88438200
41
3.0
42
90
2
203
29
19
21
29
1.98
88438996--88439026
11
2.8
11
100
0
62
9
25
48
16
1.76
88439831--88439856
3
8.7
3
100
0
52
34
0
0
65
0.93
88440153--88440195
3
13.7
3
82
4
50
27
6
2
62
1.33
88450475--88450616
69
2.1
69
95
0
257
32
23
14
29
1.94
88451247--88451308
30
2.1
30
96
0
115
40
17
16
25
1.90
88454725--88454760
18
2.0
18
88
0
54
0
50
0
50
1.00
88455214--88455284
3
23.3
3
71
8
54
30
2
5
60
1.34
88455227--88455287
23
2.8
22
85
5
70
32
3
8
55
1.45
88455250--88455295
23
2.0
23
83
8
58
30
2
10
56
1.46
88467281--88467389
56
1.9
56
87
3
157
26
17
26
29
1.97
88467333--88468177
74
11.4
73
84
6
990
29
16
21
31
1.95
88467333--88468312
146
6.8
146
83
7
1110
30
16
21
32
1.95
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
88467838--88468131
159
1.9
159
88
2
448
28
17
22
31
1.96
88468056--88468295
128
1.9
129
87
2
358
32
16
18
32
1.93
88469530--88469556
9
3.0
9
100
0
54
88
0
0
11
0.50
88470140--88470210
3
23.3
3
71
8
54
30
2
5
60
1.34
88470153--88470213
23
2.8
22
85
5
70
32
3
8
55
1.45
88470176--88470221
23
2.0
23
83
8
58
30
2
10
56
1.46
88475831--88475877
24
2.0
24
86
0
67
51
12
19
17
1.77
88475831--88475881
8
6.4
8
75
8
50
52
11
19
15
1.73
88476097--88476198
28
3.6
28
76
5
98
32
10
27
29
1.90
88477002--88477122
60
2.0
60
96
0
224
31
9
16
42
1.81
88485787--88485918
12
11.4
11
67
22
58
41
1
3
53
1.28
88494902--88494937
16
2.2
16
95
0
63
22
16
2
58
1.51
88498520--88498565
21
2.2
20
81
7
56
50
2
13
34
1.53
88499951--88500030
14
5.6
14
74
2
70
23
1
27
47
1.59
88499985--88500029
22
2.0
22
86
0
63
24
0
26
48
1.51
88502046--88502121
27
2.8
26
84
7
98
60
2
3
32
1.29
88502576--88502609
17
1.9
18
88
5
52
55
8
0
35
1.31
88505566--88505618
26
2.0
27
85
10
74
33
1
1
62
1.17
88507325--88507413
5
17.4
5
70
19
60
32
3
0
64
1.10
88507325--88507413
11
8.7
10
70
21
60
32
3
0
64
1.10
88510902--88511035
30
4.5
29
85
1
160
26
46
4
22
1.71
88511684--88511748
25
2.8
24
88
6
98
33
4
6
55
1.45
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
88511909--88511958
8
6.5
8
93
2
68
30
0
8
62
1.24
88511917--88511965
16
3.1
16
85
11
66
30
0
4
65
1.11
88513511--88513562
24
2.2
24
79
3
61
25
1
11
61
1.40
88514952--88514977
3
8.7
3
100
0
52
65
0
0
34
0.93
88516587--88517054
44
10.7
44
72
10
268
28
21
18
31
1.97
88516567--88517054
175
2.8
175
94
1
836
28
21
19
30
1.97
88517144--88517461
125
2.5
125
87
2
442
25
18
20
35
1.95
88517144--88517502
125
2.9
125
82
5
440
25
19
20
34
1.96
88517437--88517710
98
2.8
99
82
2
289
22
20
22
33
1.97
88517718--88517849
45
3.0
45
75
8
135
22
21
25
29
1.99

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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