Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A13
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  109233746

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  3  of  332  ( 39766 repeats found )

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Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
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Entropy
(0-2)
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Period
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Percent
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1
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Indices
Period
Size
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Number
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Percent
Indels
Score
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18
152
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2
2
48
1.33
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
1021238--1021380
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2
2
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1.25
1021204--1021419
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2.4
91
90
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1.33
1021238--1021404
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15
139
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2
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0
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0.81
1029316--1029450
50
2.7
50
77
12
150
26
5
5
62
1.37
1029335--1029621
26
11.2
25
72
8
193
29
5
4
60
1.39
1029697--1029761
26
2.5
26
82
9
87
29
1
4
64
1.22
1029703--1029782
27
3.0
26
83
8
90
28
0
5
66
1.13
1031288--1031426
70
2.0
70
98
0
269
40
9
10
40
1.71
1031615--1031642
14
2.0
14
100
0
56
42
0
14
42
1.45
1032064--1032093
15
2.0
15
100
0
60
33
13
0
53
1.40
1035635--1035668
17
2.0
17
94
0
59
44
50
0
5
1.26
1040273--1040306
17
2.0
17
94
0
59
44
50
0
5
1.26
1043990--1044042
26
2.0
27
85
7
74
24
15
22
37
1.92
1045534--1045615
26
3.2
26
96
0
155
36
26
6
30
1.81
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
1048888--1048918
12
2.6
12
94
0
53
9
9
41
38
1.71
1051151--1051180
15
2.0
15
93
0
51
30
6
6
56
1.51
1060085--1060132
3
16.0
3
91
0
78
70
0
29
0
0.87
1068646--1068730
42
2.0
42
100
0
170
31
14
7
47
1.71
1070188--1070220
9
3.8
9
96
4
59
57
6
0
36
1.23
1075078--1075921
105
8.0
105
91
1
1273
41
13
19
25
1.88
1077648--1077684
19
2.0
19
89
5
58
56
0
2
40
1.13
1078067--1078116
17
2.7
20
78
18
70
10
0
44
46
1.37
1082705--1082754
17
2.7
20
78
18
70
10
0
44
46
1.37
1083624--1083685
4
15.5
4
96
0
106
25
3
24
46
1.67
1084177--1084216
19
2.0
20
86
13
57
32
15
0
52
1.43
1088968--1089008
21
2.0
21
90
0
64
29
21
29
19
1.98
1095992--1096045
26
2.1
27
82
6
67
24
14
24
37
1.93
1096009--1096084
26
2.8
27
82
4
82
27
13
22
36
1.91
1097534--1097590
26
2.2
26
90
0
96
35
28
7
29
1.83
1098781--1098814
16
2.1
17
88
5
52
38
0
2
58
1.13
1098883--1098925
17
2.6
16
82
13
52
37
4
0
58
1.19
1098948--1099040
40
2.2
41
81
12
100
29
6
2
62
1.32
1099066--1099104
21
1.9
20
85
15
53
33
0
2
64
1.08
1111050--1111281
119
1.9
119
89
1
358
33
17
18
30
1.94
1111199--1111724
83
6.3
83
94
1
858
33
19
19
27
1.96
1113314--1113347
16
2.1
17
88
5
52
38
0
2
58
1.13
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
1113480--1113573
42
2.2
42
81
11
102
28
6
2
62
1.31
1113599--1113637
20
2.0
20
85
10
53
35
0
2
61
1.10
1115019--1115070
26
2.0
26
81
7
61
25
15
19
40
1.90
1116558--1116717
26
6.2
26
90
0
257
34
23
8
33
1.86
1116558--1116717
52
3.1
52
97
0
293
34
23
8
33
1.86
1119815--1119851
20
1.9
18
89
10
56
35
21
0
43
1.53
1121987--1122093
26
4.2
26
86
2
162
35
24
8
31
1.85
1121987--1122093
51
2.1
52
91
1
171
35
24
8
31
1.85
1122230--1122615
197
2.0
197
98
0
745
30
23
12
33
1.91
1126449--1126501
15
3.6
14
73
12
52
52
3
0
43
1.19

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
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          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
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          321   322   323   324   325   326   327   328   329   330   331   332