Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A13
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  109233746

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
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          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
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This is table  293  of  332  ( 39766 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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0
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21
1.87
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
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Indels
Score
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Indices
Period
Size
Copy
Number
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Score
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19
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0
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20
33
1.51
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
97726815--97726844
14
2.1
14
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11
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0
14
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0
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52
60
11
0
27
1.31
97748519--97748557
13
2.9
13
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3
51
61
10
0
28
1.28
97762508--97762636
3
42.3
3
70
7
73
29
6
0
62
1.26
97762533--97762614
18
4.5
18
87
3
101
29
9
1
59
1.37
97762540--97762610
37
1.9
37
85
0
97
28
11
1
59
1.40
97762602--97762655
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2.2
24
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25
3
0
70
1.04
97762614--97762661
25
2.0
25
83
4
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27
4
0
68
1.07
97767789--97767827
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10
80
6
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87
7
0
5
0.68
97768957--97769100
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3.1
46
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0
189
30
14
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1.95
97769890--97770163
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44
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28
1.97
97771624--97771830
3
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3
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31
5
0
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1.26
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26
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26
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0
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1.60
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19
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19
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23
58
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11
26
14
1.78
97776403--97776596
97
2.0
97
100
0
388
31
18
19
29
1.96
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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18
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0
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10
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0
0
50
1.00
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15
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44
0
1
53
1.08
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1.9
20
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0
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0
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1.96
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18
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1.91
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0
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22
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29
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28
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26
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13
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35
0
0
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0.94
97802966--97803013
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2.5
20
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35
0
0
64
0.94
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2.9
26
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35
2
0
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1.10
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14
100
0
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0
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3
0
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1.08
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91
29
7
1
62
1.29
97808530--97808599
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14
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1
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1.20
97808519--97808611
37
2.5
36
84
8
116
36
1
3
59
1.21
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
97808519--97808583
23
2.8
23
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36
0
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1.13
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19
3.2
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1
1
63
1.13
97820703--97821165
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19
27
1.96
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3.4
174
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2
942
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19
19
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1.96
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0
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0
2
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1.01
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14
3.8
14
80
5
63
41
13
3
41
1.62

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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