Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A13
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  109233746

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  272  of  332  ( 39766 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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25
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1.72
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
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Indels
Score
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C
G
T
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2
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221
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1
9
54
1.44
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
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Entropy
(0-2)
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20
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55
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14
22
36
1.92
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
91164080--91164126
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2.3
21
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1.91
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52
78
2
143
25
16
28
30
1.96
91197205--91197321
44
2.7
43
84
2
146
31
28
17
23
1.96
91199199--91199282
34
2.5
35
79
11
95
29
21
22
26
1.99
91210842--91210925
34
2.5
35
79
11
95
29
21
22
26
1.99
91216386--91216492
43
2.5
43
81
0
124
31
14
25
28
1.95
91220241--91220311
25
2.8
26
77
8
76
33
14
19
32
1.92
91220241--91220407
25
6.7
25
64
11
65
33
11
22
32
1.90
91224248--91224290
12
3.5
12
79
14
52
51
0
2
46
1.13
91227732--91227765
17
1.9
18
88
5
52
32
0
2
64
1.08
91228393--91228446
22
2.4
23
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9
58
70
3
0
25
1.04
91229290--91229323
16
2.1
16
100
0
68
44
5
17
32
1.73
91230752--91230834
41
2.0
41
95
0
148
42
13
6
38
1.69
91231322--91231388
30
2.2
30
81
7
73
31
4
7
56
1.47
91231332--91231390
30
1.9
31
86
3
84
30
3
10
55
1.49
91232415--91232460
11
4.4
11
83
8
60
28
23
0
47
1.52
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
91232654--91232705
25
2.1
24
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3
59
26
1
1
69
1.10
91237208--91237572
129
2.9
127
90
4
560
35
4
4
55
1.39
91246536--91247357
46
18.0
46
88
2
1190
40
13
23
22
1.89
91246604--91246679
25
3.2
25
63
21
63
42
11
22
23
1.87
91246536--91247357
137
6.0
138
91
1
1190
40
13
23
22
1.89
91246536--91247357
183
4.5
184
89
2
1208
40
13
23
22
1.89
91255864--91255945
41
2.0
41
97
0
155
19
21
18
40
1.92
91259712--91259763
17
3.1
17
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75
1
17
5
1.10
91259707--91259753
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2.0
23
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0
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2
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4
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18
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6
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33
9
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40
1.81
91261654--91261791
18
7.7
18
73
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93
36
12
13
38
1.82
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4.6
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8
139
36
10
14
38
1.81
91261656--91261791
54
2.5
53
78
7
139
36
12
13
37
1.82
91261588--91261772
72
2.6
72
81
5
178
36
10
14
38
1.81
91261654--91261772
36
3.3
35
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107
36
11
13
37
1.81
91261811--91261870
18
3.3
18
80
0
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36
10
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36
1.82
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36
2.3
36
80
0
85
36
9
15
38
1.81
91261870--91261936
27
2.4
27
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5
71
40
5
10
43
1.63
91264427--91264476
26
1.9
26
100
0
100
24
22
16
38
1.93
91264543--91264578
17
2.1
18
89
5
56
30
2
0
66
1.06
91265293--91265345
20
2.7
19
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11
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50
0
3
45
1.19
91265582--91265623
15
2.7
16
85
7
59
47
2
11
38
1.53
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
91265583--91265644
15
4.1
15
77
8
54
45
3
9
41
1.53
91268630--91268655
12
2.2
12
100
0
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0
7
0
0.39
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1.9
13
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0
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24
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91298481--91298584
55
1.9
54
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2
136
16
26
33
23
1.95
91302779--91303290
120
4.2
120
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830
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2
5
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2.0
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0
0
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0.99
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2.0
19
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0
0
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37
0
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1.56
91303506--91303574
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2.1
32
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2
129
37
37
0
24
1.56
91307189--91307227
19
2.1
19
100
0
78
64
10
0
25
1.25

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
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