Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A13
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  109233746

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
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This is table  7  of  332  ( 39766 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
2012731--2012794
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19
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4
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1.41
2012725--2012790
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1.9
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17
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6
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1.50
2014164--2014202
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0
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0
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0
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2
0
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1.12
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2.5
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2.3
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26
0
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6.4
74
81
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505
31
17
20
30
1.96
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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76
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16
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2067263--2067748
74
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82
9
547
31
17
20
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1.96
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3.6
884
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6097
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16
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18
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2069711--2069784
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16
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0
0
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1
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57
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3.7
22
75
14
65
37
0
3
58
1.17
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2.7
25
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6
82
37
0
2
59
1.13
2102713--2102793
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13
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36
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0
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1.42
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101
84
4
262
32
16
23
27
1.96
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
2117865--2117942
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2.4
33
78
8
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32
16
25
25
1.96
2117728--2117959
105
2.3
100
81
6
250
32
16
24
26
1.96
2124940--2124990
26
2.0
26
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68
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27
27
13
1.94
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2.2
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6
62
31
29
24
14
1.94
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19
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10
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3
3
37
1.35
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2.3
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2
34
1.37
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23
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12
58
56
0
0
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0
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59
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52
9
14
1.71
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3.2
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10
2
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4.5
22
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13
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8
2
31
58
1.39
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20
2.4
21
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12
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6
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28
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1.28
2134043--2134089
21
2.2
22
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3
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6
2
27
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1.30
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3
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1
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1.18
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3
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18
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3
1
65
1.18
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2.5
19
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0
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0
0
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10
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83
16
0
0
0.65
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
2141529--2141683
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3.9
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41
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18
19
1.91
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43
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22
20
21
1.96
2141730--2142090
44
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43
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10
236
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22
20
21
1.96
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132
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36
22
20
20
1.96
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36
20
21
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1.96
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250
28
23
20
27
1.99
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42
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121
28
19
23
28
1.98
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41
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18
21
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1.97
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44
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30
18
22
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172
2.5
175
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3
695
31
18
22
27
1.97
2142726--2142979
132
1.9
132
93
0
436
31
18
23
26
1.97
2142602--2142982
44
8.7
44
73
9
210
31
18
23
26
1.97
2143266--2143307
22
1.9
22
85
9
59
23
52
9
14
1.71
2143373--2143484
22
5.0
22
74
22
90
14
1
28
55
1.49
2143405--2143451
21
2.2
21
92
3
76
6
0
27
65
1.16
2143381--2143450
21
3.2
21
80
15
72
10
1
28
60
1.38
2143791--2143873
3
27.3
3
73
20
59
30
3
1
65
1.17
2143794--2143873
12
6.8
12
75
12
76
30
3
1
65
1.18
2145633--2145683
23
2.2
23
82
6
59
15
5
0
78
0.93
2145597--2145684
38
2.3
40
83
13
105
18
7
1
72
1.15
2151860--2151930
36
2.0
36
81
10
83
38
15
12
33
1.85
2153001--2153045
22
2.1
22
87
4
65
42
2
13
42
1.56
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
2153867--2153892
13
2.0
13
100
0
52
46
0
0
53
1.00
2156047--2156088
15
2.7
16
78
14
52
61
0
0
38
0.96
2156047--2156104
15
3.6
16
75
17
50
60
1
0
37
1.07
2157696--2157827
54
2.4
54
85
1
183
34
11
4
50
1.59
2159491--2159543
26
2.0
26
82
7
63
26
15
18
39
1.90
2161004--2161059
26
2.2
26
100
0
112
35
26
7
30
1.83
2166116--2166246
66
2.0
66
93
0
226
32
10
20
35
1.87
2166466--2166499
16
2.1
16
89
10
52
44
0
5
50
1.26
2166477--2166621
47
3.1
47
72
16
158
44
2
3
49
1.30
2166463--2166589
44
2.8
43
73
15
123
46
2
3
47
1.34
2166686--2167186
120
4.2
120
97
0
943
44
2
5
48
1.38
2167015--2167049
18
2.0
17
88
5
52
45
0
0
54
0.99
2167148--2167189
15
2.7
16
82
14
52
50
0
2
47
1.14
2167334--2167424
45
2.0
45
85
2
121
37
28
6
27
1.82
2167405--2167473
16
4.2
16
90
3
111
37
34
0
27
1.57
2167405--2167473
33
2.1
32
91
2
111
37
34
0
27
1.57
2168101--2168135
17
2.0
18
88
5
54
28
0
2
68
1.04
2172607--2172652
21
2.2
21
96
0
83
36
23
15
23
1.93
2179204--2179236
17
2.0
17
94
5
59
54
0
0
45
0.99
2183865--2183900
6
5.8
6
90
3
54
77
2
2
16
1.00
2184766--2184833
29
2.3
29
97
0
127
51
2
10
35
1.51
2190891--2190936
19
2.4
19
82
17
60
39
0
8
52
1.33
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
2191592--2191690
31
3.2
30
72
13
76
54
14
7
24
1.64
2192849--2192906
19
3.1
18
78
9
53
41
1
10
46
1.48
2192957--2192992
3
12.0
3
87
0
54
0
27
0
72
0.85
2192954--2192992
15
2.6
15
91
0
60
0
25
0
74
0.82
2195920--2196243
127
2.5
126
89
2
488
26
16
19
36
1.93
2203775--2203843
21
3.4
21
71
15
72
36
1
7
55
1.37
2203830--2203860
15
2.1
14
94
5
53
35
3
6
54
1.42
2210063--2210113
24
2.2
22
86
6
66
35
1
3
58
1.28
2226456--2226504
9
5.4
9
80
9
55
85
0
10
4
0.71
2226456--2226502
12
3.9
12
77
8
51
85
0
10
4
0.74

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          321   322   323   324   325   326   327   328   329   330   331   332