Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A13
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  109233746

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  278  of  332  ( 39766 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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1.84
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Period
Size
Copy
Number
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Percent
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Indels
Score
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25
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22
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0
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22
1.84
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
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Percent
Indels
Score
A
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(0-2)
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136
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2
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34
1.50
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
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Entropy
(0-2)
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157
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29
1
19
1.57
93187189--93187236
20
2.4
21
82
10
64
25
0
6
68
1.12
93187177--93187236
20
3.1
20
77
13
63
25
0
5
70
1.08
93187309--93187343
16
2.2
16
89
0
52
31
0
0
68
0.90
93187366--93187477
43
2.6
43
89
0
179
25
21
30
22
1.99
93189248--93189303
3
18.7
3
100
0
112
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0
0
32
0.91
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15
2.0
15
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0
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20
10
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36
1.86
93192461--93192548
30
3.0
29
80
9
72
52
9
9
29
1.64
93193245--93193292
21
2.5
20
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12
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25
4
0
70
1.04
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2.0
23
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0
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19
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45
1.79
93202696--93202753
29
2.0
30
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1
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16
2
6
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1.11
93215487--93215536
17
2.9
17
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3
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16
2
6
76
1.08
93218111--93218136
3
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3
100
0
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0
0
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2
20.5
2
100
0
82
51
48
0
0
1.00
93223296--93223340
22
2.0
23
91
8
74
28
0
0
71
0.87
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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45
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4
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20
1.96
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20
1.9
18
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21
0
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1.53
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3.5
43
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8
152
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30
19
24
1.98
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46
4.6
46
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5
196
23
30
19
26
1.98
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2.1
16
100
0
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24
1.89
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3.8
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30
29
19
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1.97
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20
1.9
18
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35
21
0
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1.53
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2.7
25
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19
23
22
1.96
93243832--93243886
25
2.2
25
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6
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36
18
25
20
1.94
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10
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11
79
21
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1
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1.25
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20
1.9
20
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30
20
25
23
1.98
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1
0
72
0.93
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24
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22
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20
71
26
1
0
72
0.93
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14
4.8
14
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19
72
25
1
0
72
0.92
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5
14.6
5
77
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25
1
0
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0.91
93254953--93255022
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10
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20
10
1
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10
2.5
10
100
0
50
24
32
20
24
1.98
93281445--93281572
40
3.2
40
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1
213
22
21
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25
1.99
93289480--93289647
40
4.2
40
93
0
284
22
22
30
25
1.99
93297252--93297299
25
1.9
26
87
8
73
60
8
0
31
1.26
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2.1
18
100
0
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5
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1.79
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68
2.9
69
86
1
267
36
16
22
24
1.94
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
93303954--93303982
5
5.8
5
100
0
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0
0
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0.66
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2.1
15
100
0
62
35
19
0
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11
2.5
11
100
0
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18
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1.70
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2.1
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4
286
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4
4
47
1.41
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2.0
17
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0
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5
0
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1.26
93314262--93314300
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2.4
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5
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17
2.3
18
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5
0
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1.24
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0
1
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1.11
93314261--93314552
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2.4
120
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2
5
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1.38
93314514--93314555
15
2.7
16
82
14
52
45
0
2
52
1.13

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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