Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A13
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  109233746

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  204  of  332  ( 39766 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
67932983--67933036
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2
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67969940--67970063
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2.9
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117
29
24
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29
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2.6
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2.2
20
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4
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23
1.75
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
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Percent
Indels
Score
A
C
G
T
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22
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100
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79
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320
20
23
29
27
1.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
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Entropy
(0-2)
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1.8
118
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22
28
27
1.99
68088035--68088250
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22
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1.99
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22
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32
0
3
64
1.10
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
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Entropy
(0-2)
68127287--68127362
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37
0
1
61
1.04
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31
0
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1.01
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1.95
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34
2.2
33
78
2
85
29
12
18
39
1.87
68129132--68129195
34
1.9
34
87
3
94
32
14
14
39
1.85
68136975--68137018
22
2.0
22
90
0
70
22
13
36
27
1.92
68139759--68139812
23
2.3
22
81
12
63
57
7
20
14
1.61
68141173--68141252
40
2.0
41
82
7
101
6
18
3
71
1.23
68141273--68141309
5
7.4
5
100
0
74
59
0
0
40
0.97
68141321--68141368
19
2.5
19
86
6
62
35
6
4
54
1.45
68141321--68141372
18
2.7
19
88
5
70
34
7
3
53
1.48
68145045--68145108
21
2.9
22
81
11
60
64
1
1
32
1.13
68145068--68145132
11
6.4
10
75
13
62
66
1
1
30
1.10
68145068--68145133
10
6.6
10
72
11
55
65
1
1
31
1.11
68145045--68145132
18
4.1
21
76
15
83
63
1
2
32
1.14
68145257--68145336
20
4.0
20
72
3
72
70
6
1
22
1.17
68146923--68147032
45
2.5
45
82
8
120
20
19
20
40
1.92
68154512--68154621
26
4.2
26
97
0
184
36
24
5
33
1.79
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
68158154--68158225
35
2.1
35
100
0
144
41
13
11
33
1.80
68160808--68160878
28
2.5
29
81
9
83
29
4
0
66
1.11
68160838--68160910
19
3.7
19
76
8
67
32
2
1
63
1.17
68160925--68160991
27
2.4
29
80
9
77
28
1
2
67
1.14
68160934--68160977
19
2.4
18
85
11
54
29
0
4
65
1.12
68160950--68160987
18
2.1
19
90
5
60
28
2
2
65
1.19
68161024--68161057
18
2.0
17
88
11
52
23
0
0
76
0.79
68165640--68165695
29
2.0
28
85
3
76
39
16
12
32
1.85
68167380--68167755
94
4.0
94
96
0
680
30
10
19
39
1.85
68167784--68167847
24
2.7
24
85
4
85
21
15
29
32
1.95
68169269--68169321
21
2.7
19
81
13
63
67
1
3
26
1.17
68169756--68169818
32
2.0
32
87
0
90
44
9
4
41
1.58
68170991--68171082
34
2.7
34
79
3
114
45
16
5
32
1.70
68172502--68172557
20
2.8
20
83
2
69
33
23
16
26
1.95
68173937--68173972
3
12.0
3
87
0
54
63
5
0
30
1.17
68174371--68174434
29
2.2
29
80
0
74
25
37
18
18
1.94
68175235--68175259
13
1.9
13
100
0
50
32
4
24
40
1.73
68181185--68181234
25
2.0
25
84
0
64
38
6
14
42
1.70
68181332--68181369
20
1.9
20
88
0
58
18
13
31
36
1.89
68186802--68186851
19
2.6
19
74
22
52
70
4
0
26
1.05
68186802--68186859
9
6.3
9
77
18
57
70
5
0
24
1.07
68187469--68187503
16
2.1
17
89
5
54
65
5
5
22
1.36
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
68187851--68187881
15
2.0
16
93
6
55
29
0
0
70
0.87
68189150--68189197
23
2.1
23
96
0
87
18
25
14
41
1.88
68192239--68192301
16
4.1
16
72
8
60
39
0
1
58
1.07
68198850--68198892
21
2.0
21
95
0
77
44
11
11
32
1.77
68198919--68198986
34
2.0
34
100
0
136
26
5
20
47
1.73
68202517--68202651
58
2.3
57
86
5
182
44
0
2
51
1.21
68202816--68202869
16
3.4
16
84
5
74
29
27
3
38
1.74
68205712--68205842
50
2.6
51
86
2
192
32
13
13
39
1.84
68207655--68207748
50
2.0
46
81
12
109
35
30
1
32
1.65
68207747--68207806
3
19.0
3
89
6
84
33
33
0
33
1.58

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
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          97   98   99   100   101   102   103   104   105   106   107   108   109   110   111   112   
          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
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          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   326   327   328   329   330   331   332