Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A13
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  109233746

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
          81   82   83   84   85   86   87   88   89   90   91   92   93   94   95   96   
          97   98   99   100   101   102   103   104   105   106   107   108   109   110   111   112   
          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
          193   194   195   196   197   198   199   200   201   202   203   204   205   206   207   208   
          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   326   327   328   329   330   331   332   

This is table  68  of  332  ( 39766 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
20660488--20660662
46
3.8
46
76
14
198
21
21
29
28
1.98
20662695--20662746
14
3.7
14
92
0
86
38
50
1
9
1.46
20662764--20662825
28
2.2
29
82
2
72
48
22
3
25
1.66
20662786--20662838
22
2.5
21
75
3
52
54
24
0
20
1.44
20664705--20664889
79
2.3
81
82
7
218
24
22
27
25
2.00
20664706--20664889
40
4.6
40
80
9
198
25
22
27
25
2.00
20664758--20664922
79
2.1
79
82
6
192
26
20
27
25
1.99
20666284--20666309
7
3.7
7
100
0
52
76
0
0
23
0.78
20666423--20666461
10
4.0
10
86
6
53
74
0
15
10
1.07
20666426--20666459
9
3.7
9
92
4
50
76
0
14
8
1.01
20668012--20668143
34
4.0
34
85
9
184
25
6
5
62
1.41
20668036--20668130
30
3.0
30
87
9
120
25
5
6
63
1.40
20670787--20671051
43
6.2
42
73
9
146
30
16
24
28
1.96
20673647--20673968
42
7.7
42
87
3
436
32
23
21
22
1.98
20673647--20673968
84
3.8
84
89
0
484
32
23
21
22
1.98
20673647--20673967
126
2.6
126
90
1
493
32
23
20
22
1.98
20674367--20674430
24
2.5
26
78
14
62
1
14
6
78
1.02
20674385--20674432
26
1.9
26
87
8
73
0
14
4
81
0.84
20674383--20674431
16
3.2
15
83
11
55
0
14
4
81
0.83
20676355--20676465
44
2.6
43
78
8
109
29
14
23
32
1.94
20692228--20692374
44
3.4
43
76
8
129
31
24
19
24
1.98
20692213--20692377
43
3.9
42
75
8
127
32
24
19
23
1.98
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
20695143--20695301
21
7.6
21
78
0
129
44
16
22
16
1.86
20695145--20695301
42
3.7
42
81
0
170
45
16
21
16
1.85
20695143--20695300
63
2.5
63
75
0
163
44
17
22
16
1.87
20695764--20695812
23
2.1
23
96
0
89
34
14
0
51
1.43
20695752--20695825
23
3.5
21
82
13
82
39
12
0
48
1.41
20697259--20697302
6
7.3
6
78
0
52
2
45
0
52
1.13
20697338--20697680
149
2.3
150
84
6
455
41
11
3
43
1.58
20710870--20710998
29
4.5
29
94
2
217
33
25
11
29
1.91
20710870--20710998
57
2.3
58
93
2
217
33
25
11
29
1.91
20710870--20711026
57
2.7
58
88
3
194
33
26
11
28
1.91
20718781--20718937
29
5.5
29
88
3
212
33
25
12
29
1.92
20718781--20718937
57
2.7
58
88
3
221
33
25
12
29
1.92
20722897--20722998
42
2.4
43
81
6
118
31
24
17
26
1.97
20730158--20730297
43
3.3
41
79
12
140
27
25
20
26
1.99
20736762--20736786
7
3.6
7
100
0
50
16
16
12
56
1.68
20737116--20737223
41
2.7
39
76
9
101
32
25
16
25
1.96
20744656--20744791
67
2.0
67
100
0
272
41
17
4
36
1.70
20745822--20745870
22
2.1
24
85
7
66
40
2
2
55
1.23
20745822--20745867
23
2.0
22
83
4
56
39
2
2
56
1.24
20745855--20745900
15
2.9
16
77
9
58
32
0
0
67
0.91
20745855--20745919
23
2.8
24
81
13
73
35
0
0
64
0.94
20745871--20745919
25
2.0
25
88
8
73
36
0
0
63
0.95
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
20747733--20747900
53
3.2
54
79
8
159
25
25
16
33
1.96
20762450--20762625
53
3.3
52
74
13
153
25
22
17
35
1.95
20762491--20762642
54
2.9
51
78
10
155
25
21
17
36
1.94
20769862--20769915
26
2.2
25
83
9
67
48
0
1
50
1.11
20769883--20769927
23
2.0
23
81
0
54
48
0
2
48
1.13
20771323--20771384
30
2.1
30
96
0
115
24
33
20
20
1.97
20778907--20778946
21
1.9
21
85
10
55
27
12
2
57
1.48
20784310--20784378
28
2.5
28
83
4
86
33
23
13
30
1.92
20795730--20795847
20
5.8
20
82
5
114
20
1
1
76
0.96
20795732--20795847
13
8.9
13
73
23
93
20
1
1
75
0.97
20795730--20795845
8
14.9
8
76
22
97
20
1
1
75
0.97
20795739--20795852
54
2.2
52
90
4
176
20
1
2
75
1.01
20810933--20810970
19
2.0
19
94
0
67
15
39
23
21
1.92
20816760--20816808
23
2.1
23
96
0
89
55
0
8
36
1.30
20819022--20819097
22
3.7
21
76
15
68
40
17
6
35
1.75
20819058--20819145
19
4.8
19
90
8
146
36
15
11
36
1.84
20819058--20819145
35
2.4
37
88
9
135
36
15
11
36
1.84
20819072--20819127
17
3.5
15
88
9
60
35
16
10
37
1.83
20819503--20819756
44
5.7
45
90
0
334
27
29
11
31
1.92
20819801--20820329
78
6.8
78
88
0
727
25
23
17
33
1.97
20820432--20820767
44
7.6
44
87
3
462
29
28
13
28
1.94
20825144--20825274
27
4.9
27
88
0
181
29
21
8
40
1.82
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
20825252--20825472
27
8.2
27
77
9
159
42
22
7
28
1.80
20825171--20825302
54
2.4
54
81
2
149
33
21
7
37
1.82
20825152--20825300
81
1.8
81
81
2
183
32
19
8
39
1.81
20825252--20825555
54
5.6
53
74
10
211
40
21
8
29
1.83
20825131--20825312
81
2.2
81
73
1
177
35
21
7
35
1.81
20825266--20825472
80
2.6
80
78
9
215
43
21
7
28
1.79
20825588--20825652
27
2.4
27
92
0
112
38
20
24
16
1.93
20826455--20826602
26
5.8
26
89
2
221
25
22
24
28
1.99
20826455--20826602
51
2.9
52
87
4
221
25
22
24
28
1.99
20826747--20826838
42
2.2
42
92
0
148
29
14
21
34
1.93
20826862--20826938
31
2.5
31
93
2
138
32
18
22
27
1.97
20830956--20831031
22
3.7
21
76
15
68
40
17
6
35
1.75
20830992--20831082
19
4.9
19
88
8
143
36
16
9
37
1.82
20830992--20831082
35
2.5
37
87
8
132
36
16
9
37
1.82
20831006--20831061
17
3.5
15
88
9
60
35
16
10
37
1.83
20832019--20832116
41
2.4
41
94
0
178
31
15
23
29
1.95
20835094--20835131
19
2.0
19
85
10
51
44
15
0
39
1.47
20839540--20839618
39
2.0
39
85
0
104
26
3
21
48
1.67
20843395--20843419
11
2.3
11
100
0
50
92
0
8
0
0.40
20852830--20852870
12
3.4
12
82
0
55
26
9
17
46
1.79
20868622--20868676
12
4.7
12
75
25
55
50
1
0
47
1.11
20868609--20868663
15
3.9
14
81
15
69
47
1
1
49
1.23
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
20868645--20868681
10
3.7
10
85
0
56
54
0
0
45
1.00
20868683--20868802
55
2.1
59
86
6
167
46
0
0
51
1.12
20868976--20869032
16
3.6
15
81
6
60
31
21
3
43
1.69
20869827--20869866
20
2.0
20
85
14
55
45
0
0
55
0.99
20872244--20872294
18
2.8
18
88
5
68
5
37
0
56
1.23
20879064--20879089
13
2.0
13
100
0
52
15
23
15
46
1.83
20892239--20892502
94
2.8
94
82
9
304
27
19
29
23
1.98
20892239--20892500
142
1.8
142
85
4
368
27
19
29
23
1.98
20892239--20892500
46
5.5
47
76
9
246
27
19
29
23
1.98
20894849--20894948
50
2.0
50
94
0
173
38
14
21
27
1.91
20898186--20898210
7
3.6
7
100
0
50
48
0
0
52
1.00
20902161--20902336
46
3.8
46
75
12
171
21
20
28
30
1.98
20903392--20903420
13
2.1
14
93
6
51
55
10
6
27
1.59
20908044--20908219
46
3.8
46
76
10
187
21
20
28
29
1.98
20908040--20908212
93
1.9
93
95
0
310
21
20
29
28
1.98
20912136--20912236
53
1.9
53
89
0
157
34
13
25
25
1.93
20912353--20912534
57
3.2
56
79
4
159
32
15
21
29
1.95
20912404--20912502
28
3.5
29
74
9
87
30
17
26
26
1.97
20912424--20912566
57
2.5
57
82
1
153
38
15
18
27
1.91
20912431--20912549
29
4.2
29
73
7
93
36
15
21
26
1.93
20916010--20916060
23
2.2
23
93
6
86
15
19
29
35
1.93
20918935--20918985
26
2.0
26
96
0
93
17
11
23
47
1.81
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
20923304--20924286
120
8.2
120
98
0
1867
43
2
5
47
1.41
20923875--20923909
18
2.0
17
88
5
52
45
0
0
54
0.99
20924115--20924149
18
2.0
17
94
5
61
42
0
0
57
0.99
20924505--20924573
16
4.2
16
90
3
111
37
36
1
24
1.65
20924505--20924573
33
2.1
32
91
2
111
37
36
1
24
1.65
20928714--20928802
27
3.3
27
85
1
108
35
15
21
26
1.94
20929534--20929593
27
2.3
26
82
2
66
23
21
20
35
1.96
20931721--20932016
42
7.0
42
83
5
362
30
14
23
31
1.95
20931726--20932018
85
3.5
84
83
3
374
29
14
24
31
1.95
20931722--20932012
127
2.3
127
93
0
492
30
14
24
30
1.95

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
          81   82   83   84   85   86   87   88   89   90   91   92   93   94   95   96   
          97   98   99   100   101   102   103   104   105   106   107   108   109   110   111   112   
          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
          193   194   195   196   197   198   199   200   201   202   203   204   205   206   207   208   
          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   326   327   328   329   330   331   332